关于慢病毒感染的相关知识总结

慢病毒使用操作手册一、慢病毒的储存与稀释:1.病毒的储存：收到病毒液后在很短时间内即使用慢病毒进行实验，可以将病毒暂时放置于4℃保存；如需长期保存请放置于-80℃（病毒置于冻存管，并使用封口膜封口）①病毒可以存放于-80℃6个月以上；但如果病毒储存时间超过6个月，建议在使用前需要重新滴定病毒滴度②反复冻融会降低病毒滴度：每次冻融会降低病毒滴度10%；因此在病毒使用过程中应仅尽量避免反复冻融，为避免反复冻融,建议收到病毒后按照每次的使用量进行分装。2.病毒的稀释：如果需要稀释病毒，请将病毒取出置于冰浴融解后，使用培养目的细胞用PBS或无血清培养基(含血清或含双抗不影响病毒感染)。混匀分装后4℃保存(请尽量在三天内用完)分装后使用。二、慢病毒用于体外（InVitro）实验：感染培养原代细胞和建系细胞。慢病毒对各种细胞和组织的亲嗜性不同，在使用慢病毒之前可以通过查阅相关文献，了解慢病毒对您的目的细胞的亲嗜性，感染复数（MOI值）以及在体（InVivo）注射所需要的病毒量。如果没有相关文献支持，可以通过感染预实验得到合适的感染复数（MOI值）（使用24孔板检测病毒对目的细胞的亲嗜性）。慢病毒感染目的细胞预实验1.慢病毒感染目的细胞预实验注意事项：①测定慢病毒对目的细胞的亲嗜性时，需要同时设置对慢病毒亲嗜性较高的细胞(HEK293T，Hela）作为平行实验的对照细胞。②在进行慢病毒感染实验时，可以用完全培养基（培养目的细胞用）稀释；理论上，含有血清，双抗或者其他营养因子的完全培养基不影响慢病毒的感染效率。③一般慢病毒单位为TU/ml，即每毫升中含有具有生物活性的病毒颗粒数。如：病毒滴度为1X108TU/ml即每毫升病毒液中至少含有1X108个具有生物活性的慢病毒颗粒。2.以24孔培养板为例，进行目的细胞和HEK293T细胞的感染预实验实验前按照不同的MOI设置不同的感染孔，并根据MOI和细胞数量计算所需要的病毒量，如有必要可以使用PBS溶液或者无血清培养基稀释病毒原液。第一天，准备细胞：在24孔培养板接种若干孔，每个孔内接种3~5X104个目的细胞，铺板时细胞的融合率为50%左右，每孔培养基体积为100μl；进行病毒感染时细胞的融合度约为70%左右。第二天，准备病毒：取出4℃保存的病毒，使用台式离心机离心20秒（使病毒完全悬于离心管底部即可）；如果是冻存在-80℃的病毒需要先在冰上融化后使用。亦可以根据实验室的实际情况将按照MOI准确计算好的慢病毒稀释到培养基中，并尽可能保证所获得的含有慢病毒的培养基的总体积为最小体积，以期获得最佳的感染效率。第二天，感染目的细胞：病毒准备好之后，从培养箱中拿出细胞，首先察细胞生长状态，如细胞状态较好则开始实验。a使用移液器吸取准确体积的病毒液加入准备好的培养基。b吸去培养基的培养器皿中的培养基（如果细胞生长良好，密度适宜，则不用换液）。c在目的细胞和对照细胞中分别加入计算好的病毒液。d混匀后放于二氧化碳培养箱（37℃、5%CO2）孵育过夜。注：感染前细胞的状态好坏对最终的感染效果高低影响很大，所以务必保证加病毒之前细胞处于良好的生长状态。亦可以将预先准备好的培养基和慢病毒的混合液直接加入培养器皿中。慢病毒对目的细胞的感染效率较低，通过提高MOI值可以提高病毒的感染效率，但是当MOI高于20时，我们建议在培养基中加入ploybrene（8μg/ml左右）来提高病毒的感染效率。第三天，更换培养液：一般在24小时候后将含有慢病毒的培养液更换成正常培养液；在感染后观察细胞状态，如果慢病毒对细胞有明显毒性作用而影响细胞生长状态，可以最短在加病毒4小时候更换新鲜培养液后继续培养（建议在8-12小时更换为宜）。第一次换液后，如果慢病毒对细胞没有明显毒性作用，按照正常培养条件培养换液。第六天，感染效率检测：在倒置荧光显微镜观察荧光，估计慢病毒感染目的细胞的效率；如何由于目的基因较大而造成选择的载体不能携带MarkerGene的，可以通过Real-timeRT-PCR检测目的基因的表达来拍评估感染效率。