慢病毒转染手册

慢病毒（Lentivirus）载体是以HIV-1（人类免疫缺陷I型病毒）为基础发展起来的基因治疗载体。区别一般的逆转录病毒载体，它对分裂细胞和非分裂细胞均具有感染能力。基本概述慢病毒载体的研究发展得很快，研究的也非常深入。该载体可以将外源基因有效地整合到宿主染色体上，从而达到持久性表达。在感染能力方面可有效地感染神经元细胞、肝细胞、心肌细胞、肿瘤细胞、内皮细胞、干细胞等多种类型的细胞，从而达到良好的的基因治疗效果，在美国已经开展了临床研究，效果非常理想，因此具有广阔的应用前景。慢病毒的应用目前慢病毒也被广泛地应用于表达RNAi的研究中。由于有些类型细胞脂质体转染效果差，转移到细胞内的siRNA半衰期短，体外合成siRNA对基因表达的抑制作用通常是短暂的，因而使其应用受到较大的限制。采用事先在体外构建能够表达siRNA的载体,然后转移到细胞内转录siRNA的策略，不但使脂质体有效转染的细胞种类增加，而且对基因表达抑制效果也不逊色于体外合成siRNA，在长期稳定表达载体的细胞中，甚至可以发挥长期阻断基因表达的作用。在所构建的siRNA表达载体中，是由RNA聚合酶Ⅲ启动子来指导RNA合成的，这是因为RNA聚合酶Ⅲ有明确的起始和终止序列，而且合成的RNA不会带polyA尾。当RNA聚合酶Ⅲ遇到连续4个或5个T时，它指导的转录就会停止，在转录产物3’端形成1~4个U。U6和H1RNA启动子是两种RNA聚合酶Ⅲ依赖的启动子，其特点是启动子自身元素均位于转录区的上游，适合于表达～21ntRNA和～50ntRNA茎环结构（stemloop）。在siRNA表达载体中，构成siRNA的正义与反义链，可由各自的启动子分别转录,然后两条链互补结合形成siRNA；也可由载体直接表达小发卡状RNA(smallhairpinRNA,shRNA),载体包含位于RNA聚合酶Ⅲ启动子和4～5T转录终止位点之间的茎环结构序列，转录后即可折叠成具有1~4个U3’突出端的茎环结构，在细胞内进一步加工成siRNA。构建载体前通常要通过合成siRNA的方法，寻找高效的siRNA，然后从中挑选符合载体要求的序列，将其引入siRNA表达载体。慢病毒载体慢病毒载体（Lentiviralvector）较逆转录病毒载体有更广的宿主范围，慢病毒能够有效感染非周期性和有丝分裂后的细胞。慢病毒载体能够产生表达shRNA的高滴度的慢病毒，在周期性和非周期性细胞、干细胞、受精卵以及分化的后代细胞中表达shRNA，实现在多种类型的细胞和转基因小鼠中特异而稳定的基因表达的功能性沉默，为在原代的人和动物细胞组织中快速而高效地研究基因功能，以及产生特定基因表达降低的动物提供了可能性。慢病毒作为siRNA的携带者，不但具备特异性地使基因表达沉默的能力，而且充分发挥了慢病毒载体自身所具备的优势，为基因功能的研究提供了更强有力的工具。慢病毒表达载体包含了包装、转染、稳定整合所需要的遗传信息。慢病毒包装质粒可提供所有的转录并包装RNA到重组的假病毒载体所需要的所有辅助蛋白。为产生高滴度的病毒颗粒，需要利用表达载体和包装质粒同时共转染细胞，在细胞中进行病毒的包装，包装好的假病毒颗粒分泌到细胞外的培养基中，离心取得上清液后，可以直接用于宿主细胞的感染，目的基因进入到宿主细胞之后，经过反转录，整合到基因组，从而高水平的表达效应分子。慢病毒载体与其它常见病毒载体的特征比较目前常用的病毒载体有腺病毒、逆转录病毒和慢病毒。逆转录病毒载体只能感染分裂期细胞，而且容量有限，腺病毒一般不能整合到染色体上，只能进行瞬时感染。与其它逆转录病毒相比，慢病毒（LV）具有可以感染非分裂期细胞、容纳外源性基因片段大，可以长期表达等显著优点。慢病毒不产生任何有效的细胞免疫应答，可作为一种体外基因运输的工具。慢病毒载体介导的转基因表达能持续数月，且无可观察到的病理学现象。