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SNOMEDCT的构成与应用SMOMEDCT是当前国际上广为使用的一种临床医学术语标准。它对于临床医学信息的标准化和电子化起着十分重要的作用。截至2005年6月,国际系统医学术语临床术语(TheSystematizedNomenclatureofHumanandVeterinaryMedicineClinicalTerms,以下简称SNOMEDCT)核心术语包括了366170条卫生保健的概念,而用于描述这些概念则使用超过99.3万条记录,近146万条语义关联令数据的获取充分可靠。SNOMED发展历程1974年,SNOMED第一版问世,由44587个词条、6个模块构成。SNOMED的范畴包括解剖学、形态学、正常与非正常的功能、症状及疾病体症、化学制品、药品、酶及其他体蛋白、活有机体、物理因素、空间关系、职业、社会环境、疾病/诊断和操作。SNOMED的每一个术语(词条)均有一个编码与之对应,在疾病/诊断轴内,很多疾病概念还提供了与其他术语的交叉参照关系。1998年,SNOMED演进到3.5版,包括156965个词条和压缩过的12个模块。近年来,美国国家医学图书馆与美国病理学会(CAP)签署了关于使用SNOMEDCT的协议书,允许在美国推广使用SNOMEDCT,并且允许一些组织在国内免费使用SNOMEDCT。英国国民健康保险制度(NHS)也与美国病理学会共同成立了SNOMEDCT标准发展组织(SNOMEDCTSDO)用于推动并规范SNOMEDCT的使用。1997年发行的3.4版是中文译本的原版。中文SNOMED电子版是中文SNOMED3.4版的电子化产品,含145856个词条,并且建立起3.2万个词条与ICD-9-CM的对照关系。之所以与英文版的词条数目(146217)不同,是因为两种语言本身存在的差异(例如同义词)。它分为11个模块,其层次结构通过该词条代码的树型构造表达。每个词条的内容包括:编码、中文名、英文名、类别符、层次、与该词条相关的外部编码、ICD-9-CM码、药品编码、药厂编码、酶编码及SNOMED相关词条的交叉参照列表。SNOMEDCT的概念与构成SNOMEDRT(SystematizedNomenclatureofHumanandVeterinaryMedicinereferenceTerminology)是为了满足医学信息处理的广泛要求,在SNOMED3.6版基础上加入了新的设计理念,于2000年面世的。SNOMEDRT定义了概念(Concepts)和关系(Relationships)的集合,提供了通用的参考标准,用于全面的医疗保健信息的比较与聚合处理。SNOMEDCT是SNOMEDRT的衍生物,于2002年面世。它在SNOMEDRT定义的概念中加入了编码、关系、描述、层面等内容,使之更加清晰完备。SNOMEDCT所包含的概念并没有大幅度增长,大量增长的是描述与关系。其中,描述由2002年1月发布时的40万条发展到如今的90余万条,关系则由近80万条发展到近146万条。因此,SNOMEDCT由概念(Concepts)、概念ID、描述(Descriptions)、属性(Attributes)、层面(Hierarchies)、关系(Relationships)(关系又分为IS-A关系与属性关系)构成。其中,概念、描述、关系是SNOMEDCT的核心构件。1.概念、描述与层面SMOMEDCT不再使用词条表的方式对术语进行表示,而是采用概念的形式。概念以理解为医学中标准的临床术语,每个概念都有惟一的概念码,但每一个概念都可能有多个描述,并且由993420条描述形成了庞大的描述表――我们可以理解成同义词表。如“Paininthroat”(咽喉痛),在SMOMEDCT中是概念,而在实际应用中,它将会有多种不同的术语表达,如“Sorethroat”、“Throatpain”、“Paininpharynx”、“Throatdiscomfort”、“Pharyngealpain”、“Throatsoreness”,但它们并不是概念,而只作为描述被收集在描述表中。每一条概念有若干描述与之对应,描述表中的每一条描述也有与之相对应的概念存在。SMOMEDCT不再使用“轴”或“模块”来划分术语,而是定义了18个层面(Hiera-rchies),用18个层面区分366170条概念。