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ROMSTOOLS文件表的内容介绍安装系统要求获取文件教程︰南部格拉示例入门︰处理输入的文件构建网格让风和其他表面通量初始和侧边界条件得到的径流强迫编译模型配置参数︰param.h数值模拟和物理选项︰cppdefs.h编译脚本︰jobcomp运行模式长时间的模拟得到的结果诊断程序潮汐生物地球化学年度间模拟表面的强迫数据得到CFSR(推荐)从NCEP2再分析获取表面强迫数据QuikSCAT每月气候学数据获取侧边界条件运行年际运行的模型嵌套嵌套网格的制备编译和运行模型海洋预报︰Forecast_tools参考书目ROMSTOOLSUser的指南-ROMSTOOLS-吉尔达斯由布莱特PenvenPatrickMarchesiello和Laurent鲁研究所倒leDéveloppement(税务局)44大道de敦刻尔克,CS9000913572马赛楼cedex02法国介绍区域海洋建模系统(ROM)是新的一代海洋环流模式(Shchepetkin和威廉姆斯,2005年),已专为区域海洋系统的准确的模拟。读者可参考Shchepetkin和威廉姆斯(2003年)、Shchepetkin和威廉姆斯(2005年)为模型的完整描述。ROM已经申请区域模拟研究各种不同地区的世界海洋(例如Marchesielloetal.,2003年;Penvenetal.,2001年;麦克格雷迪etal.,2002年;海德福格尔等人,2000年;DiLorenzoetal.,2003年;Blanke等人,2002年)。若要执行区域模拟ROM,建模者需要提供特定格式的多个数据文件︰水平网格,海底地形表面强迫、侧边界条件......他还需要对模型输出分析。这里描述的工具原本是为了执行这些任务。目标是要能够建立一个标准的区域模型配置在最短的时间。安装系统要求利用matlab设计了这个工具箱。它需要至少2Gbites的磁盘空间。它已经过测试的几个Matlab版本从Matlab6到Matlab2012。主要测试在Linux工作站上,但它可以使用在任何平台上如果NetCDF和LoadDAPMatlabMex文件提供。NetCDFMatlabMex文件需要读取和写入到NetCDF文件,它可以在web位置找到︰。LoadDAPMatlabMex文件用于从年度间和预测模拟的简化服务器下载数据。它可以在web位置找到︰。MatlabLoadDAPMex文件提供任何简化可访问的数据读入Matlab方法。请注意,LibDAP图书馆之前必须先安装您的系统上安装LoadDAP。详细信息可以在web位置找到︰。MexCDF和LoadDAPmex文件为Linux提供(FEDORA32位系统︰mexcdf和Opendap_tools/FEDORA;系统CENTOS或FEDORA64bits:mexnc和Opendap_tools/FEDORA_X64),但他们不在所有平台上工作。在ROMSTOOLS包中包含所有其他必要Matlab工具箱(即海-气、面具、netcdf或m_map......)。全球数据集,例如地形(史密斯和桑德,1997年),水文(Conkright等人,2002年)或地表通量(DaSilvaetal.,1994年),也被包括在内。获取文件Allthenecessarycompressedtarfiles(XXX.tar.gz)containingtheMatlabprograms,severaldatasetsandothertoolboxesandsoftwaresneededbyROMSTOOLSarelocatedat文件。解压缩并解压所有文件(gunzip和焦油-xvf)。定义的不同的目录︰Aforc_NCEP︰用于恢复的表面迫使年度间模拟数据(基于CFSR再分析)的脚本。Aforc_QuikSCAT︰用于风应力回收卫星散射计数据(QuickSCAT)的脚本。CARS2009:CSIRO区域海洋地图集数据库。每月、季、年气候的温度、盐度、硝酸盐、磷酸盐和氧气COADS05︰目录表面通量全球每月气候学在决议(DaSilvaetal.,1994年)。编译︰空暂存目录ROM编译。Diagnostic_tools︰几个Matlab脚本动画和基本的统计分析。ROMSTOOLS用户指南文档︰位置。Forecast_tools︰脚本生成的业务海洋预报系统掩码︰土地掩模版工具箱开发的A.Y.谢尔比纳。mex60:MatlabNetCDF接口为32和64位Linux体系结构和旧的matlab版本︰6之前。mexcdf/mexnc:MatlabNetCDF接口为32和64位Linux体系结构中,直到R2008aMatlabR14sp1()。下一发行版的Matlab,R2008b,R2009a,它是mexcf的更简单,要么使用本机的NetCDF会matlab或使用最后一次发布版本的相同url上后R2008a。()mexcdf/netcdf_toolbox:MatlabNetCDF工具箱可用相同的mexcdf包中。m_map:Matlab映射工具箱()。Nesting_tools︰预处理工具用于编写嵌套的模型。