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软件论文关于软件论文:EpiInfo软件与Epidata软件的比较摘要:EpiInfo软件和Epidata软件是流行病学研究中常用的工具软件,首先简要回顾其各自的开发历史,继而对两者进行比较,最后结合讨论提出软件使用建议。在商业软件占垄断地位的今天,免费软件Epidata和EpiInfo都得到了广泛应用,虽然它们沿着不同的方向发展,但都满足了解决现实问题的需要,在使用时有必要将两者结合起来。关键词:EpiInfo软件;Epidata软件;现场调查;数据录入0引言上世纪80年代以来,公共卫生领域的研究内容和研究方法有了长足的进步,人们愈来愈认识到,仅靠微生物检验解决不了流行病学的诸多问题。一些大型的流行病学研究,如美国心脏协会(AHA)从上世纪中期启动的弗明汉心脏研究,从最初的队列到子代队列,时间跨度近半个世纪,研究成果推动了流行病学、卫生统计学、社会医学等多门公共卫生学科的发展。这些大型研究对实验设计、数据质量、统计学方法及工具软件提出了更高的要求。EpiInfo软件和Epidata软件是流行病学研究中常用的工具软件,且都是免费软件,两者有着密切的关系。它们究竟是什么关系?各自的优势是什么?兼容性如何?国内目前没有相关报道。本文首先简要回顾各自的开发历史,继而对两者进行比较,最后结合讨论提出使用建议。1EpiInfo软件在应用需求的驱动下,美国疾控中心(CDC)的一组人员于1985年前后开始研发Epiinfo,旨在支持疾病暴发的现场调查。自1986年第1版发布以来,Epiinfo很快得到了世界范围内流行病学专家及公共卫生专家的认可,版本不断更新。2001年,CDC发布了DOS操作系统下最后的一个版本:EpiInfo6.04d。EpiinfoDOS包含了一系列子程序,如EPED(定义数据库结构及生成录入界面)、ENTER(录入数据)、CHECK(录入质量控制)、ANALYSIS(分析)。这些程序功能强大,可以在短时间内建立起高效实用的数据库来支持数据录入及分析,满足了疾病暴发现场调查对时间性的要求。上世纪90年代末,为了适应MicrosoftWindows系统及微型计算机的普及,CDC于2000年开发出了EpiInfo2000(EpiInfo3)forWindows,EpiInfo3有很多不同于EpiInfoDOS的地方:首先,数据库不再采用过去简单的ASCII格式,而是启用Access数据库格式,这提高了该软件与“工业标准”如MicrosoftOfficeAccess2003的兼容性,但也失去了一些实用的功能,如快速创建问卷、在多个变量间建立核查命令等。使用的速度也有所降低,这不利于疾病暴发的现场调查。其次,EpiInfo3在数据分析方面的能力有了极大的提高,引入了Cox比例风险模型、多元Logistic回归等多种计算模块,并增加了绘图功能。由于EpiInfo3没有继承EpiInfoDOS的一贯的风格,特别是简单、易上手的的特性,致使从熟练的EpiInfoDOS的操作者到EpiInfo3的操作者,还需要经过培训和学习。2Epidata软件随着视窗类软件的应用,很多用户觉得使用“DOS”系统下的EpiInfo(1990-1995年间开发的版本)很不方便,而商业软件又不专注于数据的管理、操作的简化以及双录入数据的核查。丹麦的JensM.Lauritsen决定开发一套新的软件,起初是作为Funen县“InitiativeforAccidentPrevention”项目的一部分。1999年末,JensM.Lauritsen和MarkMyatt、MichaelBruus建立起了合作关系,成立了非赢利组织EpiDataAssociation,并于2000年发布了第1版的Epidata。Epidata的设计思想起源于EpiinfoDOSversion6,继承了它的文件结构和设计原则,将其应用于Windows系统,设计时着眼于Epidata在定义问卷结构及数据录入质量控制方面的能力。Epidata的设计思路是:通过简单的文本来定义数据库结构(QES文件),然后将其转化为录入界面(REC文件),最后通过对录入设置严格的条件(CHK文件)来进行质量控制。定义问卷结构时,可直接拷贝文字处理软件如MircosoftWord里的内容到QES文件,略加修改后即可应用,可以在编辑器(Editor)里对变量批量设置CHECK命令,极大地提高了工作效率。Epidata在数据分析方面的能力很弱,仅能进行一些简单的描述性统计。3比较EpiInfo软件和Epidata软件目前常用的版本分别是TM3.5.1和Epidata3.1,它们基本特征和不同之处的比较分别参见表1和表2。