“生物银行”呼唤标准到来

有人称，中国的生物大数据时代到来了，但业内专家称此言为之尚早。如果生物样本库建设没有标准化，大家根据不同的标准做出来的临床实验结果千差万别，不可能形成生物大数据，更不可能走向数据共享，“生物银行”呼唤标准到来。11生物样本库又称为“生物银行”，因为它不仅是各类基础科学研究和临床实验的基础，也是将科研成果快速产业化并投入临床应用，开展转化医学的物质基础。但是，生物样本库的标准尚未建立。“有人说，中国的生物大数据时代到来了，我觉得言之尚早。如果生物样本库建设没有标准化，大家根据不同的标准做出来的临床实验结果千差万别，不可能形成生物大数据，更不可能走向数据共享。”上海分子医学工程技术研究中心主任、生物芯片上海国家工程研究中心副主任郜恒骏，在近日举办的第三届北京重大疾病临床资源库标准化建设国际会议的压轴报告中这样说。郜恒骏甚至戏称：“关于生物样本库的标准化问题，voa报道过，bbc也涉及过，但cctv还没有报道过。”简而言之，就是生物样本库的标准化建设在中国还有很大发展空间。不比数量，比质量和特色生物样本库主要是指标准化采集、处理、保存和应用健康和疾病生物体的生物大分子、细胞、组织和器官等样本，包括组织、全血及血液成分、核酸、尿、唾液、头发、指(趾)甲、母乳、大便、细胞株、骨髓、各种液体以及与这些样本相关的临床、病理、治疗、随访、知情同意等资料及其质量控制、信息管理与应用系统。生物样本库又称为“生物银行”，因为它不仅是各类基础科学研究和临床实验的基础，也是将科研成果快速产业化并投入临床应用，开展转化医学的物质基础。生物样本库因此得到了世界范围内的重视。英国生物样本库于1999年设立，在英国6个中心范围内收集超过50万份样本。美国也在1987年建立了国家级肿瘤组织库，由6所大型教学医院进行标准化的标本采集、储存和管理，已拥有70万例标本。我国在1994年建立了中华民族永生细胞库。当科学研究进入到功能基因组时代，研究深入到dna、rna和蛋白质水平时，科学研究对生物样本的质量要求更高。但是在郜恒骏看来，国内的许多生物样本库走错了方向：铆足了劲，比拼生物样本库的数量、库藏生物样本的数量，却忽视了生物样本库的质量建设及标准推进。根据2009——2011年中国医药生物技术协会生物样本库分会对全国69家医院生物样本库调研，生物样本库重复建设和数量比拼的弊端暴露了出来。经调查，用于功能基因组研究的生物样本库存在许多问题，如保存方式单一，仅用石蜡或液氮;收集不配对;收集不全面，仅收集了组织，缺乏血(全血、血清、血浆)或缺乏重要体液;临床信息不规范、不完整：非常缺乏规范治疗后的疗效观察与随访资料等。郜恒骏坦承，收集样本的主体——医院也存在各种问题：缺乏样本采集及管理标准化流程、有效的样本质控体系、规范的样本运输过程管理;缺乏样本的安全保障设施、样本的信息管理系统;缺乏一支训练有素的专业队伍，医院、科室、专家之间，基础、临床、产业之间，相互封闭、条块分割……总而言之，生物样本库缺乏统一的标准、规范的培训，缺乏严格的质控、统一评估的论证机构和有效的共享应用机制。“现在的情况是，‘精品库’很少，病理检查根本达不到要求的‘垃圾库’却为数不少，有好的样本，但是使用率非常低的‘死库’也有很多。”郜恒骏痛心疾首。郜恒骏认为，生物样本库要比拼的不是数量，而是质量和特色。所谓的质量，一是生物样本库的样本要符合规范，二是生物样本库的资源要“物尽其用”，提升使用率。特色，就是各个地区的生物样本库要按照地区的样本特色来建立，而不是贪大求全。信息质量同等重要而对上海新华医院生物样本库临床信息部主任王伟业而言，生物样本库不仅要注重上述“物理质量”，还要看重“信息质量”，这也是其从另一个角度来分析生物样本库为何难以共享的原因。华大基因董事长汪建在该会议上表示，不论未来是对癌症易感基因的挖掘，还是对高血压、高血脂等常见疾病的基因探索，重要的不是基因测序的平台，而是大规模样本的“决战”。“样本好不好是关键。”汪建说。王伟业认为，生物样本的信息质量决定了样本“好不好”。王伟业表示，作研究，选择生物样本库就像挑选团队成员，必须对“成员”十分了解。生物样本库的信息只有能描述该样本的特性，才能够判定样本资源是否适合这项研究。生物样本的运用有两大趋势：一是样本收集以后，获得一定已经存在的信息，再根据这些信息继续获得更多、更详细的信息;二是通过样本信息来证明临床观察的结论。“一类基础研究是提出假设，再设计问题，经过实验证明假设;而以发现为基础的这一类研究，生物样本的信息可以直接对实验进行分组管理，因此生物样本库对其影响更大。”王伟业说。我们是否有足够的信息来表达所拥有的生物样本的特性?王伟业遗憾地表示，根据其积累的经验看，发现生物样本缺少的就是足够的信息，因此无从对生物样本进行足够了解，从而很难与不同团队进行合作研究。缺少足够信息，一则是由于信息标准的缺位，无法共享互补。“大家说不同的语言，要有翻译来帮助交流。生物信息也如此，如果对生物样本通过不同的标准进行处理，就会造成研究结果有差异。”王伟业表示，生物信息处理手段的统一化很重要，就好比“说同一种语言才能沟通和共享”。二则是因为精细化科学的发展对生物样本的信息提出了更高要求。“例如，不能简单判定为‘肿瘤的样本或者糖尿病?装型的样本’，因为同样是糖尿病?装型的样本，有些样本的提供者可能受到了生活习惯或者家族史的影响，有些人可能没有，这在样本中应该体现和区分，‘粗判’的样本对于科学研究意义不大。”王伟业说。中国科学报rsdsyrx重庆大坪医院