中山大学生物化学辅导班讲义

去年的题型：1．填空30’（30个空）2．判断20’(20题)3．名词解释30’(30个)4．问答70’（10’/题，8选7）复习的思路：划成大块进行串联生物大分子的结构与功能酶学代谢[重点：蛋白质和核酸]§Introduction生化的历史，较新的、重大的事件，例如：PCR发明的时间，dsDNA发现的时间。（对各种重大的历史事件有个基础性的了解）。§1Carbohydrates糖蛋白蛋白聚糖各种基本的概念，基本的功能糖蛋白的连接键的类型，各种糖苷键是如何形成的，哪些是常见的，有何功能糖蛋白中的糖有何生物学意义§2Lipids（注意与生物膜的联系）脂类的功能脂肪酸、脂质体等一些基本概念生物膜的模型与功能一些固定的说法§3Aminoacids基本概念、分类的方法、必需氨基酸、非必需氨基酸的概念氨基酸的主要性质、化学反应（典型的侧链的化学反应）实验技能（联系蛋白质工程）物理性质，光吸收，产生的原因等电点等各种重要的概念§4～6Thestructureandfunctionoftheproteins多肽、蛋白质中涉及到的基本概念、基本结构同源蛋白、α-螺旋、β-折叠等这样的基本概念结构域和超二级结构的特征，有那些？相关的主要蛋白质（典型的蛋白质）：纤维蛋白球蛋白胶原蛋白血红蛋白从这些蛋白质的结构特征中能得出什么结论？（即结构与功能的关系）蛋白质的主要物理、化学性质（例如：变性、复性）蛋白质纯化的方法（与性质有何联系？）§7蛋白质的分离、纯化和表征只要是涉及实验方法的部分一定要重点看各种基本原理、基本方法酸碱性质（等电点，在等电点时有什么性质）分子的大小和形状，相对分子质量的测定方法（各种方法各涉及到些什么性质）分离纯化（只要是涉及实验的部分是重点）§8酶通论化学本质、基本概念——全酶，辅因子基本分类：单体酶、寡聚酶、多酶复合体（与糖的分类相联系）作用特征：高效、专一、活性可调节酶命名的基本方法（六大分类）活力的测定：比活力、酶活单位、活化能（如何测定）核酶、抗体酶§9酶促反应动力学基本概念，例如：Vmax、初速度酶与底物的关系活性中心的概念中间产物学说——米氏方程（米氏常数、公式模型、数量关系、特征性常数代表的意义）通过意义的推理——抑制反应——竞争性抑制非竞争性抑制——不同的表达方程反竞争性抑制（由方程能说出所代表的意思）各种影响因素（如何表达，例如：最适pH与pI的关系等）及各种重要的概念——最适pH值andsoon.§10酶的作用机制和酶的调节基本概念结构与功能的关系活性中心必需基团影响酶催化效率的因素、活性调节的因素酶调节的方式有哪些？（特别强调：从8到10章，不会有大题，但是考的很宽、很灵活。例如：如何调节酶活性？其实是问酶催化的主要模式。此外，这三章涉及到很多的名词解释和概念性的东西，一定要搞清楚。）补充一点酶调节的种类1、别构酶和别构调节正协同效应——S形曲线——齐变模型、序变模型负协同效应——双曲线——序变模型别构调节是细胞内代谢的重要调节方式2、共价酶和可逆共价调节一般引起级联反应，是细胞信号传递中重要的调控方式3、酶原的激活§11维生素和辅酶注意与酶学部分的关联各种维生素或辅酶与代谢过程的联系（本章知识点较多，且很乱，在后面的内容中也多次提到，复习时最好是串联到一起复习，我自己也整理了一个提纲，不过还没完成，搞完后我会传上来的）§12～15核酸组成、各级结构DNA与RNA结构上的差异RNA的稳定性和结构的关系原核生物的基因组与真核生物的区别（还要注意涉及到的各种原核和真核的区别）测序的方法（与基因工程的联系）§36ThesynthesisofRNAanditsprocessingRNA合成的基本过程主要掌握原核的模式§37Geneticcode定义遗传密码的破译过程基本特性§38Thesynthesisandtransportoftheproteins要清楚基本过程特性：方向性（5'～3’）与RNA的比较转录好的RNA蛋白质3’5’DNA(互补链)Replication5’3’DNA(template)Transcription3’5’mRNA（模板链）Translation5’3’protein核糖体、起始因子、延伸因子等基本概念真核生物与原核生物蛋白质合成的差异：部位、核糖体、mRNA、各类因子不同蛋白质的加工（各种概念）:信号肽、多聚核糖体、SD序列等蛋白质合成的准确性与DNA复制准确性的差异（在蛋白质合成中，如果出现错误就可以降解掉）加工中遇到的各种问题：多余的序列（酶原有活性的酶）蛋白质的内含子§39Themetabolismofthecellsandtheregulationsofthegeneexpression细胞代谢调控（网络）酶活性的调节细胞信号传递系统（主要的调控机制）各种概念性的东西经典的调控模式：1.原核细胞中的操纵子模型（乳糖操纵子）阻遏物合成途径操纵子的衰竭子生长速度的调节时序控制翻译水平和反义RNA（1．转录水平的调节1.1乳糖操纵子模型[结构、调控系统][操纵子结构基因调节基因阻遏物组成型基因和组成型突变操纵基因负调控诱导和诱导物正控制系统等的概念葡萄糖效应的机制]1.2色氨酸操纵子[结构、调控系统][辅阻遏物前导肽衰竭子等各种重要概念粗细调节的机制及实验依据]1.3σ因子对基因表达的调控2．翻译水平的调节（涉及到的各种名词解释、机理）2.1稀有密码子对翻译的影响2.2重叠基因对翻译的影响2.3翻译的阻遏2.4mRNA的高级结构对翻译的影响2.5小分子RNA与翻译调控2.6魔斑核苷酸对翻译的影响）2.真核生物基因表达的调节（各概念、机理、影响因素等）（1．真核基因表达调控的特点2．转录前水平的调节2.1DNA修饰调控基因转录2.2染色体结构改变的调节作用2.3DNA水平的调节[基因扩增、重排、丢失]3．转录水平的调节3.1真核基因转录控制的要素3.2转录因子DNA结合功能域的结构特征3.2.1螺旋-转角-螺旋3.2.2锌指结构3.2.3亮氨酸拉链3.2.4helix-loop-helix3.3转录因子活化结构域3.4转录抑制因子的作用模式4．转录后的控制4.1转录后的弱化4.2RNA加工对基因表达的调控4.3RNA的运送5．翻译水平的调节5.1mRNA的稳定性对翻译的影响5.2mRNA5’前导序列对翻译的影响5.3翻译起始因子的磷酸化对蛋白质合成的影响5.4mRNA3’端的结构对翻译速率和mRNA寿命的影响5.5翻译延伸过程对蛋白质合成的影响）增强子沉默子顺式作用因子反式作用因子各水平的调控蛋白质的加工分子间的-S-S-肽链的切除糖基化、甲基化分子伴侣等翻译准确性与？有关：1．错误率（1/10）密码子与反密码子的配对错误率高2．转录过程中的通续性（百分之几）3．移码（10-3～10-4）4．翻译的不完整性（DNA的错配率：10-9）§40Geneticengineering基本原理：DNA克隆载体（基本要求）宿主重要的概念：基因文库cDNA文库宿主细胞的表达系统（真核与原核细胞的优缺点的比较）构建文库的基本原理PCR（定义、原理、分类、主要用途等）基因的定位诱导基因克隆的表达过程等蛋白质工程