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文献检索与临床信息系统主讲教师:侯筱蓉(hxrhelen@163.com)医学信息学院卫生信息管理与决策教研室据《science》2011年2月报告,人类社会的信息储存量每18个月就会翻一翻(新的摩尔定律)信息时代我们面临的挑战“在十年之内,作为医学生你们学到的一半知识都会被证明是错误的;而且麻烦的是没有老师能够告诉你们哪一半是错误的。”(CharlesSidneyBurwell)必须能够快速了解科学发展的前沿,全面把握整个领域的发展格局,才能适应前沿的科学研究。信息时代我们面临的挑战2013年8月,我校第二临床学院2009级本科生叶海波同学喜获中国青少年科技创新奖2013年10月,我校2009级预防医学专业陈江鹏等4名同学荣获“挑战杯”全国三等奖当你觉得自己的想法很创新时,十有八九是知识面太窄。——iceblues什么是创新?本课程目的信息的获取能力;信息管理能力;信息分析和利用的能力。我们如何应对挑战??知道自己要什么;知道从哪里获取文献;如何管理?如何分析?我们应该具备的能力:整个信息素养培养教学、文献检索的课程,围绕着信息的获取、检索分析、利用、研究而进行医学文献检索的学科性质医学文献检索(MedicalLiteratureRetrieval)是一门以培养医学生的信息意识、掌握用手工或计算机方式从文献中获取知识和科技情报信息的工具性课程,是培养人们独立学习能力的一种专门知识。目的是传授如何在知识的汪洋大海中获取所需目标知识,即学会查找文献,最终使文献为我所用,也是继续学习、提高自我的有效途径。文献检索的意义培养良好的信息素养解答生活和工作中的疑问为参加工作或研究生阶段的科学研究与文献阅读打下基础。跟踪学术最新动态有助于科研创新节省科研时间,提高工作效率避免无效重复研究熟悉医院医疗流程查询资料科研、教学等课程组成如何学好本课程理论学习实践操作总结和反思了解各种文献信息来源和检索原理与技术熟练使用检索工具对检索效果进行判断和评价多思考多使用多总结教学内容目录(Content)第一章检索基础第二章搜索引擎第三章图书资源检索第四章第1节中国生物医学文献服务系统+1次实习第四章第2、3、4节维普及其它中文数据库+1次实习第四章第六节PubMed+1次实习第十章文献利用与管理第十一章临床信息系统最后两次为综合实习上课地点:理论课——教室实习课——A1学生机房网络教学平台中国生物医学文献数据库内容基本概念1检索工具2检索技术3本次课小结4文献检索(LiteratureRetrieval):利用检索工具,准确、全面地查询与特定研究课题有关的文献资料的过程就是文献检索。基本概念—文献检索1平时阅读积累:专业书、刊、报纸、电视、广播、Internet3集中检索获取(主要方式):利用检索工具定期或不定期检索2同行交流:会议、讨论4定题服务:新的获取文献信息的方式获取文献的方式针对特定课题,提供最新文献的一种服务方式,其服务手段包括:(1)检索获取最新文献服务:图书馆针对专业用户的服务方式(2)RSS服务:一些网站的个性化服务、邮件订购:如我的yahoo!,我的图书馆、Google快讯、myncbi等方式(3)其他:如丁香园论坛、小木虫等。定题服务思考:你认为什么是文献?你用过哪些类型的文献?基本概念--文献文献:记录有知识的一切载体的统称。即用文字、图像、符号、声音、音频、视频、编码等手段记录的人类知识的各种载体。常用的文献分类标准:按载体形式来分按出版形式分文献及其种类(1)印刷型文献(2)机读型文献:需要借助一定的机器设备方可阅读的文献。①缩微型文献②视听型文献③数字化文献印刷型和数字化型是主要的文献载体形式按载体形式分(1)图书(Book):50页以上的以印刷方式或其他方式单本刊行的出版物。包括专著、汇编本、多卷本、丛书等按出版形式分(2)期刊(Periodical):以印刷形式或其他形式逐次刊行的,通常有数字或年月顺序编号,并打算无限期地连续出版下去的出版物。