医学文献检索pubmed

刘春艳北京大学医学图书馆信息咨询部[e-mail]生物医学数据库检索方法与技巧主要内容PubMed概况PubMed数据来源PubMed检索机制PubMed检索运算符PubMed检索方法结果的显示、打印、保存其他辅助功能1.PubMed概况创建机构：美国国家医学图书馆下设的美国生物技术信息中心(NCBI)1997年6月开始向全球开放特色：具有收录范围广、内容全、检索途径多、检索体系完备等特点，部分文献还可在网上直接免费获得全文。2.PubMed数据来源MEDLINE：[pubmed-indexedformedline]InProcessCitations：每天收录，尚未经规范处理的数据。[pubmed-inprocess]Publisher-SuppliedCitations：由出版商提供的电子文献，每条记录标有[PubMed-assuppliedbyPublisher]。3.PubMed检索机制自动转换匹配功能(AutomaticTermMapping)对于输入的检索词，PubMed先按一定的词表顺序进行对照匹配和转换，再进行检索。词表匹配转换顺序是：MeSH表期刊刊名表短语表作者索引如果在以上4个表中都找不到相匹配的词，PubMed将把短语分开，以单词为单位，分别重复以上的过程，检索时各个词之间是AND逻辑关系。如果仍找不到相匹配的词，则用单个词在所有字段查找，各个词之间也是AND逻辑关系。3.1自动转换匹配功能人重组三叶因子（humanrecombinanttrefoilfactor）(humans[MeSHTerms]ORhumans[AllFields]ORhuman[AllFields])ANDrecombinant[AllFields]AND(trefoilfactor[SupplementaryConcept]ORtrefoilfactor[AllFields])4.PubMed检索运算符逻辑运算符逻辑运算符①逻辑“与”运算AND：检索式写成AandB，表示文献中同时包含检索词A和检索词B的文献才是命中文献。AIDSandtherapy②逻辑“或”运算OR：检索式写成AorB，表示包含检索词A的文献或者包含检索词B的文献或者同时包含检索词A和B的文献为命中文献。AIDSorAcquiredImmunodeficiencySyndrome③逻辑“非”运算NOT：检索式写成AnotB，表示包含检索词A同时不包含检索词B的文献为命中文献。HepatitisnotAnimalIP地址：Leukemialeukaemia[AllFields]ORleukemia[MeSHTerms]ORleukemia[AllFields]PubMed网址基本检索高级检索主题检索临床咨询5.PubMed检索方法5.1基本检索5.2高级检索5.3主题检索5.4临床咨询5.1基本检索默认检索字段为主题、作者、期刊关键词、词(词组)或短语：⑴输入任意关键词：livercancer、Lungcancer；⑵带有双引号””作为短语检索：”cancertherapy”；⑶带有连接号”-”作为一个词组检索：interleukin-6。限制检索字段：如livercancer[ti]作者：SmithJ、仅知道作者姓，则必须加上字段标识，如：Smith[au]2002年以后的文献若文中有作者全称可用全称检索如：JoshuaLederberg5.1基本检索期刊刊名：⑴可用期刊全称：GENETHERAPY[TA]；⑵可用期刊简称：JAMA[TA]；(TheJournaloftheAmericanMedicalAssociation)复杂表达式：livercancerANDaflatoxin带有摘要文献的检索：livercancerANDhasabstract5.1基本检索分析该检索课题，包含两个方面：肝癌：livercancer；酒精：alcohol两个主题之间的逻辑关系是AND，即livercancerANDalcohol基本检索举例：肝癌和酒精的关系基本检索举例：肝癌和酒精的关系输入：livercancerANDalcohol“肝癌和酒精的关系”的基本检索结果5.2高级检索高级检索5.2高级检索分析该检索课题，包含两个方面：作者为：马大龙（madl）；作者单位为：北京大学（pekinguniversity）。高级检索举例：北京大学医学部马大龙教授发表的文献高级检索举例：北京大学医学部马大龙教授发表的文献输入：madlPekinguniversity高级检索举例：北京大学医学部马大龙教授发表的文献5.3主题检索根据medline数据主题标引的规范性，利用主题词进行的研究，对提高查全率、查准率会有相当的帮助。点击MeSHDatabase打开主题检索界面高级检索主题检索基本检索5.3主题检索主题词(headings)：直接、准确表达主题概念的词或词组。每个概念只能用一个主题词表达如：肿瘤cancerCarcinomaTumorNeoplasm……Neoplasm副主题词：用于对主题词的某一特定方面加以限定，强调主题概念的某些专指方面。如：治疗（therapy）、外科学（surgery）、代谢（metabolism）、诊断（diagnosis）主题词与副主题词之间的组配检索，起到对主题词的限定作用，是主题词具有更高的专指性，缩小检索范围，保证检索结果的准确性。如：白血病的药物治疗leukemia/drugtherapy但并不是每个副主题词和任何主题词都能进行组配使用，每个副主题词具有一定的专指性，其使用范围仅限于它后面括号内的类目。