同济医学院SPSS课件-SPSS Cox回归

生存分析第10章非参数检验SPSS应用华中科技大学公共卫生学院流行病学与卫生统计学系蒋红卫[e-mail]内容基本概念基本步骤基本操作基本结果解释生存分析（survivalanalysis）是将事件的结果（终点事件）和出现这一结果所经历的时间结合起来分析的一种统计分析方法。生存分析不同于其它多因素分析的主要区别点就是生存分析考虑了每个观测出现某一结局的时间长短。基本概念生存分析的目的描述生存过程，估计不同时间的总体生存率，计算中位生存期，绘制生存函数曲线。Kaplan-Meier（K-M）法寿命表法比较：比较不同处理组的生存率，如比较不同疗法治疗脑瘤的生存率，以了解哪种治疗方案较优。log-rank检验影响因素分析：研究某个或某些因素对生存率或生存时间的影响作用。如，了解影响脑瘤病人预后的主要因素，包括年龄、性别、肿瘤分期、治疗方案等。cox比例风险回归模型预测cox回归预测模型生存分析菜单寿命表法寿命表法用于（小样本和大样本资料）估计某生存时间的生存率，以及中位生存时间绘制各种曲线：如生存函数、风险函数曲线等对某一研究因素不同水平的生存时间分布的比较控制另一个因素后对研究因素不同水平的生存时间分布的比较对多组生存时间分布进行两两比较（比较总体生存时间分布采用wilcoxon检验）例1：为了比较不同手术方法治疗肾上腺肿瘤的疗效，43例病人随机分为两组其中有“+”者是删失数据，表示病人仍生存或失访，括号内为死亡人数。例1文件格式定义5个变量生存时间变量：Time，值标签“生存时间（月）”生存状态变量：status，取值“0=死亡，1=删失或存活”频数变量(可无)：f，值标签“人数”分组变量：group，取值“0=甲组，1=乙组”生存时间序号变量(可无)：IDSPSS基本操作SPSS基本操作生存时间最大生存时间组距生存状态定义终点事件分组因素分组定义生存状态定义生存状态定义SPSS基本操作给定选项SPSS基本操作生成寿命表生存曲线作图等各组比较的方式不作比较整体性比较两两比较Kaplan-Meier法Kaplan-Meier过程用于(尤其小样本资料）估计各生存时间的生存率以及中位生存时间。绘制各种曲线：如生存函数、风险函数曲线等。比较某研究因素不同水平的生存时间有无差异。控制某个分层因素后对研究因素不同水平的生存时间分布进行比较。对多组生存时间分布进行两两比较（各总体分布比较采用Log-rank等非参数方法）同例1：为了比较不同手术方法治疗肾上腺肿瘤的疗效，43例病人随机分为两组其中有“+”者是删失数据，表示病人仍生存或失访，括号内为死亡人数。例2SPSS基本操作SPSS基本操作生存时间生存状态定义生存状态分组因素SPSS基本操作SPSS基本操作比较方法SPSS基本操作比较方法比较方式几点说明检验统计量TestStatistics：都用于检验时间分布是否相同对数秩Log-rank：各时间点的权重一样。Breslow：按各时间点的观察例数赋权Tarone-Ware：按各时间点观察例数的平方根赋权Lineartrendforfactorlevels:线性趋势检验Pooledoverstrata:水平间整体性比较Foreachstratum:每层进行各分组水平间的整体性比较Pairwiseoverstrata:分组各水平间的两两比较Pairwiseforeachstratum:每层上各水平间的两两比较SPSS基本操作选项SPSS基本操作统计指标作图Cox回归在医学中,一方面要看治疗结局的好坏，另一方面还要看生存时间的长短。生存时间的长短不仅与治疗措施有关,还可能与病人的体质,年龄,病情的轻重等多种因素有关。如何找出其中哪些因素与生存时间有关、哪些无关呢？由于失访、试验终止等原因造成某些时间的不完全,不能用多元线性回归分析。1972年英国统计学家CoxDR.提出一种比例危险模型方法，能处理多个因素对生存时间影响的问题。其目的多个因素对生存时间的影响作用分析和比较生存（或死亡）风险预测Cox回归Cox回归属半参数模型，模型基本形式:h(t,x)为具有协变量x的个体在时刻t的风险函数(风险率,瞬时死亡率)，h0(t)称基准风险率，即所有协变量均为0时，个体时刻t的风险函数01122(,)()exp()pphxthtxxx上式的右侧分两部分:h0(t)与时间有关的任意函数，其分布和形状无明确假定，是非参数部分.另一部分是参数部分，其参数可以通过样本估计.因为无须估计h0(t)，故Cox回归的模型拟和不是直接用生存时间作为因变量,而是以风险函数与基础风险函数的比值为因变量。Cox比例风险模型11220(,)exp()()pphxtxxxhtCox回归的假定:0(,)()hxtht与时间t无关i为回归系数,它的估计需借助偏似然函数的方法.i的含义为xi每改变一个单位时,引起的死亡风险改变倍数的自然对数值.ei的流行病学含义:xi每改变一个单位,死亡风险改变ei倍.当x为0,1变量时即为相对危险度.Cox回归-多因素分析数据格式设含有p个变量x1,x2,…,xp及时间T和结局C的n个观察对象.其数据结构为:IDx1x2…xpTimeStatus1x11x12…x1py102x21x22…x2py21…………………Nxn1xn2…xnpyn0例3例3：为探讨某恶性肿瘤的预后，某研究者收集了63例患者的生存时间、生存结局及影响因素。影响因素包括病人年龄、性别、组织学类型、治疗方式、淋巴结转移、肿瘤浸润程度，生存时间以月计算。试用Cox回归模型进行分析。IDX1X2X3X4X5X6timestatusIDX1X2X3X4X5X6timestatus154001105203362000101200257010005103440111014013580001135135501001026144311110103036331100012005480100071375711100120064001000600384810010120074401000580392800010318360001129140541011012019391110170041350101171104201001670424700010181114201000660434910110120012421011087044430100012001351111008504548110001511455010018204644000104115491110176047601110012001652111017404840000101611748111006304932010012411854101111010504400011191193801000100051481001012002040111016615272010102412138000109305342000102122190001024154631011012002367101109305555011001212437001109005639000105125431001015157440001012002649000103158421110012002750111118705974000117128531110012006061010104012932111001200614510110108030460100112006238010002413143101101200636200010161324410110120063名某恶性肿瘤患者的生存时间（月）及影响因素SPSS基本操作SPSS基本操作生存时间生存状态设定状态协变量SPSS基本操作SPSS基本操作哑变量SPSS基本操作与Logistic回归设置相同哑变量形式SPSS基本操作作图SPSS基本操作作图类型比较各变量的各类曲线SPSS基本操作选项SPSS基本操作回归系数可信区间各参数估计间的相关性Cox逐步回归与Logistic逐步回归相似变量筛选方法选项SPSS基本操作筛选标准Cox回归注意事项严格设计样本量应较大注意检验Cox回归前提条件，如，比例风险假设等某些情况下，Cox回归不能适用，如，手术的长期效应等小结SPSS中“Analyze”/“Survival”/”LifeTables”菜单主要用于寿命表法。SPSS中“Analyze”/“Survival”/”Kaplan-meier”菜单主要用于KM法。SPSS中“Analyze”/“Survival”/”CoxRegression”菜单主要用于COX回归分析。45谢谢大家！