生物信息学-本科生版-期末考试试题(机考)

第1页共2页暨南大学考试试卷注意：1.本考试只有相对正确的答案，无论你如何作答，只要写出足够强的论证的理由和过程来支撑你的观点，并且不违反课程内讲授的基本原理，即算正确。2.考试形式为机考，请自备电脑。回答可直接写在本文件里，要写出过程和明确的结论。最终答卷以PDF形式现场提交以避免乱码和篡改，文件名请统一命名为“学号-姓名.pdf”，例如2013042213-张三.pdf。不按此格式命名文件名者将一律没有成绩！3.考试完毕，请用U盘将写好的报告PDF文档拷到监考老师的电脑上，或于考试结束后15分钟内发邮件至[e-mail]，注明主题“期末考试”。4.本试卷分为4小题，各题分数分别为20、30、30、20分，满分100分。人卵细胞受精到胚胎发育极早期，经历如下阶段：-卵细胞(oocyte)-前核(pronuclei)-受精卵(zygote)-2-细胞期-4-细胞期-8-细胞期-桑椹胚(morula)为研究在发育过程中的转录调控，研究者对以上时期的细胞进行了单细胞测序。测序仪使用IlluminaHiSeq-2000，采用双端100nt测序方式。测序数据的第一端用FANSe2算法云分析平台进行一键式定量分析，得到28个基因表达定量文件(*_SVmerge.txt)。请通过推理和分析，回答以下问题：1.真核生物中，同一个基因往往可以通过可变剪切的方式，生成若干个不同的剪切变体。请问云平台分析的这批数据，是如何处理同一基因的不同剪切变体的？这种测序方式有没有可能定量不同的剪切变体？为什么？教师填写2014-2015学年度第____2____学期课程名称：生物信息学（本科生版）授课教师姓名：张弓考试时间:2015年7月6日课程类别必修考试方式开卷(机考)试卷类别(A、B)[-]共1页考生填写学院(校)专业班(级)姓名学号内招[]外招[]暨南大学《生物信息学（本科生版）》试卷考生姓名、学号：第2页共2页2.Oocyte,zygote,pronuclei,morula阶段都做了生物学重复，请问其重复性好不好？如果不好，有哪些因素会造成重复性不好？会不会影响结论？3.发育生物学课本上就已经说道，2-细胞期、4-细胞期、8-细胞期的每一个细胞都不一样。受精卵已有植物极和动物极之分，在第一次卵裂的2-细胞期中，植物极和动物极被分开；然后继续进行两次纵向卵裂，形成上部4个动物极细胞和下部8个植物极细胞。将来动物极细胞发育成外胚层，植物极细胞发育成内胚层。也就是说，一个胚胎的若干个细胞之间就有不同，其转录组应该有不同。那么，同期的细胞之间差异大，还是不同期之间差异大？这些差异是由发育阶段所致，还是由于单细胞测序的随机性误差所致？4.哪些基因是“管家基因”(housekeepinggene)，哪些基因是只在未受精卵细胞中有表达的？这两部分基因的mRNA长度分布有没有统计学意义上的差别？（RefSeq-RNA数据库里面所有的mRNA序列都在Human_hg19_refMrna20150317.fa文件中）