按出版形式分(3)会议文献(Proceeding):在各种学术会议上发表的论文、报告及其他有关资料。特点:内容新颖,及时性强;学术水平高,专业性强,可靠性高,一般是学科关注的热点和发展前沿按出版形式分(4)学位论文(Dissertation):高等院校或研究机构的学生为获取某种学位而撰写的学术论文。按学位的不同分为学士论文、硕士论文和博士论文特点:内容比较系统、完整、详细;具有学术性和独创性;部分有保密性。按出版形式分(5)政府(组织)出版物(GovernmentPublication):政府部门及其所属机构所颁发出版的文献。按出版形式分(6)专利文献(Patent):是专利制度的产物,广义上是指所有与专利有关的资料。狭义上的专利文献仅指专利说明书特点:内容新颖、技术性强、实用性强并具有法律效力等,是寓技术、法律和经济于一体的带有启发性的一种重要文献信息。按出版形式分(7)标准(StandardLiterature)(8)报纸(Newspaper)(9)科技报告按出版形式分一次文献:即原始文献,通常指作者的原始创作。专著、期刊论文、学位论文、研究报告、会议论文、专利说明书等都属于一次文献。二次文献:通称检索工具。题录、目录、索引、文摘等属于二次文献。三次文献:一般是在广泛利用二次文献的基础上,选用大量的一次文献,经过阅读研究、并浓缩提炼而成。如:年鉴、进展、述评、综述等。按文献所含知识的加工层次可分为三级文献的级别零次文献(灰色文献):未公开发表的文献。以前始终有同学在排斥对文献类型、文献级别的学习,但你们是否知道:如果你不对文献类型和文献级别有一定的了解,那么你面对的海量信息将会使你如身陷沼泽般难受。数据和大数据的区别?如果你要做一个关于干细胞的讲座,会涉及国家最新政策、最新临床研究进展,你要怎么去查?数据录入检索文献归纳总结综述找出原始文献描述排序标引匹配检索语言分析排序检索信息资源标识信息特征信息需求标识信息特征分析检索工具(信息检索系统)控制检索工具一个检索系统可以统容纳多个数据库,可以同时对多个数据库进行检索,也可以仅对一个数据库进行检索。一个数据库也可以在不同检索系统中运行。二者都是检索工具不可或缺的一部分。我们这里所说的检索工具主要是指面向读者使用的部分,其实检索工具的形成与使用还需要包括数据的存储与检索两部分。检索工具对信息的外表特征(标题、作者等)及内容特征进行描述及排序,使之有序化的过程,是检索的基础前提。信息组织方法:分类:《中国图书馆分类法》主题:•主题词(人工语言):《医学主题词表》(MedicalSubjectHeadings,MeSH)•关键词(自然语言)信息组织R1预防医学、卫生学2中国医学3基础医学4临床医学R551造血系疾病5内科学552血液疾病55血液系疾病554出血性疾病6外科学56呼吸系疾病556贫血病71妇产科学57消化系疾病556.6溶血性贫血72儿科学58内分泌疾病557白细胞疾病73肿瘤学74神经病学与精神病学75皮肤病学与性病学76耳鼻咽喉科学77眼科学78口腔科学79外国民族医学8特种医学9药学R51传染病52结核病53寄生虫病54心血管疾病R医药、卫生《中图法》R大类1.按出版形式分:书本式和机读式2.按收编类型、范围分3.按著录格式分(1)目录(Catalog)(2)索引(Index)(也称题录)(3)文摘(Abstract)检索工具的种类重庆医科大学精品课程题录:指检索工具所著录的篇名、著者(可有工作单位和地址)、出处(论文原刊载的刊物名,出版年,卷期页)、语种等项目,不包括文摘。