用MS进行石墨烯建模导入VASP

用materialstudio构建石墨烯模型弄了好久，终于会构建石墨烯模型了，看了好多帖子，觉得都写的不是很详细，对于新手来说，有些困难，所以特发此贴。越简单的问题越容易被人忽略~1、打开materialstudio，新建一个工程，导入石墨graphite.msi（也可以自己build，然后添加原子）。2、build-makep1（目的是消除对称性，这样才能够删除一层原子）。3、删除一层原子（选中原子-delete）。4、修改晶格参数：build-crystal-rebuildcrystal，设置方位角α=90。,β=90。,γ=60。5、构建supercell（方便掺杂，也为了好看）：build-symetry-supercell，构建一个5x5x1的超原胞。6、cleavesurface（为了能够添加真空层）：build-surface-cleavesurface,(h,k,l)改为（0,0，-1）7、添加20埃真空层（添加真空层是为了减小层与层之间的影响，至少20埃，大点没关系，最多是计算时时间长一点）：build-srystal-buildvacuum。构建好后，模型如下：接下来，在export导出*.p的文件，就可以用于vasp计算了。最近为了在VASP中弛豫石墨烯，要在在MS中建立石墨烯模型，总结了一下步骤，仅供参考：1、打开materialstudio，新建一个工程，import石墨graphite.msi，在structure/ceramic中2、build-makep1（目的是消除对称性，这样才能够删除一层原子）。3、删除一层原子（选中原子-delete），并移动剩下的原子到中间。4、构建supercell（方便掺杂，也为了好看）：build-symetry-supercell，构建一个6*6*1的超原胞，这样建立的超胞模型是扶手型。要建立锯齿状的，在建立supercell之前，buildsymmetryfindsymmetry,然后imposesymmetry，此时只显示两个原子，然后建立supercell，6*6*1（如果需要supercell是斜六面体，这样就可以了，如果需要矩形，继续下一步）5、修改晶格参数：build-crystal-rebuildcrystal，设置方位角和length。由斜六面体改为矩形首先改方位角，如果只改方位角，会发现周期性边界变化，所以还要修改length，修改以后变成矩形。我的是6*6*1,a：12.78，b:12.29996、下面就是需要导出到VASP中点击castep计算energy，保存file，到相应文件夹下找到graphite(66-cub).cell文件，此文件为隐含文件，打开，把相应的latticeparameter和坐标拷到POSCAR，就搞定了。一、1先导入石墨（陶瓷文件里有），然后build---surfacecleave,此时注意hkl的选取以及uv的方向的选取；然后点击确定即可。2加真空层的厚度，在BUILD--CRYSTAL有vacumm选项，注意厚度的选择，一般大于15，3然后做超胞即可，superwell选项二、导入graphite（inthefileofstructure-ceramics),然后build-Symmetry-makeP1.然后切掉中间一层。然后切掉其中一层，将剩下的一层移到c轴中间附近。bulid-Symmetry-findsymmetry-imposesymmetry。这样就得到了honeycomblatticeprimitivecell。如果需要大片结构，可以用bulid-symmetry-Surpercell来构建。。。得到菱形格子。如果需要正交格子，将primitivecell通过supercell2*2然后，然后留下立方格子的4个原子，其他切掉。重新构建晶格，build-rebuild晶格参数，a=4.26，b=2.46，c=15。（通过几何换算得出，或者又构型量出）角度全为90度。如果需要更大体系，同菱形，用supercell创建