[1]病毒表达系统腺病毒表达系统慢病毒表达系统逆转录病毒病毒基因组双链DNA病毒RNA病毒RNA病毒是否整合病毒基因组游离于宿主基因组外，瞬时表达外源基因病毒基因组整合于宿主基因组，长时间、稳定表达外源基因病毒基因组整合于宿主基因组，长时间、稳定表达外源基因感染细胞类型感染分裂和不分裂细胞感染分裂和不分裂细胞感染分裂细胞，但在干细胞中表达效率低表达丰度高水平表达高水平表达高水平表达表达时间快（1-2天）慢（2-4天）快（1-2天）滴度滴度高达1012pfu/ml最高可达109－10TU/ml最高可达109－10TU/ml克隆容量可插入高达8kb的外源片段，滴度随插入片段长度增加而降低可插入不超过8kb的外源片段，滴度随插入片段长度增加而降低可插入不超过6kb的外源片段免疫原性高免疫原性低免疫原性低免疫原性动物模型不能得到转基因动物可产生转基因动物，效率达50以上可以，但很难启动子可以更换特异性启动子可以更换特异性启动子不需要启动子能否用于MIRCORNA可以可以不可以能否用于四环素诱导不可以TET-ON,TET-OFF不可以系统的目的与意义●对于一些较难转染的细胞，如原代细胞、干细胞、不分化的细胞等,能大大提高目的基因转导效率，而且目的基因整合到宿主细胞基因组的几率大大增加，这就为RNAi,cDNA克隆以及报告基因的研究提供了一个有利的途径。●进行稳转细胞株的筛选；●为活体动物模型实验提供高质量的包含目的基因的病毒液；解决的问题●对于一些较难转染的细胞，如原代细胞、干细胞、不分化的细胞等,能大大提高目的基因转导效率，而且目的基因整合到宿主细胞基因组的几率大大增加，这就为RNAi,cDNA克隆以及报告基因的研究提供了一个有利的途径。●进行稳转细胞株的筛选；●为活体动物模型实验提供高质量的包含目的基因的病毒液；在细胞相关的实验操作中，对于一些按常规方法难以转染甚至无法转染的细胞，通过病毒介导的实验能够大大提高基因的转导效率，以达到目的基因的高效瞬时表达。细胞相关的实验实验目的对于一些按常规方法难以转染甚至无法转染的细胞，通过病毒介导的实验能够大大提高基因的转导效率，以达到目的基因的高效瞬时表达。实验流程1.根据目的基因相关信息（序列，序列号等），构建含有外源基因或siRNA的重组载体；2.对于测序正确的重组质粒，提取和纯化高质量的不含内毒素的重组质粒；3.使用高效重组载体和病毒包装质粒共转染293T细胞，进行病毒包装和生产，收集病毒液；4.浓缩、纯化病毒液；5.用高质量的病毒液感染细胞；6.通过定量PCR精确测定病毒滴度（高精确滴定方法）和Western分析实验结果；7.用高质量的病毒液感染宿主细胞；检测基因功能或者siRNA的沉默效率以及使用药物进行稳定转染细胞株的筛选，通常状况下，筛选的细胞克隆株具有长期的表达稳定性。病毒液足够用于一般的动物活体实验。慢病毒使用操作手册1慢病毒使用操作2慢病毒安全使用规范3悬浮细胞感染方法概要4相关专业术语5细胞培养器皿的相关参数1、慢病毒使用操作手册1.1慢病毒的储存与稀释:1.1.1病毒的储存：用户收到病毒液后在很短时间内即使用慢病毒进行实验，可以将病毒暂时放置于4℃保存；如需长期保存请放置于-80℃（病毒置于冻存管，并使用封口膜封口）A．病毒可以存放于-80℃6个月以上；但如果病毒储存时间超过6个月，我们建议在使用前需要重新滴定病毒滴度B．反复冻融会降低病毒滴度：每次冻融会降低病毒滴度10%；因此在病毒使用过程中应仅尽量避免反复冻融，为避免反复冻融我们强烈建议客户收到病毒后按照每次的使用量进行分装。1.1.2病毒的稀释：用户需要稀释病毒时，请将病毒取出置于冰浴融解后，使用培养目的细胞用PBS或无血清培养基(含血清或含双抗不影响病毒感染)混匀分装后4℃保存(请尽量在三天内用完)分装后使用。1.2慢病毒用于体外（InVitro）实验：感染培养原代细胞和建系细胞1.2.1慢病毒对各种细胞和组织的亲嗜性不同，用户使用Invabio提供的慢病毒之前可以通过查阅相关文献，了解慢病毒对您的目的细胞的亲嗜性，感染复数（MOI值）以及在体（InVivo）注射所需要的病毒量。