分子生物学名词解释沈阳农业大学

分子生物学名词解释松弛（relaxed）状态：DNA在水溶液中,构型偏B型状态。DNA以10.5bp/helix为最稳定构型。正超螺旋：小于10.5bp/helix，则其二级结构处于紧缩状态，由此产生的超螺旋为正超螺旋。负超螺旋：大于10.5bp/helix，则其二级结构处于松缠状态，由此产生的超螺旋为负超螺旋。DNA的拓扑异构现象(topoisome):即在保持DNA一级和二级结构不变的情况下，两条单链可以相互缠绕，形成不同的空间构型。拓扑异构体(topoisomer)：具有不同连接数的同一种DNA分子称为DNA拓扑异构体。拓扑异构酶(topoisomerase)细胞内存在着一类能催化DNA拓扑异构体相互转化的酶，称为拓扑异构酶。或者说，能改变DNA拓扑联系数的酶就叫拓扑异构酶。基因:产生一条多肽链或功能RNA所必需的全部核苷酸序列，在遗传学上也称顺反子（cistron）。基因组：指DNA分子所携带遗传信息总和，即指一个细胞所有基因和基因间DNA的总和，称基因组。遗传学定义为：一个物种的单倍体的染色体的数目为该物种的基因组。C值：在真核生物中，每种生物的单倍体基因组的DNA总量是恒定的，称之为C值。着丝点（centromere）：端粒（telomere）：是真核细胞染色体的物理末端,即染色体两端的染色粒。端粒通常由富含鸟嘌呤核苷酸(G)的短串联重复序列组成,伸展到染色体的3′端。反向重复序列（Invertedrepetitivesequence）：又称回文序列（Palindrome）,易形成发夹结构，在DNA双链中可能形成十字形结构。断裂基因（splitgene）：指在真核生物中，大多数编码蛋白质的基因是不连续的，即基因的编码序列之间插入了不编码的序列，称为断裂基因。基因家族：真核生物基因组中有许多来源相同、结构相似、功能相关的基因，这样一组基因称为基因家族。内含子：真核生物体基因内的一种DNA片段,能转录成mRNA,但在翻译前这段mRNA被剪除和降解,一个基因内可有几个长度不等的内含子分隔着外显子(exon),组成断裂基因。外显子：真核细胞基因DNA的一段密码序列。这段序列可转录成RNA,接着被翻译成蛋白质。snRNA：hnRNA：冈崎片段（英语：Okazakifragment）：是DNA复制过程中，一段属于不连续合成的后随链，即相对来说长度较短的DNA片段。复制子（replicon）：一般把生物体的独立复制单位称为复制子。即能启动DNA复制开始的基因组上的DNA顺序，包括复制原点和引发复制的结构基因，以及在其控制下的DNA区段统称为复制子。klenow片断：用枯草杆菌蛋白酶处理可以将DNA聚合酶I水解为一大一小两个片段。较大的C末端片断分子量为68KD，叫klenow片断，具有5′→3′的聚合酶活性和3′→5′的外切酶活性，常用做体外合成DNA的工具酶。切口平移：DNA聚合酶I的5′→3′核酸外切酶活性从5′端切除DNA受损伤的部位，DNA聚合酶I的5′→3′聚合酶活性随即开始工作，使DNA链向3′端延伸，这称为切口平移（nicktranslation）。复制体（Replisome）：在DNA合成的生长点，即复制叉上，分布着各种各样与复制有关的酶和蛋白质因子，它们构成复合物称为复制体。光复活(photoreactivation)：是在可见光(300～600nm)的活化之下，光复活酶(photoreactivatingenzyme，PR)，催化嘧啶二聚体分解成为单体的过程。应急反应（SOS）：许多能造成DNA损伤或抑制复制的处理均能引起一系列复杂的诱导效应，称为应急反应（SOS）。基因转换：一条染色体上特定的遗传基因被同源染色体上的等位基因所替代的非相互重组的现象。