检索工具的种类数据库记录格式与手工题录的关系《中目(医药卫生)》2002303047自体血小板回输对体外循环下先天性心脏病患者术后出血量的影响/韩威力…(中国人民解放军第117医院胸心外科)//中华医学杂志,2002,83(13):926-927检索工具的种类CBM流水号:2002303047分类号:R457.1;R619.105;R654.1标题:自体血小板回输对体外循环下先天性心脏病患者术后出血量的影响著者:韩威力;陈如坤著者单位:中国人民解放军第117医院胸心外科参文数:6出处:中华医学杂志2002.07.10;82(13):926-927ISSN:0376-2491国内代码:11-2137/R内部代码:Z84出版地:北京主题词:手术后出血/*治疗;*输血,自体;体外循环;心脏缺损,先天性/*外科学特征词:人类文摘(摘要)以简明扼要的文字介绍文献主要内容。检索工具的种类计算机检索的基本技术计算机检索的查寻过程实际上就是将用户的检索提问与数据库的检索标识相比较决定取舍的过程,两者比较结果相一致者即为命中。命中的中间结果可以再次与新的提问式相比较匹配。一个检索课题通常经过如此多次的修饰匹配检索,直至最终命中检出的文献符合用户的需求。在这个查寻过程中,主要采用以下几种基本检索技术。布尔逻辑检索截词检索字段限制检索位置检索逻辑与计算机运算符为:AandB或A*B逻辑与是指检索结果应同时满足两个和多个检索概念,即在命中结果中同时出现A和B两个检索词,黑色部分即为命中结果。基本技术—布尔逻辑检索eg:HIVand结核分枝杆菌或者HIV*结核分枝杆菌基本技术—布尔逻辑检索逻辑或计算机运算符为:AorB或A+B逻辑或是指命中结果无论论及A或B均为命中,图示划线部分即为命中结果。eg:艾滋病or获得性免疫缺陷综合症或者艾滋病+获得性免疫缺陷综合症逻辑非计算机运算符:AnotB或AandnotB或A-B逻辑非是指一个命中结果中去除含有另一主题的文献。AnotB表示在A文献中去除论及B的文献的文献。运算优先级?基本技术—布尔逻辑检索eg:结核分支杆菌notHIV或者结核分支杆菌andnotHIV或者结核分枝杆菌-HIV重庆医科大学精品课程截词(Truncation)检索:就是把检索词截断,取其中的一部分片段,再加上截词符号一起检索,计算机按照词的片段与数据库里的索引词对比匹配,凡包含有这些词的片段的文献均被检出。多用于英文检索。截词方式有右(后)截词、左(前)截词和中间截词(插入)截词三种。截词符号有问号?、星号*、井字符#等。右(后)截词是使用最多的一种截词检索方式。eg:肺结核:tuberculosis右截词:tuber*左截词:*berculosis中间截词:tu*culosis基本技术—截词检索字段限制检索:指定检索提问在特定字段中出现,只有在指定的字段中出现与检索提问相同的记录才被检索出来。一般形式:选择字段,输入关键词进行限定;或直接输入字段符号和检索词进行限定不同数据库有不同形式。“提问”[字段名]HIFU[TIAB]基本技术—字段限制检索位置检索是对检索词在原始文献中相对位置的限定性检索,不同数据库位置检索的语法不尽相同。基本技术—位置检索(一)对欲检索课题进行分析*弄清课题学科属性、专业范围及其相关内容;弄清课题的信息类型和时间要求;考虑课题特殊要求;明确用户自身的信息需求(二)选择检索工具*了解各检索工具的收录范围、检索途径等。(三)选择检索途径,确定检索标识*运用检索语言,对课题进行准确全面的标引(四)优化检索策略,查找文献线索(五)索取原始文献文献检索的步骤!!检索工具的学科范围检索入口有哪些检索语言标引(主题词、分类语言、自由词等)数据记录的格式检索结果的处理方式特色重庆医科大学精品课程如何选择检索工具重庆医科大学精品课程查全率=被检索出相关信息量/相关文献信息总量(%)查准率=被检索出相关信息量/被检出信息总量(%)检索结果的评价1、基本概念:文献、文献检索2、文献分类、分级3、计算机检索的基本技术4、文献检索的基本步骤本次课程的要点查找近五年来重庆大学关于内窥镜方面的博士学位论文查找由重庆医科大学为作者单位发表的关于糖尿病方面
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