37文献检索新思维

BIOONInfo-TechCo.Ltd.什么是真正的文献检索?检索(retrieve)≠查找(search,find)有四层含义:1如何有效查找到所需文献2如何查全,查精所需文献3如何整理、归纳文献4从文献中得出有意义的结论BIOONInfo-TechCo.Ltd.://一、Select•1期刊类、专利类、新闻类、会议类、书籍类等数据库；其它是专门的数据库，如药物数据库，中草药数据库，疾病数据库等。•最常用的期刊类。•中文：维普，万方，CNKI三大期刊知识库。超星、书生之家书籍库。•英文：Pubmed、SD、EBSCO、Springer、NPG、EiVillage、CAS、KluwerBIOONInfo-TechCo.Ltd.•1关键词检索•2组合检索、二次检索、回溯检索二、SearchBIOONInfo-TechCo.Ltd.•如何将检索到的文献进行筛选和归类。检索一直有一个问题：不熟练检索的同学往往拼命查资料；而熟悉检索的同学往往内容太多，大量时间在重复检索和查找已检索过的内容。•正常：Search:Sort=3:7•往往：Search:Sort=5:5三、SortBIOONInfo-TechCo.Ltd.原则•1只保留重要的资料-----不要什么文献都要！许多新手往往只要查到的资料，就一定要保存下来，哪怕仅仅是相关。时间长了，这些不重要的资料，往往占住你主要地方。•2一定要精细分类，并录入数据库。传统的电脑中按文件夹分类已不能适应时代的发展了。务必要用合适的软件进行归类。•3要分精读与速读两类BIOONInfo-TechCo.Ltd.四、Systematize•ReferenceManage和Endnote优点：处理英文较方便，前者属于老牌软件商了。但后者信息更新快，尤其是文献检索更新更快，近来应用更广。同时Endnote还能支持中文期刊的格式，这也是比较优秀的一面。不利：价格比较贵，界面为英文的。BIOONInfo-TechCo.Ltd.•这是国内近年来发展最快的一款软件，同类软件还有文献王，但前者运行效率更高，适用面更广，对中英文支持都非常完善，升级更快，值得期待。BIOONInfo-TechCo.Ltd.文献怎么看？多看还是少看？------看少了什么都不懂；看多了什么都不做了。----走进文献，走出文献BIOONInfo-TechCo.Ltd.出入法•1文章背后的故事•2文章与文章间的idea沟通。•许多文献你阅读完以后，觉得很完善，这一块似乎已经perfect了，实际上你需要更多思考这篇文章的缺陷，即使是CNS上的，同样有漏洞，这些漏洞有时是作者回避的，或尚未研究的东西，这里面就是新的idea来源。•如何读出文章背后的故事，这非常重要。读文献有两个境界，一是入，二是出。先要按作者意思去读文献，读懂它；其次按作者的方法去自己假设，从更高角度看这篇文章，还有哪些不完善的地方？BIOONInfo-TechCo.Ltd.找到成功背后的失败•如ES细胞培养的例子，一开始文献是记录XXX培养成功，保持不分化状态。你认为很高兴，但你是否注意到他曾经失败过多少次，或者说正常培养就失败。那么这背后到底是什么因素导致成功？什么因子？•有时有些文献中一句话，里面可能是一个大课题。如ES细胞在无血清培养下会向神经细胞方向分化，因此必需有血清培养。这是常识，但为什么呢？这就一个大课题。•细胞凋亡需要ATP参与，是主动过程，这句话背后包含了这一层含义：ATP是凋亡必需的。但同样有另一个常识，细胞在死亡过程中ATP往往下降，这其中存在一个矛盾，就也是idea.BIOONInfo-TechCo.Ltd.：低氧导致细胞死亡。这是常识，但是是否存在一种细胞，给它各种各样的刺激仍不会死亡？其机理是什么？案例2：为什么成年以后，心脏细胞，脑细胞不分裂了，而有些细胞却可以分裂？-----是不是因为细胞周期缺失了某些因子？如果人为补充这些因子又如何？案例3：细胞周期分裂大家都认为是G0-G1-S-M，那么我们能逆向进行吗？案例4：大象细胞大还是细胞多？为什么案例5：蛇等有毒动物为什么不毒自己？蛇毒与Na通道关系BIOONInfo-TechCo.Ltd.挑战经典•案例1：细胞周期中CyclinD是必需的•-------如果我knockout这个基因呢？•案例2：大肠杆菌不能产生糖蛋白，这是基因工程上最头疼的难题。•-----能否人为转入产生糖蛋白相关基因，让大肠杆菌也能产生人类的糖蛋白？•案例3：癌症是干细胞？•案例4：SiRNA，CaM的发现•案例5:TNF基因无法被SiRNABIOONInfo-TechCo.Ltd.比较延伸将相似的文献做比较，总结异同案例1：做骨髓间质干细胞（MSC）分化时：A+B-诱导向神经细胞分化C+E诱导向内皮细胞分化B+F诱导向脂肪细胞分化B在MSC分化中作用案例2：离子通道属性在高等生物神经细胞上研究已相对透彻。可以引出以下几个问题：（1）特殊物种：线虫，果蝇，蛇，或一些突变体上呢？（2）特殊类型细胞：肿瘤细胞，胚胎干细胞，肾上皮？（4）同一通道放在不同细胞上呢？如NMDA受体转到肾上皮呢？BIOONInfo-TechCo.Ltd.交叉嫁接•如已知ABC和FGC，那么C可能是连接B—G的关键，这里面可能会出现新的idea.•案例1：如长期关节炎患者，往往冠心病发生少。如服阿斯匹林可以减少心脏病•案例2：长期服用抗生素患者，患冠心病机率也下降---冠心病与支原体相关学说•案例3：神经细胞中观察到同一种信号分子在细胞中不同位置作用不同。那么在其它细胞呢？•案例4：睡眠足，白天记忆好，why？---hypothesis:GABA对学习和记忆作用的多面性•案例5：RA，As2O3促白血病分化；低氧可以促进干细胞分化；BIOONInfo-TechCo.Ltd.•不要看不起gapjunction的工作，这是绝大部分工作的源头。也是必要的。•要从gapjunction工作中发现更多线索BIOONInfo-TechCo.Ltd.生物谷：检索能力加速器充分利用网络进行学习和交流---生物谷是首选平台生物谷网站是生物行业最专业的网站，拥有网站，论坛，博客，面向不同人群的需求。中国生命科学论坛（交流中心）生物谷博客：（个人信息中心）生物谷网站：（信息获取源）论坛可以用来交流和学习；博客是整理资料的重要的地方，可以将自己有用的资料，心得，想法，放在博客中，不断回馈，交流，以获得更多的idea.如果将整理的内容放在博客中，时间长了，你会感觉很吃惊！它对科研具有重要的推动作用。BIOONInfo-TechCo.Ltd.以前系列讲座参见检索技巧论坛：=17•Bioon全心奉献的系列检索讲座=17&ID=476&page=1•Bioon新讲座----有机检索理念=17&ID=45046&page=1•BIOON新讲座---检索思维与知识管理=17&ID=156037&page=1BIOONInfo-TechCo.Ltd.张发宝(BIOON)上海北岸信息技术有限公司上海龙吴路51号嘉源商务中心1#211室（200232）生物谷网站:[e-mail]：[e-mail]博客：