您好,欢迎访问三七文档
当前位置:首页 > 建筑/环境 > 电气安装工程 > PMD18-T-Vector-Cloning-Kit-说明书
研究用CodeNo.6011说明书pMD™18-TVectorCloningKitv201606Da目录内容页码●制品说明1●制品内容1●保存1●纯度1●用途1●pMD18-TVector的结构1●实验操作2■ControlDNA片段的克隆实验2■一般DNA片段的克隆实验2■一种可供选择的快速克隆法3●相关说明4●使用注意4●Q&A5-1-●制品说明pMD18-TVector是一种高效克隆PCR产物(TACloning)的专用载体。本载体由pUC18载体改建而成,在pUC18载体的多克隆位点处的XbaI和SalI识别位点之间插入了EcoRV识别位点,用EcoRV进行酶切反应后,再在两侧的3’端添加“T”而成。因大部分耐热性DNA聚合酶进行PCR反应时都有在PCR产物的3’末端添加一个“A”的特性,所以使用本制品可以大大提高PCR产物的连接、克隆效率。由于本载体以pUC18载体为基础构建而成,所以它具有同pUC18载体相同的功能。此外,本制品中的高效连接液SolutionI可以在短时间内(约30分钟)完成连接反应,其连接液可以直接用于细菌转化,大大方便了实验操作。本制品中的ControlInsert(500bp)还可以用于Control反应。●制品内容(20次量)pMD18-TVector(50ng/μl)20μl×1支ControlInsert(50ng/μl)10μl×1支SolutionI*75μl×2支*使用时请于冰中融解。●保存:-20℃●纯度■ControlInsert经克隆后的白色菌落中,有90%以上含有InsertDNA片段。●用途■进行TA克隆,克隆PCR产物。■对克隆后的PCR产物使用BcaBESTSequencingPrimers、M13Primers进行DNA测序。●pMD18-TVector的结构-2-【pMD18-TVector相关位点说明】Cloningsite425BcaBESTSequencingPrimerM13-47bindingsite352-375BcaBESTSequencingPrimerRV-Mbindingsite484-507LacZoperator146-475ColE1ori873-1461Ampr1632-2492●实验操作■ControlDNA片段的克隆实验A)操作方法1)在微量离心管中配制下列DNA溶液,全量为5μl。试剂使用量pMD18-TVector*11μlControlInsert*21μldH2O3μl2)加入5μl(等量)的SolutionI。3)16℃反应30分钟。注)①室温(25℃)也能正常进行连接反应,但反应效率稍微降低。②5分钟也能正常进行连接反应,但反应效率稍微降低。4)全量(10μl)加入至100μlJM109感受态细胞中,冰中放置30分钟。5)42℃加热45秒钟后,再在冰中放置1分钟。6)加入890μlSOC培养基,37℃振荡培养60分钟。7)在含有X-Gal、IPTG、Amp的L-琼脂平板培养基上培养,形成单菌落。计数白色、蓝色菌落。8)挑选白色菌落,使用PCR法确认载体中插入片段的长度大小。B)结果使用ControlInsert时的连接/转化结果如下,使用的感受态细胞的转化效率为:1.5×108cfu/μgpUC19DNA。ControlInsert连接/转化效率(cfu/μgVector)白色菌落比率(%)效率(%)*+1.7×10698.190以上-1.1×10540.40*效率是指白色菌落中的目的DNAInsert片段的连入效率。■一般DNA片段的克隆实验1)在微量离心管中配制下列DNA溶液,全量为5μl。试剂使用量pMD18-TVector*11μlInsertDNA*30.1pmol~0.3pmoldH2Oupto5μl-3-2)加入5μl(等量)的SolutionI。3)16℃反应30分钟。注)①室温(25℃)也能正常进行连接反应,但反应效率稍微降低。