细菌的分类和鉴定

一、微生物的分类根据微生物的大小、结构、组成等分三类原核细胞型如：细菌、放线菌、螺旋体、支原体、衣原体、立克次体。（也称广义的细菌）真核细胞型如：真菌、原虫非细胞型如：病毒、亚病毒、朊粒二、细菌的分类方法根据每种细菌各自特征，并按照它们的亲缘关系分类，分类方法有两类1.生理学与生化学分类法（传统方法）2.遗传学分类法（一）生理学与生化学分类法主要以细菌的形态、染色以及细菌的特殊结构为最基本的分类依据，其它依据还包括细菌生长条件等等。主要有两种方法1、传统分类法2、数值分类法1、传统分类法主要以细菌的形态、生理特征为分类基础，选择一些较稳定的生物学性状如细菌的形态结构、染色性、培养特性、生化反应、抗原性等作为依据，然后按主次顺序逐级区分。2、数值分类法对细菌各种生物学性状按“等重要原则”进行分类，选用多项生理、生化指标逐一进行比较，通过查表或计算机分析各菌间相似度，完成细菌分类。（二）遗传学分类法以细菌的核酸、蛋白质等在组成的同源性程度分类。主要有三种方法1、DNAG+Cmol%测定2、核酸同源值测定3、核蛋白体RNA碱基序列测定1、DNAG+Cmol%测定DNA分子两条链上4种碱基的总分子量为100，测定其中G+C或A+T摩尔百分比，能反应出细菌间DNA分子的同源程度，习惯上以G+C作为细菌的分类标记。不同菌属间的G+Cmol%范围很大，在25%~75%之间，但同一种细菌G+Cmol%相当稳定，不受菌龄、培养条件和其它外界因素影响，亲缘关系越近的细菌，它们G+Cmol%越接近（但并非G+Cmol%越接近，亲缘关系就越近？？？）。2、核酸同源值测定为什么不能说G+Cmol%越接近，亲缘关系就越近？因为G+Cmol%只能反映细菌的碱基总数而不能反映碱基序列！！！而利用DNA分子杂交的技术就可以精确测定DNA分子的碱基序列。这就是核酸同源值测定。3、核蛋白体RNA碱基序列测定核蛋白体RNA碱基序列测定属于核酸范畴。由于核蛋白体RNA（rRNA）序列比较保守，其变化十分缓慢。其中，16srRNA具有高度的保守性和特异性以及该基因序列足够长，因此，被作为细菌鉴定的快速、准确方法，素有“细菌化石之称”。（三）两类分类法的优点和意义方法优点意义生理学与生化学分类法方便、简单、廉价主要用于鉴定遗传学分类法准确、可靠；有利于了解细菌的进化和原始亲缘关系主要用于分类三、原核微生物（广义细菌）分类系统《伯杰鉴定细菌手册》(Bergey’sManualofDeterminativeBacteriology)伯杰氏手册:是目前进行细菌分类、鉴定的最重要参考书，其特点是描述非常详细，包括对细菌各个属种的特征及进行鉴定所需做的实验的具体方法。四、细菌的分类等级界（Kingdom）门（Phylum）纲（Class）目（Order）科（Family）属（Genus）种（Species）五、细菌的命名（一）细菌的命名依据“国际细菌命名法规”的规定，学名用拉丁文，遵循“双名法”。即每一种细菌的拉丁文名称由属名和种名两部分构成，属名第一个字母必须大写，其余均应小写（即使种名以人名或地名命名）。整个属名及种名在出版物中应排成斜体。如：Escherichiacoli属名+种名属名重复出现，可缩写如：E.coli（大肠杆菌）；只确定属名，未确定种名的某一株细菌Salmonellasp.（沙门菌属）；只确定属名，未确定种名的若干菌Salmonellaspp.亚种用subsp.（正体）表示Pasteurellamultocidasubsp.septica几种不同的书写情况五、细菌的命名（二）六、微生物分类鉴定的依据根据微生物分类学中使用的技术和方法，可把它们分成四个不同的水平：①细胞形态和行为水平；②细胞组分水平；③蛋白质水平；④基因组水平。在微生物分类学发展的早期，主要的分类鉴定指标是以在细胞形态和习性为主，可称为经典的分类鉴定法七、细菌的分类方法生物分类的传统指标分子生物学指标微型、简便、快速或自动化鉴定技术细菌的数值分类形态学特征生理、生化学特征从不同层次，用不同学科的技术方法来研究和比较不同微生物的细胞、细胞组分或代谢产物，从中发现反映微生物类群特征的资料。八、生物分类的传统指标（一）形态学特征包括培养特征、细胞形态及其染色特性、特殊的细胞结构、运动性等等。形态学特征指标特点：易于观察和比较，尤其是真核微生物和具有特殊形态结构的细菌；许多形态学特征依赖于多基因的表达，具有相对的稳定性；（二）生理生化特征包括营养类型、与氧的关系、对温度的适应性、碳水化合物的代谢试验、蛋白质和氨基酸的代谢试验及的碳源和氮源利用试验、各种酶类试验、抑菌试验等等。生理生化特征特点：对微生物生理生化特征的比较也是对微生物基因组的间接比较；测定生理生化特征比直接分析基因组要容易；（二）生理生化特征包括营养类型、与氧的关系、对温度的适应性、碳水化合物的代谢试验、蛋白质和氨基酸的代谢试验及的碳源和氮源利用试验、各种酶类试验、抑菌试验等等。生理生化特征特点：对微生物生理生化特征的比较也是对微生物基因组的间接比较；测定生理生化特征比直接分析基因组要容易；