80文摘索引型数据库

李春英北京大学医学图书馆2017年1月文摘索引型数据库检索与利用内容提要文摘库概述PubMed文摘索引型数据库概述报道和揭示文献的外部特征（题名、著者、出处、卷期、页码、时间、文献类型、语种），同时对文献的内容进行摘要性描述的检索工具。文摘报道和揭示的一般是单篇文章生物医学领域中外文摘索引数据库美国全科医学文献数据库(Medline)荷兰医学文摘数据库(Embase)美国生物学文摘数据库(BIOSISPreviews)美国化学文摘数据库(SciFinder)美国科学引文索引数据库（SCI）中国生物医学文献数据库（CBM）中文生物医学期刊文献数据库（CMCC）文摘索引数据库特点提供原文的摘要信息摘要信息包括：题目、作者、刊名，或同论文相关信息数据量大，文献类型多、信息量大收录文献回溯年代长收录文献期刊种类多出版形式多样文摘索引数据库使用情况0100000200000300000400000500000600000700000800000900000图文摘和全文数据库使用人次数统计（2005年-2006年10月）系列1109864800484文摘索引数据库电子期刊全文数据库文摘数据库的作用1.可了解和把握某课题领域研究动态和研究现状2.找到全文的重要和必要线索3.判断自己课题的新颖性4.对不熟悉的语种文章，看英文摘要即可5.科研评价（学位）论文选题、开题、课题查新时文献调研的重要途径文摘索引数据库掌握要领1.数据库的概况2.数据库的结构3.数据库的检索界面4.数据库的检索技巧与方法PubMed数据库主要内容1.数据库概况2.数据库检索机制3.数据库的组成结构4.检索界面5.检索方法与技巧PubMed概况1.创建机构：美国国家医学图书馆下设的美国生物技术信息中心(NCBI)2.类型：Web数据库3.网址：特色：具有收录范围广、内容全、检索途径多、检索体系完备等特点，部分文献还可在网上直接免费获得全文。5.学科范围：生物医学、生命科学、行为科学、生物工程、化学等学科。6.与Medline光盘数据库的区别：检索机制、检索界面、检索方法以及收录文献数量不同。PubMed数据来源1.MEDLINE：包括OLDMEDLINE2.InProcessCitations：每天收录，尚未经规范处理的数据。3.Publisher-SuppliedCitations：由出版商提供的电子文献，每条记录标有[PubMed-assuppliedbyPublisher]。PubMed检索机制1．自动截词转换匹配功能(AutomaticTermMapping)对于输入的检索词，PubMed先按一定的词表顺序进行对照匹配和转换，再进行检索。词表匹配转换顺序是：MeSH表(MeSHtranslationtable)、期刊刊名表(Journaltranslationtable)、全体作者表(Fullauthortranslationtable)、作者索引(AuthorIndex)、全体调查者表(Fullinvestigatortranslationtable)、调查者索引(InvestigatorIndex)。如果在以上6个表中都找不到相匹配的词，PubMed将把短语分开，以单词为单位，分别重复以上的过程，检索时各个词之间是AND逻辑关系。2．短语检索(PhraseSearching)也可称为强迫词组检索，即，如果要将短语作为一个词组进行检索，可用双引号“”将其引起来。如：“drugtherapy”作为词组进行检索的词，系统不进行自动转换匹配，也不进行MeSH词的扩检。1.逻辑运算符：逻辑与：AND，逻辑或：OR，逻辑非：NOT。当一个检索表达式中同时含有三个运算符时，运算顺序从左至右，括号可以改变运算顺序。2.截词符：*，一个词或字拼写出部分字母后面加上一个截词符，chem*表示用词根进行检索。Heartattack*会关闭自动转换匹配检索词，myocardialinfarction,myocardialstunning,shock等词3.双引号：“”，表示对引号中的短语进行检索。4.检索字段标识符：[tag]，tag为字段名称。[ti]，[au]，[ta]，[so]，[la]，[pt]。PubMed检索运算符常用字段组成标识符字段名称TITitleAUAuthorADAffiliationABAbstractDPPublicationDateEDATEntrezDateSOSourceTAJournalTitleAbbreviationMHMeSHTermsPTPublicationType检索界面基本检索高级检索MeSHDatabase检索限定检索期刊查询(JournalsDatabases)引文匹配器(CitationMatcher)临床查询(ClinicalQueries)打开搜狗浏览器用户名：jf20120001密码：123456PubMed检索方法1.基本检索：在基本检索界面下完成的检索方法2.高级检索：高级检索界面下进行的检索方法3.MeSHDatabase检索：MeSH主题词界面下进行的检索方法基本检索基本检索1.关键词、词(词组)或短语：2.作者：SmithJS或Smith[au]3.期刊刊名：GENETHERAPY[TA]，JAMA[TA]4.截词：CHEMO*5.复杂表达式：CANCERANDTHERAPY6.