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X-Y平面内平移选定的对象SHIFT+鼠标中间拖动X-Y平面内平移选定的对象SHIFT+ALT+鼠标右键拖动相对屏幕水平移动选定对象SHIFT+X+鼠标中间拖动相对屏幕竖直移动选定对象SHIFT+Y+鼠标中间拖动相对屏幕垂直移动选定对象SHIFT+Z+鼠标中间拖动相对屏幕水平移动选定对象SHIFT+ALT-鼠标水平移动相对屏幕竖直移动选定对象SHIFT+ALT-鼠标竖直移动相对屏幕垂直移动选定对象SHIFT+ALT-Z-鼠标移动沿着XY轴旋转选定对象SHIFT+鼠标右键在靠近窗口中央拖动沿着Z轴旋转选定对象SHIFT+鼠标右键窗口边缘拖动绕X轴旋转选定对象SHIFT+X+鼠标右键拖动RotateselectedobjectsaboutYSHIFT+Y+鼠标右键拖动RotateselectedobjectsaboutZSHIFT+Z+鼠标右键拖动开始添加原子空白处单击鼠标在已有原子上再加原子在原子上单击创建化学键先后单击这两个原子XY方向平移原子单击原子并拖动。合并两个原子把一个拖到另一个上移动已画原子鼠标拖动它前后移动已画的原子ALT+鼠标左键拖动改变已画化学键的长度SHIFT+ALT+鼠标左键拖动添加原子并停止草画左键双击停止草画ESC停止草画单击活动窗口以外地方改变化学键的数目单击化学键在化学键中插入原子ALT+单击化学键替换元素ALT+单击原子画原子团片断功能按键建立独立原子团空白处单击向原子上添加原子团单击头上的原子添加原子团并旋转在头上原子单击并拖动结合两个原子团片断ALT+分别单击两个原子团头上的原子改变原子团结合点双击原子团头上的原子建模时加入杂原子的方法方法一:用鼠标点上将要被取代得原子(点上后原子颜色将变成黄色),在窗口的右边属性栏中,将会显示这个原子的相关属性,并告诉你这个原子的元素种类(比方是Al吧),然后点这个元素种类Al,将出现一个元素周期表,选择你要掺杂得原子,确定就可以了!方法二:建立完没有掺杂的晶胞后,选supercell,然后再选择要替换的原子,进行掺杂.如果不把晶胞的对称性改为supercell就不能改变其中的一个原子,而是由于对称性把同一元素的所以原子改变了采用DMOL3建模的基本步骤第一种情况:从程序自带的各种晶体及有机模型中导入体系的晶胞打开MS,由fileimportstructuresmetals\pure-metalsFe导入Fe的晶胞。由buildSurfacescleaveSurfaces打开对话框。在对话框中输入要建立的晶面(hkl),选择position,其中depth控制晶面层数。进入buildSupercell,输入A、B、C的值,得到想要的超晶胞。到该步骤,我们已经建立了一个周期性的超晶胞。如果要做周期性计算,则应选择buildCrystalsbuildvaccumslab,其中真空层通常选择10埃以上。如果建立团簇模型则选择buildSymmetryNon-periodicStructure,去掉模型的周期性,并跟据自己的实际需要删除部分原子,得到想要的团簇模型。在表面插入分子时通过菜单栏上的几个小图标添加即可。第二种情况:手动建模,优点是可控制晶格常数。首先从文献中查到晶体的晶格常数的实验值。打开buildCrystalsbuildcrystals,可见到对话框。在对话框中选择空间群与点群,然后在LatticeParameter中设置晶胞基矢的长度及夹角。然后打开buildAddatom,从对话框中输入坐标。这里只需输入几个有代表性的原子的坐标,不必全部输入。在坐标输入前首先在option页面中选择coordinatesystem,或者分数坐标或者卡迪尔坐标。以下步骤重复2-5步。需要注意的是,采取什么样的团簇并不是任意的。原因是很多模型构造出来后在优化过程中往往不收敛。要避免这个问题的办法是查阅文献,参考文献上模型进行选取,因为它们的模型通常是经过试验证实收敛的。关于计算参数设置1.主要有几个参数需要注意,对于Electronic页面,需要注意的是Coretreatment,对于过渡金属原子通常需要考虑相对论效应,因此一般不使用AllElectron方法。其他几种方法任选。Basisset应为DNP,Setup下的Quality一般选fine。为了提高计算速度,一个较好的办法是先用粗糙的Basisset和Quality进行优化,然后再提高精度。2.还有一个非常重要的选项是ElectronicMoreSCF里的Usesmearing。这个关键字有助于加快收敛,但是设的多大往往会产生错误的结果,它也相当于允许的误差范围。具体设置办法可参考help。
本文标题:MS中各种操作
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