vector-nti-11--使用教程---第六章-限制切位分析

第六章限制酶切位分析35第六章　限制酶切位分析在NTI主程序中，用户可以针对序列的限制酶切位和切割后的片段进行分析(图6.1)。在主程序中，开启上方Analysis选项进入RestrictionAnalysis：图6.1限制酶切位和切割后的片段分析　在RestrictionSites的选项中用户可以设定欲分析的限制酶：图6.2利用RestrictionSites选项设定欲分析的限制酶VectorNTI教育训练手册36　在窗口的左边是程序默认的限制酶(图6.2)，欲进行调整可以点选Remove或是RemoveAll移除。若要新增限制酶可以点选Add增加：图6.3选取数据库中所要的限制酶　选取欲分析的限制酶后按OK(图6.3)，在RestrictionSites窗口下再按一次OK就可以进行分析了：图6.4选取的限制酶，分析产生的结果　使用者可以看到图谱和序列窗口都会显示用户加入的限制酶，并且都注明了剪切的位置；在文字窗口(图6.5)打开文件夹，可整理每种限制酶的切位位置：第六章限制酶切位分析37图6.5文字窗口所显示的各种限制酶切位位置RestrictionFragments(图6.6)：点选此项目可以分析剪切出来的片段大小：图6.6选择欲分析的片段进行分析　选择想要分析的限制酶按OK：VectorNTI教育训练手册38图6.7于文字窗口可以看到所分析的结果　在文字窗口(图6.7)就可以看到分析的结果。RFLP：这个项目可以比较分析同一限制酶对不同序列切出来的片段数目(图6.8)：图6.8利用RELP比较分析同一限制酶对不同序列切出来的片段数目第六章限制酶切位分析39　左边的项目为其他的序列（可复选），这些序列数据是已经内建或是储存在LocalDatabase中，用户可以在Subset项目中转换数据。右边的字段可以选择限制酶（可复选）。选择好之后按下Calculate程序就会显示分析后的结果(图6.9)：图6.9利用RELP显示出所选取的分析结果　　窗口中CreateGel的项目往后会再进一步介绍。FindCommonNon-CuttingEnzymes(图6.10)：这个项目可以帮用户分析哪些限制酶不会对序列进行切割：图6.10使用FindCommonNon-CuttingEnzymes　左边的窗口可以选择序列（可复选），右边可以选择限制酶（可复选）。点选完毕之后再按下Start：VectorNTI教育训练手册40图6.11利用FindCommonNon-CuttingEnzymes分析的结果　分析的结果会以一个窗口显示(图6.11)，用户可以按Print打印结果，或是按Save储存。（也可用Camera指令复制到别的档案）　RestrictionReport(图6.12)：这个选项可以把所有限制酶对序列剪切的结果进行统计，这份表格同样可以进行打印、储存和复制：图6.12将所有限制酶对序列剪切的结果进行统计第六章限制酶切位分析41　假设海大顶尖中心研发出一个限制酶TsjI，其辨认剪切的序列是目前市上所没有的，若要放入VectorNTI软件进行分析，用户需先进入到LocalDatabase里面点选左上角的Enzymes选项(图6.13)：图6.13选取Enzymes选项，将新的限制酶加入数据库　接下和建立序列资料的作法一样，使用者可以制作一个新的限制酶的档案(图6.14)：图6.14制作新的限制酶档案VectorNTI教育训练手册42用户在Enzyme/Methylase项目中设定限制酶的辨认序列和切点(图6.15)：图6.15设定限制酶的辨认序列和切点按下确定就可建立好限制酶的数据(图6.16)，用户可以针对此限制酶进行分析：图6.16建好的限制酶资料结果NOTE：限制酶的辨认序列除了A、T、C、G之外还有其他字母，这些字母分别代表：R=AorGY=TorC　W=AorTS=GorCM=AorCK=GorT　H=AorTorC　B=CorTorGV=AorCorG　D=AorGorT　N=AorCorGorT