CCDC、ICSD-简介

CCDC、ICSD的使用杨琛2010.10.12•简介CCDC(CambridgeCrystallographicDataCentre)•位于英国剑桥大学的剑桥晶体数据中心，自1965年起就从事晶体数据的收集、整理与计算机化工作。•CCDC通过Internet提供各种有关的信息。其中包括对CCDC及产品的介绍，新闻的发布，在线帮助(主要产品的介绍和使用手册等)，其网址是CSDS(CambridgeStructuralDatabaseSystem)•CSDS建立在CCDC，是基于X光和中子衍射试验唯一的小分子及有机金属分子晶体的结构数据库。•收集了自1935年以来的二十九万种有机金属化合物的结构信息，包括了普通有机化合物，有机金属化合物和金属配位化合物等三大类别。其中三维空间原子坐标信息的约有260000种。•有80％以上的是1980年以后发表的最新测定的结果。•CSDS每年有两次数据更新，用户可以从CCDC的网页上下载新的数据：•CSDS包括1.CSD:是CSDS的核心，目前CSD收集了约47.5万分子结构，并以每年9%的速度进行增长。随着实验方法的进步，新装入数据的质量越来越高，超过91%的数据拥有小于0.05的R值。2.ConQuest:用于从CSDS搜索和提取结构信息的基础软件。该软件提供在CSDS中全方位的文字与数字查询，同时还具有更高级的搜索功能：化学亚结构的搜索、几何结构的搜索、分子间和分子内相互关系的搜索。3.PreQuest:可方便用户构建自己专用的晶体结构数据库，然后可对该数据库用ConQuest独立或与CSD相结合进行搜索。4.VISTA:是一个互动的分析与统计软件，可阅读用户自定义的几何数据和其它通过ConQuest从CSD中提取的数字信息。5.Mercury:提供了一整套丰富的软件工具用于显示及比较晶体与分子结构，从而探索分子网络与晶胞堆积。6.Mogul:可迅速地从CSD中几百万个各类化学键长，键角和非环扭转角数据中提取信息以便快捷地显示分子的几何结构。7.IsoStar:对收集在CSD和PDB实验数据库中的非键相互作用的几何参数信息进行快速访问。CSD•包括数据和软件两大部分。目前CSD每年大约增加一万个化合物。•CSD包括功能完整的应用软件，它不仅具有数十种查询化合物的方法，还提供了分子结构信息统计方法和三维图像演示方法，以帮助研究人员寻找、观察、分析和总结有关的化合物信息。用户可根据化合物名称、分子式、元素、空间群、单胞、Z值、原始文献、作者、实验条件等项目进行检索CCDC使用晶胞检索（UnitCell）•是否ReducedCellSearch•R值•LatticeTypeCCDC使用例子1：检索是否有晶胞参数为a=17.4774,b=9.7754,c=7.4791,=90,=108.76,=90的晶体。CCDC使用化学式检索（formula）•高氯酸乙酰胆碱，C7H16N1O2,Cl1O4，选allmoleculesinstructureaddedtogether,C7H16N1O6Cl1•含有不止一个分子，分两次检索，然后合并例如，C6H5N2O3,H2O1CCDC使用元素检索（element）•samemolecule，samecrystalstructure，通常选samemolecule•高氯酸乙酰胆碱，(C7H16NO2,ClO4)•HeaviestpermittedelementinFormulaUnit•元素族符号CCDC使用4B=Ti,Zr,Hf结构检索（draw）•键、原子、环•模板•Edit•非键作用力（分子间、分子内）CCDC使用作者/期刊检索（Author/Journal）•作者姓名，Exactsurname•期刊名最好从下拉框中选，期刊改名•期刊的卷、页码有时带字母•年份可以选择范围•CCDC号CCDC使用化合物名称检索（CompoundName）空间群检索（SpaceGroup）实验条件检索（ExperimentalDetails）3D结构检索CCDC使用筛选检索条件（Fliters）合并检索（CombineQueries）保存检索结果（cqs、pdf、cif等）CCDC使用ICSD简介ICSD(InorganicCrystalStructureDatabase)•德国无机晶体结构数据库，从1913年开始出版。收录自1913年以来合成的无机化合物晶体结构(含原子坐标)，主要是金属与金属间化合物。每年更新2次，每次增加约2000个条目，所收集的化合物是剑桥结构数据库和金属数据库中没有的。•产品由以windows为基础的PC版，也有网络版和Unix/Linux，也可以通过STN访问。•网址是。ICSD使用化学元素查询晶体数据查询ICSD使用立志楼一楼Email:[e-mail]:8370534813705003157谢谢！