注意：有些慢病毒载体上带有GFP绿色荧光蛋白，使用者可以在病毒感染96小时后用倒置荧光显微镜观察GFP绿色荧光，以观察病毒对目的细胞的感染情况。如果慢病毒载体携带其他MarkerGene如RFP\BFP可以用荧光显微镜在对应的激发光波长下观察荧光表达的情况。慢病毒表达时间较慢，荧光表达所需时间较长，建议感染后96小时后观测荧光表达。感染后的细胞可以连续培养一周，通过观察荧光的表达时间和表达强度来确定慢病毒对目的细胞的感染情况。感染期间请根据细胞生长的情况对细胞进行及时换液，以保证细胞良好的生长状态。三、慢病毒使用安全使用规范慢病毒中的毒性基因已经被剔除并被外源性目的基因所取代，属于假型病毒因此没有毒性作用。但该病毒仍然具有可能的潜在的生物学危险，不建议使用编码已知或可能会致癌的基因的假型病毒。除非已经完全公认某个基因肯定没有致癌性，否则均不建议采用假型病毒进行生物学实验。使用时请参照如下所示进行实验：1．病毒操作时最好使用生物安全柜。如果使用普通超净工作台操作病毒，请不要打开排风机。2．病毒操作时请穿实验服，带口罩和手套。3．操作病毒时特别小心不要产生气雾或飞溅。如果操作时超净工作台有病毒污染，请立即用70%乙醇加1%的SDS溶液擦拭干净。接触过病毒的枪头，离心管，培养板，培养液请于84消毒液或1%SDS中浸泡过夜后弃去。4．用显微镜观察细胞感染情况时应遵从以下步骤：拧紧培养瓶或盖紧培养板。用70%乙醇清理培养瓶外壁后到显微镜处观察拍照。离开显微镜实验台之前，用70%乙醇清理显微镜实验台。5．如需要离心，应使用密封性好的离心管，或者用封口膜封口后离心，而且尽量使用组织培养室内的离心机。6．脱掉手套后，用肥皂和水清洗双手。四、悬浮细胞感染方法概要1.根据细胞的量将细胞在1.5ml管中离心收集然后用100-200ul的无血清培养液稀释细胞沉淀，以细胞完全浸没在培养基中为准。2.按照MOI换算病毒颗粒数量，吸取病毒液加入细胞中，将1.5ml管放在37℃度培养箱中孵育30分钟。3.将管中混合溶液吸出加到培养皿中或孔里。4.加入足够量的新鲜培养液。5.12小时后换液。6.96小时后观察细胞阳性率。五、相关专业术语：MOI：病毒感染复数传统的MOI概念起源于噬菌体感染细菌的研究。其含义是感染时噬菌体与细菌的数量比值，也就是平均每个细菌感染噬菌体的数量。噬菌体的数量单位为pfu。一般认为MOI是一个比值，没有单位，其实其隐含的单位是pfunumber/cell。后来MOI被普遍用于病毒感染细胞的研究中，含义是感染时病毒与细胞数量的比值，本手册中提到的MOI都是沿用这个概念。然而，由于病毒的数量单位有不同的表示方式，从而使MOI产生了不同的含义。能产生细胞裂解效应的病毒例如单纯疱疹病毒等习惯上仍用pfu表示病毒数量，因此其MOI的含义与传统的概念相同。六、细胞培养器皿的相关参数Flask/DishSurface(mm)CellnumberMediaVolume96wellplate501.5-5.0×10100μl48wellplate1003.0×104-1.0×10200μl24wellplate2008.0×104-2.0×10500μl12wellplate4011.6-4.0×101.0ml6wellplate9623.0-8.0×102.0ml35mm9623.0-8.0×102.0ml60mm28271.0-2.5×106.0ml100mm78542.5-6.4×1010.0ml慢病毒重组慢病毒简介在转染遗传物质到细胞基因组中的工作中，重组慢病毒载体是一个强大和有效的工具。慢病毒能作用于细胞周期的G0/G1期，同时具有嗜核性，所以可以感染分裂期细胞和非分裂期细胞，感染包括几乎所有的哺乳动物细胞、干细胞和原代培养的细胞。慢病毒载体具有携带基因片段容量大、转染效率高、可感染分裂细胞及非分裂细胞、目的基因可在宿主细胞中长时间稳定表达以及安全性好、免疫反应小等优点。