副主题词(subheadings)：TI-[Bisoprolol:opportunitiesinthetreatmentofhypertension].AB-Bisoprolol(bisoprololfumarate)--cardioselectiveblocker,doesnotpossessintrinsicsympathomimeticandmembranestabilizingactivity.Themainindicationsforbisoprololarearterialhypertension(AH)andheartfailure.Thisarticleprovidesanoverviewoftheliteratureonthepotentialusesofbisoprololinthetreatmentofhypertension.Thefeaturesofthepharmacokineticsofthedrug.Thedataontheeffectivenessofbisoprololinhypertensionandtolerabilityinpatientswithconcomitantdisorders……….AU-MinushkinaLOSO-Kardiologiia.2012;52(6):80-5.MH-Adrenergicbeta-1ReceptorAntagonists/administration&dosage/adverseeffects/pharmacokineticsMH-BiologicalAvailabilityMH-*Bisoprolol/administration&dosage/adverseeffects/pharmacokineticsMH-ComorbidityMH-*CoronaryDisease/complications/drugtherapy/physiopathologyMH-*Drugs,Generic/economics/pharmacokineticsMH-*HeartFailure/complications/drugtherapy/physiopathologyMH-HumansMH-*Hypertension/complications/drugtherapy/physiopathologyMH-PerioperativeCare/methodsMH-TherapeuticEquivalencyMH-TreatmentOutcomeMH-Adrenergicbeta-1ReceptorAntagonists/administration&dosage/adverseeffects/pharmacokineticsMH-BiologicalAvailabilityMH-*Bisoprolol/administration&dosage/adverseeffects/pharmacokineticsMH-ComorbidityMH-*CoronaryDisease/complications/drugtherapy/physiopathologyMH-*Drugs,Generic/economics/pharmacokineticsMH-*HeartFailure/complications/drugtherapy/physiopathologyMH-HumansMH-*Hypertension/complications/drugtherapy/physiopathologyMH-PerioperativeCare/methodsMH-TherapeuticEquivalencyMH-TreatmentOutcome主题检索举例：长春新碱（Vincristine）治疗白血病（leukemia）的文献分析该检索课题，有2个概念：长春新碱（Vincristine）、白血病（leukemia）：对长春新碱来说是利用其治疗疾病，故其应组配副主题词“治疗应用（therapeuticuse）”；对白血病来说是利用药物来治疗，故其应组配副主题词“药物疗法（drugtherapy）”。同时这两个概念之间是AND的关系。主题检索举例：长春新碱（Vincristine）治疗白血病（leukemia）的文献第1步：检索长春新碱/治疗应用主题检索举例：长春新碱（Vincristine）治疗白血病（leukemia）的文献第1步：检索长春新碱/治疗应用主题检索举例：长春新碱（Vincristine）治疗白血病（leukemia）的文献第1步：检索长春新碱/治疗应用副主题词主要主题词不扩展下位树主题检索举例：长春新碱（Vincristine）治疗白血病（leukemia）的文献第1步：检索长春新碱/治疗应用主题检索举例：长春新碱（Vincristine）治疗白血病（leukemia）的文献第1步：检索长春新碱/治疗应用主题检索举例：长春新碱（Vincristine）治疗白血病（leukemia）的文献第2步：检索白血病/药物疗法主题检索举例：长春新碱（Vincristine）治疗白血病（leukemia）的文献第2步：检索白血病/药物疗法主题检索举例：长春新碱（Vincristine）治疗白血病（leukemia）的文献第2步：检索白血病/药物疗法主题检索举例：长春新碱（Vincristine）治疗白血病（leukemia）的文献第2步：检索白血病/药物疗法主题检索举例：长春新碱（Vincristine）治疗白血病（leukemia）的文献5.4临床咨询和系统评价可以使用户方便快捷地检索到有关临床方面的文献，如临床疾病的诊断、治疗、病因和预后等；也可以用它来检索临床实践过程中遇到的一些具体问题，如系统性综述、元分析、临床试验、循证医学、实践指导以及有关遗传学方面的问题等。5.4临床咨询和系统评价临床咨询系统评价检索医学遗传学研究方面的文献6.结果的显示、打印、保存显示保存、打印6.1结果的显示