实际应用中,上述18个层面中还有细分,如“人体结构”这一层面中又有细分为“形态学上的反常结构”,下面的列表所示为以一组解剖病理学中所使用的概念与概念所在层次举例。2.关系SMOMEDCT中的概念与概念间是有一定“关系”存在的。概念有36万条,但关系有近146万条。这种基于概念间的语义关系令数据的获取充分可靠。在SNOMEDCT中,关系分为两种:IS-A关系与属性关系。IS-A在同一个层面中,表示某些概念间的关系。如关节炎属于关节系统疾病,而关节系统疾病属于骨科疾病,这样关节炎→关节系统疾病→骨科疾病就形成了一种IS-A关系;属性关系表示跨层面的概念间的关系,如“阑尾炎”是一种疾病,但从形态学上看,“阑尾炎”属于炎症的一种,在属性关联中,可由“阑尾炎”引导出“炎症”。3.属性在SNOMEDCT中,每一条概念都有若干种属性用于准确具体表示概念。同一层面中的概念的属性类型是相同的。以临床表现为例,在临床表现中的概念的属性为:发现部位、联合词(如:之后、导致、因为)、形态学、严重程度、发作情况、过程、情景、解释、病理学、事件等。SNOMED与本体论本体(Ontology)是关于概念和概念之间关系的形式化描述系统,在此指形式化的(即可以被机器所处理的)、对共享概念的精确详细的说明和描述,一般包括概念的使用类型及约束条件。本体提供了信息交互各方在特定领域的共同知识背景,常用于作为特定领域中可被计算机理解、应用的知识模型,包括领域中的概念、属性及其相互关系。SNOMED是从术语表演进而来,仍然处于不断的发展与变化之中。当前SNOMED的发展方向和方法学正在走向医学本体研究与表达,RIM的框架和复杂关系的表达,加上SNOMED多年来在临床应用受控词表的经验,预示着医学知识本体研究将会有重大进展,而UML(UnifiedModelingLanguage,统一建模语言)将是重要工具。SNOMEDCT已经成为美国最重要的医学受控词表,36万条的概念与146万条关系形成了医学领域本体,反映的是医学领域理论与本质上的事实。应用现状与前景1.在临床信息系统中的应用目前,受控词表(CMV)在医学信息交换中位于数据处理的核心地位,它紧紧包裹在临床数据库外,临床信息系统将通过一系列引擎与受控词表相连接,从而形成可交互的、能够保障病人安全协作医疗服务与监控的突发公卫事件系统、电子病历(EMR)系统、ICU监测系统、临床诊断支持系统、用药观察研究、临床试验系统、医嘱处理系统、疾病监测系统、影像学及社区人群健康服务等系统,方便数据挖掘与决策分析。2.SMOMEDCT与UMLSSNOMED为UMLS(UnifiedMedicalLanguageSystem,统一医学语言系统)提供医学术语词条开始于2004年1月。UMLS是医学术语研究的重要课题。SNOMED为UMLS提供了最为广泛和最为重要的医学术语,是UMLS所包含的多个术语集之一。UMLS的主要角色是提供多用途的电子化医学词典,它使得许多不同源术语集中的相同语义拥有标准格式成为可能。3.SMOMEDCT在医药学中的作用在美国国家医学图书馆编制的临床药学标准术语RxNorm中,SNOMEDCT在公众领域可以提供一些特殊的药品概念与编码信息。SMOMEDCT与RxNorm都可以应用于药品信息系统。4.SMOMEDCT与英国国民健康信息基础架构(NHII)英国制订的国民健康信息基础架构(NHII)的目标之一是:无论何时何地,让需要且有权使用电子病历的人能够使用,并且以保障其隐私权为前提。为了实现这个目标,NHII参考并采用了一系列现有卫生信息标准。在消息标准方面,采用了如HL7、DICOM、IEEE、X12N、NCPDP等;在术语标准中,有LOINC、ICD-9CM、UMLS、SNOMED等。5.SMOMEDCT与其他标准间的映射SMOMEDCT与其他标准间的映射是非常重要的。无论是在美国或英国,SNOMEDCT均在努力完成与其他标准的映射,如ICD-9-CM、ICD-10、ICF等。最初的映射一般是简单易行,但后期的基于规则的映射则更显重要。这些映射的合理性将在实践中加以检验。可以看到,SNOMEDCT已经成为国际上使用广泛的临床术语标准,更多的研究将涉及其在医学信息系统中的使用以及与其他医学标准的映射。(作者单位:北京协和医院信息中心)
本文标题:SNOMED-CT
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