所以获得了较广的应用范围。慢病毒载体也是RNAi表达的主要手段，同化学合成和酶切形成的siRNA相比具有几个优点：其一，可以携带GFP或萤光素酶等报告基因共表达，便于跟踪、选择和富集转染的细胞；其二，可以根据需要表达不同类型的小RNA分子（siRNA、shRNA或miRNA）；其三，具有较高的转染效率，使基因沉默维持较长时间。目前Pubmed中收录有关慢病毒载体用作实验的文章超过7万多篇，仅Nature,，Science,，Cell上便超过600篇。已成为国际上最通用的转染系统，广泛用于各类实验室。慢病毒的安全操作规范深圳百恩维提供的慢病毒均采用第三代系统的慢病毒载体。水泡性口炎病毒来源的VSV-G基因代替HIV-1的env基因，这既提高了慢病毒的安全性，又使其能够感染的细胞种类大大增加。本系统的慢病毒颗粒是“自身失活型(SIV)”，整合入靶细胞后，不会产生完整长度的RNA，仅仅具有携带目的基因的功能，感染目的细胞后不再感染其他细胞，也不会利用宿主细胞产生新的病毒颗粒。尽管如此，该病毒仍然具有潜在的生物学危险性，因此建议不要使用编码已知或可能会致癌的基因的假性病毒；并强烈建议将本系统生产的慢病毒视为二级生物安全水平的生物，而且严格遵守BSL-2或BSL-2+操作手册并进行相应的废弃物消毒。基本操作规范如下：1、在实验室工作时，任何时候都必须穿着连体衣、隔离服或工作服；应戴上合适的手套和口罩。2、病毒操作时最好使用生物安全柜。如果使用普通的超净工作台操作病毒，请不要打开风机。3、所有的技术操作要按尽量减少气溶胶和微小液滴形成的方式来进行。如果出现病毒污染，请立即用70%的酒精加1%SDS溶液擦拭干净。4、如需离心，应使用密封性好的离心管，可用Parafilm膜封口后离心，而且最好使用组织或细胞培养室内的离心机。5、用显微镜观察细胞感染情况时遵从以下步骤：拧紧培养瓶或盖紧培养板，并在使用70%乙醇清理所有受到污染的材料、标本和培养物在废弃或清洁再利用之前，必须清除污染。废弃的含病毒的培养基加入84消毒液（1:20左右），浸泡一天后丢弃。接触过病毒的枪头，离心管，培养板等其他物品可用84消毒液稀释液处理，也可以用煮沸处理半小时或高压湿热灭菌（121℃，30min）。6、手套用完后，应先消毒再摘除，随后必须洗手。详细操作规范请参阅卫生部发布的《微生物和生物医学实验室生物安全通用准则》（WS233-2002）、美国疾病控制中心出版的《微生物和生物医学实验生物安全（第五版）》和世界卫生组织出版《WHO生物安全手册》。操作慢病毒时请依照现有的使用指南。包装细胞293T细胞（下述流程来自深圳百恩维，如果使用不同公司系统请参考各公司提供的方案，本流程仅供参考）293T细胞的冻存1、随着传代的次数增加，293T细胞会出现生长状态下降，出现突变等，所以要在细胞购进时就进行备份。2、在细胞对数生长期进行冻存，增加细胞复苏成活率。3、倒去细胞上清液，加入D-Hank's液洗去残留的培养基。4、加入0.25%的胰酶，消化10-20s后倒去。5、镜下观察细胞变圆，细胞间间隙加大时，加入新鲜培养基吹打混匀。6、细胞计数。7、将细胞离心，1000rpm，2min。8、根据计数结果加入细胞冻存液（70%完全培养基+20%FBS+10%DMSO）重悬细胞，密度为3×106个/ml。10、第二天将细胞放入液氮灌，并记录。293T细胞的传代1、当细胞生长至汇合率达到80~90%需要对细胞进行传代操作，以扩大细胞数量，维持细胞良好的生长状态。2、消化细胞，方法同上。3、细胞离心结束后，加入完全培养基重悬。密度为3×105个/ml。4、分到10cm培养皿中，10ml/皿。293T细胞的复苏1、当细胞传代次数过多（超过50代），细胞状态变差时或细胞出现污染事故时，需要丢弃并对开始冻存的细胞进行复苏。2、打开水浴锅，设置温度为37℃。3、查看细胞库记录，根据记录从液氮灌中取出冻存的细胞（需戴上棉手套