ImageJ插件CASA使用

1.给ImageJ加载插件CASA。具体方法查看本人做的其它说明。2.打开要处理的视频。（1）fileopen找到要处理的视频。选中ConverttoGrayscaleOK.表示要处理的视频全部转换成图片并且转换成8bit灰度的图像。（2）ImageAdjustThreshold…设置阈值，一种方法是直接拖动滚动条，然后Apply，一种方法是Set设置两个值Apply。然后直接OK即可。然后关闭本窗口（3）PluginsCASAq,FrameRate(Framespersecond):用使用的视频总的Frame（张数）比上时间OK(可以修改其它参数，可参考另外的文件)（4）保存图像，先点击Paths窗口，然后点击ImageJ面板，FileSaveAs...3.CASA术语1、VCL=曲线速度(µm/s)。精子头沿其实际的曲线，即在显微镜下见到的二维方式运动轨迹的平均速度。检测细胞活力。2、VSL=直线速度(µm/s)。根据精子头在开始检测时的位置与最后所处位置之间的直线运动的时间平均速度。3、VAP=平均路径速度(µm/s)。精子头沿其空间平均轨迹移动的时间平均速度。这个轨迹是根据CASA仪器中的算法对实际轨迹平整后计算出来的；这些算法因仪器不同而有所不同，故不同CASA系统的数值不能直接相比较。4、ALH=精子头侧摆幅度(µm)。精子头沿其空间平均轨迹侧摆的幅度。以侧摆的最大值或平均数值表示。不同的CASA仪器用不同的算法计算ALH，故不同CASA系统的数值不能直接相比较。5、LIN=直线性。曲线轨迹的直线性。VSL/VCL。6、WOB=摆动性。精子头沿其实际轨迹的空间平均路径摆动的尺度。VAP/VCL。7、STR=前向性。空间平均路径的直线性。VSL/VAP。8、BCF=鞭打频率(Hz)。精子曲线轨迹越过其平均路径轨迹的时间平均速率。9、MAD=平均移动角度（度）。精子头沿其曲线轨迹瞬间转折角度的时间平均绝对值一般把q（张/s）改数值，用所有图像张数比上视频时间。