#1AND#2艾滋病的药物治疗AidsdrugtherapySearchdetails检索过程(acquiredimmunodeficiencysyndrome[MeSHTerms]OR(acquired[AllFields]ANDimmunodeficiency[AllFields]ANDsyndrome[AllFields])ORacquiredimmunodeficiencysyndrome[AllFields]ORaids[AllFields])(drugtherapy[Subheading]OR(drug[AllFields]ANDtherapy[AllFields])ORdrugtherapy[AllFields]ORdrugtherapy[MeSHTerms]OR(drug[AllFields]ANDtherapy[AllFields]))修改后的检索结果高级检索高级检索MeSHDatabase检索输入查找的主题词Aidsdrugtherapy主题词注释树状结构表款目词检索步骤查看检索历史限定检索1.限制检索或条件检索：Limits(1)日期：①Dateofpublication[DP]原始文献出版日期；②EntrezDate[EDAT]文献首次录入PubMed日期；③MeSHDate[MHDA]文献被MeSH词条标引日期。(2)地址：单个词加标识符[ad](3)带有摘要文献的检索：CANCERANDhasabstract(4)数据库子集的限定：特殊主题的检索AMERICANANDhistory[sb]2.限定检索结束后，及时取消限定条件限定检索限定检索点击取消PubMed几种检索方法的选择基本检索高级检索MeSHDatabase检索举例：儿童哮喘的药物治疗方面文献基本检索1.检索表达式：childrenasthmadrugtherapy2.直接输入检索框中，进行检索检索过程（Searchdetails）(child[MeSHTerms]ORchild[AllFields]ORchildren[AllFields])AND(asthma[MeSHTerms]ORasthma[AllFields])AND(drugtherapy[Subheading]OR(drug[AllFields]ANDtherapy[AllFields])ORdrugtherapy[AllFields]ORdrugtherapy[MeSHTerms]OR(drug[AllFields]ANDtherapy[AllFields]))修改检索式：child[MeSHTerms]ANDasthma[MeSHTerms]ANDdrugtherapy[Subheading]举例：儿童哮喘的药物治疗方面文献MeSHDatabase检索1.确定主题词：childasthmadrugtherapy(副主题词)2.查找主题词举例：儿童哮喘的药物治疗方面文献高级检索1.确定检索词：childasthmadrugtherapy2.选择检索字段3.输入检索词JournalsDatabases主题、刊名全称或缩写、ISSN单篇文献匹配器临床咨询特殊专题咨询检索结果显示保存打印显示格式Summary(简要格式)Abstract（文摘格式）MEDLINE保存格式1.File(文件)2.Format（格式）检索策略的存储和调用使用MyNCBI(Cubby)首先要登记注册保存检索策略定期浏览新的检索结果注册或登录个人帐号注册后的功能保存、修改、删除检索式其它功能全文链接相关文献链接相关数据库的链接RSS阅读器的使用全文链接全文链接检索练习1.检索有关“禽流感(birdflu)预防控制方面”的文献2.检索微量元素缺乏(traceelements)与皮肤病(skindiseases)关系的文献（限英文综述）3.利巴韦林（ribavirin）治疗SARS方面的综述文献4.眼结核(oculartuberculosis)引起失明(blindness)的文献5.北京大学韩济生教授发表的英文文献6.CANCERLETTERS期刊上查找有关基因治疗方面的文献1.检索过程和步骤2020/2/1675（1）分析课题，提炼出两个主题概念，并明确概念之间的相互关系如下：预防控制禽流感事物与特征的关系2020/2/1676（2）选择检索方式为叙词检索，在PUBMED数据库中即为选择MeSH入口进行检索。（3）编制检索策略。InfluenzainBirds/preventionandcontrol（禽流感/预防控制）其中主题词为：InfluenzainBirds（禽流感）副主题词为：preventionandcontrol（预防控制）2.检索过程和步骤2020/2/1677（1）分析课题，提炼出两个主题概念，并明确概念之间的相互关系如下；皮肤病微量元素缺乏因果关系此外，课题还要求只要英文综述文献。综述英文+2020/2/1678（2）选择检索方式为叙词检索，在PUBMED数据库中即为选择MeSH入口进行检索。●此外，PUBMED数据库提供有检索结果滤镜（ResultFilters），可对检索结果按照不同分面进行显示，其中有按照文献语种、文献类型等分面的显示。2020/2/16782020/2/1679（3）编制检索策略。TraceElements/deficiency（痕量元素/缺乏）SkinDiseases/etiology（皮肤疾病/病因学）其中主题词为：TraceElements、SkinDiseases副主题词为：deficiency、etiologyPubMed检索小结1.任何一项研究主题都有多个检索途径，要比较多个检索途径的结果，那个更适合该项研究主题2.SearchDetails描述检索过程3.*关闭自动转换匹配功能4.限定检索条件要及时关闭，否则会影响后续的检索结果谢谢！