如果没有相关文献支持，可以通过感染预实验得到合适的感染复数（MOI值）（使用24孔板检测病毒对目的细胞的亲嗜性）1.2.2慢病毒感染目的细胞预实验1.2.2.1慢病毒感染目的细胞预实验注意事项A．测定慢病毒对目的细胞的亲嗜性时，需要同时设置对慢病毒亲嗜性较高的细胞(HEK293T，Hela）作为平行实验的对照细胞。B．在进行慢病毒感染实验时,可以用完全培养基（培养目的细胞用）稀释；理论上，含有血清，双抗或者其他营养因子的完全培养基不影响慢病毒的感染效率。C．Invabio提供的病毒单位为TU/ml,即每毫升中含有具有生物活性的病毒颗粒数。如：病毒滴度为1X108TU/ml即每毫升病毒液中至少含有1X108个具有生物活性的慢病毒颗粒。1.2.2.2以24孔培养板为例，进行目的细胞和HEK293T细胞的感染预实验实验前按照不同的MOI设置不同的感染孔，并根据MOI和细胞数量计算所需要的病毒量，如有必要可以使用PBS溶液或者无血清培养基稀释病毒原液第一天，准备细胞：在24孔培养板接种若干孔，每个孔内接种3~5X104个目的细胞，铺板时细胞的融合率为50%左右，每孔培养基体积为100μl；进行病毒感染时细胞的融合度约为70%左右。第二天，准备病毒：取出4℃保存的病毒，使用台式离心机离心20秒（使病毒完全悬于离心管底部即可）；如果是冻存在-80℃的病毒需要先在冰上融化后使用。亦可以根据实验室的实际情况将按照MOI准确计算好的慢病毒稀释到培养基中，并尽可能保证所获得的含有慢病毒的培养基的总体积为最小体积，以期获得最佳的感染效率。第二天，感染目的细胞：病毒准备好之后，从培养箱中拿出细胞，首先观察细胞生长状态，如细胞状态较好则开始实验a使用移液器吸取准确体积的病毒液加入准备好的培养基b吸去培养基的培养器皿中的培养基（如果细胞生长良好，密度适宜，则不用换液）c在目的细胞和对照细胞中分别加入计算好的病毒液d混匀后放于二氧化碳培养箱（37℃、5%CO2）孵育过夜注：感染前细胞的状态好坏对最终的感染效果高低影响很大，所以务必保证加病毒之前细胞处于良好的生长状态亦可以将预先准备好的培养基和慢病毒的混合液直接加入培养器皿中慢病毒对目的细胞的感染效率较低，通过提高MOI值可以提高病毒的感染效率，但是当MOI高于20时，我们建议客户在培养基中加入ploybrene（8μg/ml左右）来提高病毒的感染效率。A．第三天，更换培养液：一般在24小时候后将含有慢病毒的培养液更换成正常培养液；在感染后观察细胞状态，如果慢病毒对细胞有明显毒性作用而影响细胞生长状态，可以最短在加病毒4小时候更换新鲜培养液后继续培养（建议在8-12小时更换为宜）。第一次换液后，如果慢病毒对细胞没有明显毒性作用，按照正常培养条件培养换液。B．第六天，感染效率检测：在倒置荧光显微镜观察荧光，估计慢病毒感染目的细胞的效率；如何由于目的基因较大而造成选择的载体不能携带MarkerGene的，可以通过Real-timeRT-PCR检测目的基因的表达来拍评估感染效率。注意：Invabio提供的病毒载体上带有GFP绿色荧光蛋白，用户可以在病毒感染96小时后用倒置荧光显微镜观察GFP绿色荧光，以观察病毒对目的细胞的感染情况。如果慢病毒载体携带其他MarkerGene如RFP\BFP可以用荧光显微镜在对应的激发光波长下观察荧光表达的情况慢病毒表达时间较慢，荧光表达所需时间较长，建议感染后96小时后观测荧光表达。感染后的细胞可以连续培养一周，通过观察荧光的表达时间和表达强度来确定慢病毒对目的细胞的感染情况。感染期间请根据细胞生长的情况对细胞进行及时换液，以保证细胞良好的生长状态。2、慢病毒使用安全使用规范Invabio提供的慢病毒为“自杀”性病毒，即病毒感染目的细胞后不会再感染其他细胞，也不会利用宿主细胞产生新的病毒颗粒。慢病毒中的毒性基因已经被剔除并被外源性目的基因所取代，属于假型病毒因此没有毒性作用。但该病毒仍然具有可能的潜在的生物学危险，I