Cytoscape软件画图说明

Cytoscape软件画图说明1、画图前，先准备两个输入文件。2、打开cytoscape软件，导入数据。导入edge.txt文件点击File----Import----Network点击ok得到原始图形节点1，文件中第一列节点2，文件中第2列连接类型，文件中第3列点击layout----ApplyPreferredOut改变图形排列方式此处可以用鼠标在画布中拖动图形到合适的位置。改变画布背景。点击左侧ControPanel----Style---network---Backgroudpaint设置节点之间连线的宽度和颜色ControPanel----Style---Edge宽度颜色导入node.txt个文件点击File----Import----Table设置节点图形属性ControPanel----Style---Node1、node大小通过设置Height和Width来控制大小2、Node性状通过设置Shape来控制3、Node填充色通过设置FillColor来控制4、Node标签的设置点击Properties--LabelPosition点击LabelPosition来设置标签位置。这里是一个示范操作，要细致调整标签位置还是要设置Column和MappingType两个参数。设置完成之后图形调节节点之间的距离点击layout----Scale鼠标拖动最后，画图导出成pdf文件点击File----Export----NetworkViewasGraphics