拼接重组体(splicerecombinant)：重组体异源双链区的两侧来自不同亲本DNA。片段重组体(patchrecombinant)：重组体含有一段异源双链区，其两侧来自同一亲本DNA。异源双链(heteroduplex):通过DNA单链的侵入和DNA链的同化,被侵入的DNA双螺旋分子上有一段区域含有来自联会对方的一条链,它随着DNA链同化作用的继续进行而逐步扩大,这一区域叫做异源双链。单链同化(assimilation)：即是指单链与同源双链分子发生链的交换，从而使重组过程中的DNA配对、Holliday中间体的形成，分支移动等步骤得以产生。位点特异重组特点：位点特异重组依赖于重组酶（recombinase）和有重组酶识别的一种短的(20-200bp)独特的DNA序列。溶菌（裂解）周期：λDNA独立存在，进行大量复制以产生更多的子代噬菌体，在这种情况下，它最后破坏寄主细胞，释放子代噬菌体；溶原周期：λDNA整合进寄主染色体，随着寄主染色体复制而一代代传下去。整合到细菌DNA中的λDNA被称为前病毒。转座子:是基因组上不必借助同源序列就可以移动的DNA片段，可以由染色体的一个位置（供体位点）转移到另一个染色体或同一个染色体的另一个位置（靶位点），称为转座子(transposon)。插入序列:是最简单的转座子，除转座所需基因外不携带任何标记基因。复合转座子:除转座酶(transposase)基因外还携带各种标记基因，如带有抗药基因，因而易于检测其存在。Shapiro中间体：是一种交叉结构，是指再形成靶部位与转座子连接的中间体。复制型转座：通过复制使原来的位置与新的靶部位各有一个转座子，其一条链是原有的，另一条链是新合成的。复制型转座需要转座酶和解离酶（resolvase）两种酶。非复制型转座：也称简单转座，即从转座子的两端切出转座子，并转座到新的位点，在原位上留下双链切口。只需要转座酶。自主元件（autonomouselement）：具有切割及转座能力，编码有活性的转座酶。非自主元件（nonautonomouselement）：与自主元件同源，只是不同程度缺失了中间序列，从而失去了转座酶功能，不能自发转座或经受其他变化。玉米中的激活－解离系统/Ac-Dssystem(activator-dissociationsystem)：Ac与Ds是属同一家族的控制因子。Ac与Ds同源。Ac是自主元件，Ds是非自主元件，Ds本身不能转座，但有Ac存在时，通过反式转座酶激活而转移到新的位置上。σ亚基：σ亚基可以极大地提高RNA聚合酶对启动区DNA序列的亲和力，其作用是负责模板链的选择和转录的起始。启动子：是指RNA聚合酶识别、结合和开始转录的一段DNA序列。转录单元（transcriotionunit）：是一段从启动子开始至终止子（terminator）结束的DNA序列。转录起点：是指新生RNA链第一个核苷酸相对应的DNA链上的碱基，研究证实通常为一个嘌呤。足迹分析法(footprint）:所谓足迹法是将DNA起始转录的限制片段（启动子区段）分离出来。加RNA聚合酶与之结合。再用DNA酶部分水解。与酶结合的部位被保护而不水解，其余部位水解成长短不同的片段，经凝胶电泳即可检测出酶所结合的序列，再通过测序技术获得DNA序列组成。Pribnow区：又称-10区（TATAAT），有助于DNA局部双链解开。-35序列：又称识别区（TTGACA），提供了RNA聚合酶识别信号。Inr:位于转录起始点的起始子（initiator,Inr），可用同式Py2ANPy5表示之。TATA区:位于转录起始点上游-25~-30bp处的共有序列TATAAA，也称为TATA区。