netcdf_g77:NetCDFFortran库对于Linux,编译使用77国集团()。netcdf_ifc:NetCDFFortran库对于Linux,用ifort编译。英特尔Fortran编译器(ifort)是可在。netcdf_x86_64:NetCDFFortran库对于Linux,用ifort在64位体系结构上编译。Oforc_OGCM︰用于初始和侧边界条件从全球OGCMs(汽水(纸箱等人,2005年)或ECCO(口吃etal.,1999年))的年度间模拟恢复脚本。Opendap_tools:LoadDAPmexcdf和几个脚本,自动通过互联网下载数据。Preprocessing_tools︰预处理Matlab脚本(make_grid.m、make_forcing等。......)。河流︰脚本编写时变径流迫使文件并计算径流位置。RUNOFF_DAI︰戴伯斯全球河流流量和欧式放电每月气候学。()Roms_Agrif:ROMFortran来源。运行︰工作目录。这是ROM输入的文件生成的位置和运行模型的位置。SeaWifs︰表面叶绿素a气候学SeaWifs观察的基础。SST_pathfinder:SST全球每月气候学比COADS05,计算从AVHRR探路者观察从1985年到1997年的精细分辨率(9.28公里)。(凯西和科尔尼永,1999年)潮汐︰Matlab例程ROM潮汐模拟做准备。潮汐数据来自俄勒冈州立大学全球模型的海洋潮汐TPXO6和TPXO7(埃格伯特和Erofeeva,2002年)︰。Topo︰位置2上的全球地形数据集°分辨率(史密斯和桑德,1997年)。原始数据可以发现在︰TPX06︰目录全球模型的海洋潮汐TPXO6(埃格伯特和Erofeeva,2002年)。TPX07︰目录全球模型的海洋潮汐TPXO7(埃格伯特和Erofeeva,2002年)。Visualization_tools:Matlab脚本ROM可视化图形用户界面。WOA2009︰世界海洋地图集2009年全球数据库。引用列表︰WOAPISCES︰生物地球化学双鱼座数据(年度、季节气候学)全球数据集。引用︰铁和DOC:AumontetBopp,2006年寺,O2,NO3,从WOA2005PO4DIC及碱度来从Goyetetal。教程︰南部格拉示例本节介绍了编写和运行区域的ROM仿真的基本步骤。这是完成之后的南部的格拉在低分辨率和使用气候强迫在表面和边界模型的示例。入门︰处理输入的文件成功安装后,启动Matlab会话目录中︰~/Roms_tools/运行。运行start.m脚本来为此会话设置Matlab路径。在此步骤中此安装,您必须知道关于matlab安装和旅游计算机环境的事情︰我机32或64位体系结构是什么?为此做uname-a.我有的本机matlab安装库是什么?如果我有我的Matlab版本已经本机netcdf例程和图书馆,不必使用netcdf库提供的Roms_tools,所以从start.m文件中删除它.如果我将本机m_map例程已经跟我的Matlab版本了,我不需要使用netcdf库提供的Roms_tools,所以从start.m文件中删除它。对于这些问题,它可用于在matlab会话中编辑你matlab路径与matlab命令路径。在Roms_tools,提供了matlab一些NetCDF库︰mex60:matlab12(老),32和64位体系结构mexcdf/mexnc:matlab7,matlab2008,matlab2009,32位和64位体系结构在Roms_tools,还提供一些简化bin和图书馆︰Opendap_tools/FEDORA:LibDAP和LoadDAPbin和图书馆FedoraLinux发行版,32位体系结构Opendap_tools/FEDORA_X64︰相同的64位体系结构。然而,如果您的Linux发行版不同于Fedora,最好是要编译和安装由您自己的LibDAP和LoadDAP。现在你已经准备好创建新的配置。它是重要的是尊重以下的预处理步骤的顺序︰make_grid,make_forcing,make_clim。所有的预处理步骤,对于只有一个要编辑的文件︰~/Roms_tools/Run/romstools_param.m。此文件包含必需的参数为ROM输入NetCDF文件的生成。Romstools_param.m的第一节定义用于生成网格的配置参数。例如标题、工作目录或文件名称:%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%1-配置参数%使用的make_grid.m(和其他人......)%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%Rom标题名称和目录%ROMS_title=本格拉模型;ROMS_config='Benguela_LR';%%网格尺寸︰%lonmin=8;%最低[度东经]lonmax=22;%最大东经[度]latmin=-38;%最低latitudeF[度]latmax=-26;%最
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