动物数量遗传学6

LOGO参数篇第五章近交系数重点提示：本章重点介绍了个体近交系数的概念及其估计方法，群体近交系数的估计方法，连续规则近交（全同胞、半同胞、同一个体重复回交）下的近交系数的估计方法。内容个体近交系数（FX）的概念及其估计方法第一节畜群近交系数（群体近交系数）的估计方法第二节连续规则近交下的近交系数的估计方法第三节近交系数的定义S.Wright将个体X的近交系数（coefficientofinbreeding，记为FX）定义为其双亲所产生的配子间的相关系数。即,g1+g2=XMalécot将个体的近交系数（FX）定义为某一个体的两个相同的等位基因来自于同一祖先的概率。FX=21ggr第一节个体近交系数（FX）的概念及其估计方法由个体X的双亲所产生的配子g到其双亲的共同祖先A所产生的配子g共有n个配子代，而每个配子代的通径系数为1/2个体X的双亲所产生的配子g1和g2的通径关系(n))1(11nggP121n=)2(22nggP221n=由共同祖先A到其所产生的配子的通径系数为：21AFb=FX=21ggr121n21AF221n=···21AF计算任何一个个体的近交系数的通式第二节畜群近交系数（群体近交系数）的估计方法畜群近交系数即整个畜群中每个个体的平均近交系数。畜群近交系数估计方法亲缘协方差表法闭锁小群体近交系数的估计近交的遗传效应分析亲缘协方差表法亲缘协方差（分子亲缘系数）就是亲缘系数的分子，当两个亲缘个体的近交系数均为0时，亲缘协方差（numeratorrelationship）就等于亲缘系数（coefficientofrelationship）。步骤：1、编制一个亲缘协方差表2、从表格中的数据直接算出每个个体的近交系数和两个个体间的亲缘系数举例说明有一畜群由A、B、C、H、E、F、G，7个个体组成，其亲缘关系如图先制一个7×7的表父1(G)1(G)4(H)4(H)6(B)母2(F)3(E)5(C)个体1(G)2(F)3(E)4(H)5(C)6(B)7(A)1(G)10.50.500.250.250.252(F)10.2500.50.1250.31253(E)100.1250.50.31254(H)10.50.50.55(C)10.31250.656256(B)(对称)10.656257(A)1.15625协方差的计算公式由亲缘协方差表直接可算得各个体近交系数（Fi）和任意两个个体间的亲缘系数（rij）:12iiSDiiCovCov2jjiSiDijCovCovCovFi=Covii–1rij=jjiiijCovCovCov对大群体进行近交系数估计时应注意必须随机取样；亲缘协方差表至少需包含随机取样个体的三代祖先；计算平均数时不要把随机取样个体的祖先的系数统计在内，只计算随机取样个体的平均数。闭锁小群体近交系数的估计通常对群体大小的表示方法：a.总个体数b.实际繁殖者个数（可繁殖个体数）c.群体有效含量假设原始群体中无近交个体，这个群体闭锁繁育n代后，群体的平均近交系数为：Fn=1–(1–△F)n近交的遗传效应分析基本遗传效应：①在一定概率上增加群体中纯合子的基因型频率。②近交可以使在杂合子中被掩盖的隐性有害基因纯合，从而使有害基因暴露出来。③随着群体中杂合子频率的降低，数量性状的群体平均非加性效应值（显性偏差和上位偏差）也减小，群体均值随之降低。近交的遗传效应模拟结果世代(t)理论值模拟值近交系数(Ft)杂合子频率(Ht)近交系数（Ft）基因型频率基因频率（AA）（Aa）（aa）（A）（a）00.00000.50000.00000.25000.50000.25000.50000.500010.02500.48750.04560.25000.55000.20000.52500.475020.04940.47530.06920.10000.60000.30000.40000.600030.07310.46340.09370.25000.40000.35000.45000.500040.09630.45180.11690.30000.55000.15000.57500.425050.11890.44050.13980.30000.45000.25000.52500.475060.14090.42950.16150.55000.45000.00000.77500.225070.16240.41880.18310.30000.35000.35000.47500.525080.18330.40830.20390.35000.35000.30000.52500.475090.20380.39810.23160.60000.25000.15000.72500.2750100.22370.38820.24410.95000.05000.00000.97500.0250110.24310.37850.27370.95000.05000.00000.97500.0250120.26200.36890.30261.00000.00000.00001.00000.0000←3→21←4→21←3←→4→21←4←→3→2Fn=]21[41)1()2(nnFF←2→51←2←→4→51←3←→4→51←3←→2←5Fn=]61[81)1()2(nnFF←2←→3→1Fn=]21[41)1(nAFF连续规则近交下各代的近交系数世代全同胞交配（Fs）半同胞交配（Hs）重复回交00.0000.0000.00010.2500.1250.25020.3750.2190.37530.5000.3050.43840.5940.3810.46950.6720.4490.48460.7340.5090.49270.7850.5630.49580.8160.6110.49890.8590.6540.499100.8860.6910.499+、何谓近交系数？其中所谓的遗传相关实际上是指哪一部分的相关？请你详细导出个体近交系数的计算公式。2、用亲缘协方差法计算8个个体的平均近交系数。它们的亲缘关系如下图：3、一个闭锁群体，每代随机留10母（♀）3公（♂），经过5代，估计其平均近交系数达多少？经过50代又达多少？LOGO