吉浦迅2011GPU高性能技术研讨会

号（交大）浩然高科技大厦4月21日广州中山大学药学院中国广州大学城外环东路132号4月22日哈尔滨哈尔滨工业大学Page3现场演示内容系统：Windows7CUDA3.2演示软件：JacketforMatlab：Jacket是一款加速Matlab应用的软件CUMACH：是一款用于全基因组数据处理,补全操作的软件.VMD：是一个分子可视化程序，该程序采用3D图形以及内置脚本来对大型生物分子系统进行显示、制成动画以及分析等操作系统：LinuxCentOS5.3CUDA3.2演示软件：NAMD2.7：是用于在大规模并行计算机上快速模拟大分子体系的并行分子动力学代码Amber11：是著名的分子动力学软件，用于蛋白质、核酸、糖等生物大分子的计算模拟Gromacs：是另一款著名的分子动力学软件.Inspect：是一款质谱数据处理和比对的软件Windows平台Linux平台Page4JacketforMatlab/Windows7吉浦迅科技产品经理：马一清演示环境：ASUSESC2000w/1xC2050流体波浪模拟：40倍提速粒子碰撞模型：300倍提速FTDT模型（电磁、地质地震）：6~35倍提速心跳图模拟：192倍提速Page5CUMACH/Windows7Demo重点：1.CUMACH是一款国人自行开发，用于全基因组数据处理,补全操作的GPU软件2.100倍速度提升效果吉浦迅科技产品经理：马一清演示环境：ASUSESC2000w/1xC2050操作系统：Windows7CUDA3.2由於该软件作者尚未完成『软件着作』程序因此未获得作者授权，故暂不提供效果图片但已获授权可於现场执行DemoPage6VMD(VirtualMolecularDynamics)1.8.6/Windows7NVidia市场开发经理：AllanHou演示环境：ASUSESC2000w/1xC2050操作系统：Windows7CUDA3.2Demo重点：1.3D效果（搭配3D投影仪+3D眼镜）2.40倍速度提升效果Page7现场宣传品手提袋礼品杯Page8现场宣传品公司手册Page9现场宣传品易拉宝与横幅光盘合作单位中山大学药学院中山大学药学院是原中山大学和中山医科大学两校合并后于2002年6月成立的第一个新学院。学院以中山大学生命科学学院药学系为基础，整合了中山大学生命科学学院、化学与化学工程学院以及医学院有关药学科学研究的资源，以中山大学的综合力量为依托组建而成。Page12会议流程13:00-14:00签到14:00-14:10广州中山大学信息与科技研究院罗院长致辞14:10-15:00广州中山大学药学院徐俊教授演讲：15:00-15:40NVIDIA市场开发经理讲解15:40-16:10吉浦迅科技产品经理讲解16:10-16:30相关软件在GPU超级计算机上的加速效果演示（AMBER，NAMD，VMD，CUMACH，INSPECT，MATLAB/JACKET）现场答疑Page13现场照片原计划40人的会议，现场来了大概50人。分别来自于中山大学药学院、中山大学信息与科技研究院、华南理工大学、深圳大学和广东水利水电职业技术学院。（座位一直不停地增加）Page14现场照片中山大学信息与科技学院院长致辞Page15现场照片中山大学药学院徐教授主题演讲——“超级计算与生物时代“。现场展示ASUSESC2000超级计算机Page16现场照片NVIDIA市场开发经理AllanHou介绍NVIDIA公司和GPU的发展Page17现场照片吉浦迅CEOHawkChen主题演讲——“生化与GPU结合”，详细介绍了BIO相关软件及效果简介合作单位上海交通大学Bio-X研究院是于2005年由NHGG(NeuropsychiatricandHumanGeneticsGroup,神经精神与人类遗传学研究室)和2000年成立的Bio-X生命科学研究基地经过重组凝练而成。中心围绕“大生物学（TheGreatBiology）”中的4个碱基统一整个生命界的主题思想，在生命科学内交叉所有可能的学科；而且，鉴于生命体包含着通过其它学科的原理运行并与其它学科永恒地相互作用构成“生态体”的事实，在校内外尽可能交叉非生命学科专业的相关学科。Page20会议流程13:00-14:00签到14:00-14:10上海交大Bio-X研究院副院长陈教授致辞14:10-15:00上海交大Bio-X研究院师博士演讲：15:00-15:40NVIDIA市场开发经理讲解15:40-16:10吉浦迅科技产品经理讲解16:10-16:30相关软件在GPU超级计算机上的加速效果演示（AMBER，NAMD，VMD，CUMACH，INSPECT，MATLAB/JACKET）现场答疑多人，来自于上海交大、同济大学、西安交大、上海大学Page24现场照片上海交大Bio-X研究院副院长陈教授致辞Page25现场照片上海交大Bio-X研究院师博士做《CUDA技术初尝试》演讲师博士详细介绍了SHEsisImp(CUMACH)，这是其带领的课题组为全基因组关联分析研究专门开发的Imputation工具，是对SHEsis遗传分析软件平台的又一次拓展，其核心算法是由MACH发展而来。基于CUDA架构的TeslaGPU计算解决方案，在师博士的应用中初步获得了30-50倍于四核CPU的计算速度。Page26现场照片NVIDIA市场开发经理AllanHou介绍NVIDIA公司和GPU的发展Page27现场照片吉浦迅科技产品经理马一清主题演讲——“生化与GPU结合”，详细介绍了BIO相关软件及效果简介Page28合作单位中国科学院苏州纳米技术与纳米仿生研究所（简称中科院苏州纳米所）由中国科学院与江苏省人民政府、苏州市人民政府和苏州工业园区共同出资创建中国科学院苏州纳米所学科布局将有别于传统的设置方式，通过前沿学科交叉，把纳米科技与信息科学，生命科学和物理以及化学等学科结合起来，实现微电子技术到纳米电子技术的无缝过渡；开发智能型微观医疗诊断技术和微观治疗技术。纳米所外观会议举办地Page29会议流程13:00-14:00签到14:00-14:10苏州工业园区科技局领导致辞14:10-14:20苏州中科院纳米所领导致辞14:20-15:00广州中山大学药学院徐俊教授演讲：15:00-15:40NVIDIA市场开发经理讲解15:40-16:10吉浦迅科技产品经理讲解16:10-16:30相关软件在GPU超级计算机上的加速效果演示（AMBER，NAMD，VMD，CUMACH，INSPECT，MATLAB/JACKET）现场答疑Page30现场照片参加者：苏州政府领导：2苏州纳米所科研人员：30苏州医工所科研人员：10本地生物科技公司：10西交利物浦大学：5国科数据中心工程师：5Page31现场照片苏州科技局处长致辞Page32现场照片纳米所副所长致辞Page33现场照片基因组范围的叠合算法刚性分子对接算法信号转递网络模拟算法基因发现与比较算法柔性分子对接算法经典分子力学模拟算法细胞间代谢调控信号模拟算法蛋白质机相互作用模拟细胞膜模拟细胞分化模拟计算复杂度兆次浮点运算/秒中山大学药学院徐教授主题演讲——“超级计算与生物时代“。他表示计算极限的突破引发生物革命提前爆发。Page34现场照片NVIDIA市场开发经理Allan主题演讲——“GPU与生命科学”，并做了生动的现场演示Page35现场照片吉浦迅科技产品经理马一清主题演讲——“生化与GPU结合”，详细介绍了BIO相关软件及效果简介Page36现场DemoPage37现场交流会议结束后不断有客户针对应用的问题进行技术交流未完，下面的巡展更精彩！