CAAT区:起始点上游-70~-78bp处另一段共有序列GGCCAATCT，称为CAAT区。GC区:起始点上游-80~-110bp处含有GCCACACCC或GGGCGGG序列，称为GC区。增强子:起始点上游-100bp以上处含有72bp长的重复序列，称为增强子（enhancer）。终止子（terminator）：模板DNA上存在终止转录的特殊信号终止因子（terminationfactor）：协助RNA聚合酶识别终止信号的辅助因子（蛋白质），称为终止因子。通读（readthrough）：有些终止子的作用可被特异的因子所阻止，使酶得以越过终止子继续转录，称通读。抗终止因子（antiterminationfactor）：这种引起抗终止作用的蛋白质称为抗终止因子。ρ因子：它通过催化NTP的水解使新生RNA链从三元转录复合物中解离出来，从而终止转录。GT-AG规则：这类内含子的左端（5＇端）均为GT，右端（3＇端）均为AG（对应于RNA为GU-AG）。拼接体（spliceosome）：在被拼接的RNA上，由5种U系列snRNA（U1、U2、U4、U5、U6）和约50种蛋白质所组成的复合物（50～60S），呈有突起的椭球体。RNA的编辑（RNAediting）:mRNA的一种加工方式，它导致了DNA所编码的遗传信息的改变，这种改变mRNA编码序列的方式，叫RNA的编辑。RNA的再编码：编码在mRNA上的遗传信息在某种情况下可以用不同的方式译码，即改变了原来编码的含义，称再编码。校正tRNA:通常是一种变异的tRNA，它们或是反密码子环碱基发生改变，或是决定tRNA特异性即个性的碱基发生改变，从而改变了译码规则，故而使错误的译码信息受到矫正。SD序列：起始密码子:蛋白质合成时编码结合起始子tRNA的密码子AUG。在原核系统,该密码子与N-甲酰甲硫氨酰-tRNA结合;而在真核系统,它与甲硫氨酰-tRNA结合。终止密码子：可以终止翻译过程的密码子(如UAG、UAA或UGA),由于有些蛋白质的合成共用同一个mRNA,故每个蛋白质合成完成后需要一个终止信号,否则会使这些蛋白质连在一起。转录因子：能直接和间接与顺式调控元件起作用而影响基因转录的蛋白质因子。反密码子：每个tRNA的二级结构中都有一个由7个核苷酸组成的小环,环中间的三个核苷酸与mRNA中该tRNA所携带氨基酸的密码互补,称为反密码子。密码子:mRNA上连续排列的三个核苷酸序列,并编码一个氨基酸信息的遗传单位密码子简并性：一个氨基酸由一个以上的三联体密码编码的现象叫做密码子的简并性。其中的密码就叫做简并密码子。同工受体（isoacceptors）;负载同一氨基酸，但识别不同密码子的tRNA摆动假说：在密码子与反密码子的配对中，前两对严格遵守碱基配对原则，第三对碱基有一定自由度，可以“摆动”，因而使某些tRNA可以识别1个以上的密码子。多核糖体:通常一个mRNA分子上，可结合有多个不同时开始翻译的核糖体，这样的结构称为多核糖体。操纵子：指包含结构基因、操纵基因以及启动基因的一些相邻基因组成的DNA片段，其中结构基因的表达受到操纵基因的调控。衰减子：一个或多个结构基因上游的一段DNA序列,其功能是作为转录终止因子提前终止转录。★顺式作用元件：真核生物启动子和增强子是由若干DNA序列元件组成的，由于他们常与特定的工程基因连锁在一起，因此被称为顺式作用元件。★反式作用因子：是能直接或者间接地识别或结合在各类顺式作用元件核心序列上，参与调控基因转录效率的蛋白质。★结构模序：调节蛋白与DNA结合的结构域中，含有与DNA直接特异结合的亚结构，这类亚结构中含有的一个或一组较小的可辨认的有特征性的基团。因此将这些有特征性的亚结构叫做结构模序。