4结束语Epidata3.1和EpiInfo3都是从EpiinfoDOSversion6发展而来,Epidata继承了EpiinfoDOSversion6的功能、流程和界面,可以在疾病暴发时快速建立录入数据库。从2001年起,EpidataAssociation开始开发EpidataAnalysis,并于2005年9月发布了EpidataAnalysis第1版,弥补了它在统计分析、绘图方面的不足,结合EpidataAnalysis,Epidata系列软件可基本满足流行病学现场调查的需要。EpiInfo3后来发展成为支持流行病学整体研究的综合软件,统计分析、绘图能力大大提高,功能不仅仅限于支持疾病暴发现场调查。英国GKafatos等人指出:Epidata3.1与EpiInfo3同出一源,但沿着不同的方向发展,Epidata3.1更像是EpiinfoDOSversion6的继承者。孰优孰劣,不能贸然判断,两种方向都是必要的:在创建问卷的简易性方面,Epidata3.1具有优势,而在分析处理混杂因素时,EpiInfo3要强大得多。我国举行的第三次卫生服务调查后期的数据录入中,Epidata软件逐渐得到了专家们的认可,大有后来居上之势。总之,EpiInfo软件和Epidata软件的各有所长,且兼容性较好。在使用中要注意以下几点:(1)Epidata适用于大型流行病学调查中数据的录入和管理。如果数据量较小(样本量<100,变量数<30),使用Epidata虽然能提高录入质量,但不一定能提高工作效率,此时可考虑使用EXCEL来录入数据。如果数据量小但需要进行专业流行病学分析及建模的话,建议直接使用EpiInfo软件来实现数据的录入、管理、分析。(2)数据量较大时,可先利用Epidata3.1的优势建立录入数据库录入数据,进行录入的质量控制,在定义QES文件时,要把变量格式设置成EpiInfo能识别的格式。(3)数据录完及逻辑查错结束之后,可结合EpidataAnaly-sis进行一些初步的分析,或者导出其他格式的数据由相应的统计软件分析,同时也可以使用EpiInfo3来读取Epidata3.1的REC数据库来进行深入的流行病学分析。在商业软件占垄断地位的今天,免费软件Epidata和EpiInfo都得到了广泛应用,虽然它们沿着不同的方向发展,但都满足了解决现实问题的需要,在使用时有必要将两者结合起来。参考文献:[1]PALMERSR,Epidemiologyinsearchofinfectiousdiseases:meth-odsinoutbreakinvestigation[J].JournalofEpidemiologyandCom-munityHealth,1989(12).[2]TRUETTJ,CORNFIELDJ,KANNELW.AmultivariateanalysisoftheriskofcoronaryheartdiseaseinFramingham[J].J.chron.Dis,1967(4).[3]WILSONPWF,D'AGOSTINORB,LEVYD.Predictionofcoronaryheartdiseaseusingriskfactorcategories[J].Circntation,1998(5).[4]MAJ,OTTENM,KAMADJEUR,etal.Newfrontiersforhealthinfor-mationsystemsusingEpiInfoindevelopingcountries:structuredap-plicationframeworkforEpiInfo(SAFE)[J].IntJMedInform.2008(4).[5]DEANAG,DEANJA,COULOMBIERD,etal.EpiInfo,Version6:AWord-Processing,Database,andStatisticsProgramforPublicHealthonIBM-compatibleMicrocomputers[C].CentersforDiseaseControlandPrevention,Atlanta,Georgia,U.S.A,1995.[6]KAFATOSG,VERLANDERN,GELBD,ARNOLDE,CHARLETTA.Acomparisonofpublicdomainsoftwareforoutbreakinvestiga-tions:EpiInfoandEpiData[J].EuroSurveill,2007(2).
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