②5分钟也能正常进行连接反应,但反应效率稍微降低。③长片段PCR产物(2kb以上)进行DNA克隆时,连接反应时间请延长至数小时。4)全量(10μl)加入至100μlJM109感受态细胞中,冰中放置30分钟。5)42℃加热45秒钟后,再在冰中放置1分钟。6)加入890μlSOC培养基,37℃振荡培养60分钟。7)在含有X-Gal、IPTG、Amp的L-琼脂平板培养基上培养,形成单菌落。计数白色、蓝色菌落。8)挑选白色菌落,使用PCR法确认载体中插入片段的长度大小。■一种可供选择的快速克隆法*41)在微量离心管中配制下列DNA溶液,全量为5μl。试剂使用量pMD18-TVector*11μlInsertDNA*30.1pmol~0.3pmoldH2Oupto5μl2)加入5μl(等量)的SolutionI。3)16℃反应30分钟。注)①室温(25℃)也能正常进行连接反应,但反应效率稍微降低。②5分钟也能正常进行连接反应,但反应效率稍微降低。③长片段PCR产物(2kb以上)进行DNA克隆时,连接反应时间请延长至数小时。4)取2μl上述连接液(10ngVectorDNA)加入到microcentrifugetubes中,冰上冷却2min。5)取50μlE.coliJM109CompetentCell加入到上述microcentrifugetubes中,混匀并冰浴5min。6)在含有X-Gal、IPTG、Amp的L-琼脂平板培养基上培养(平板使用前需要在37℃预热30分钟),形成单菌落。计数白色、蓝色菌落。*1pMD18-TVector的使用量取0.5μl实验也可得到满意的结果。实际操作时,可按实验需要确定T载体的使用量。pMD18-TVector1μl(50ng)的摩尔数约为0.03pmol。*2ControlInsertControlInsert为500bp的3’末端带有A碱基的PCR产物,ControlInsert1μl(50ng)的摩尔数约为0.15pmol。*3InsertDNA的使用量在进行克隆时,VectorDNA和InsertDNA的摩尔比一般为:1:2~10。*4快速克隆法该克隆方法的效率会有所下降,但此方法操作简单、迅速,是一快速克隆DNA片段的方法,可以满足一定客户的需求。-4-●相关说明1.感受态细胞的选择。转化时请使用高效的热转化感受态细胞(转化效率≥1×108cfu/μgpUC19),这样才可能得到比较理想的阳性克隆。如果需要进行蓝白筛选时,宿主细胞必须具有正确的基因型(F’编码的[LacZ△M15])产生ωFragment,才可能和载体DNA产生的LacZα多肽相结合,表现出β-半乳糖苷酶活性(α-互补性)。2.InsertDNA的要求。InsertDNA应该进行切胶回收的纯化处理后才进行载体连接,尽量避免引物等其它杂质的存在。切胶回收时可使用Takara凝胶回收试剂盒(CodeNo.9762)。3.InsertDNA使用量的计算方法。进行克隆时,VectorDNA和InsertDNA的摩尔数比一般为1:2~10,我们可以根据自己的实验情况选择合适的VectorDNA和InsertDNA的摩尔数比。InsertDNA使用量的计算方法如下:InsertDNA的使用量(ng)=nmol数×660×InsertDNA的bp数本载体1μl(50ng)的摩尔数约为0.03pmol。4.阳性克隆的检测。DNA片段成功插入至pMD18-TVector中后,一般情况下β-半乳糖苷酶的表达将受到破坏,重组克隆体在含有X-Gal、IPTG、Amp的L-琼脂平板培养基上培养时将显示白色菌落。但有时比较短的DNA片段插入载体时,基因的读码框有可能正好与LacZ的读码框相吻合,克隆体也会显示蓝色菌落。有报道称,2kb的DNA片段插入到载体中后,重组克隆体仍显示了蓝色。所以,当我们没有得到白色菌落时,可以试着检测蓝色菌落。进行阳性克隆检测时,我们建议使用PCR的方法,扩增用引物可以使用BcaBESTSequencingPrimers,可以对菌体直接进行PCR扩增。5.阳性对照实验。为了确认实验操作的正确性以及实验试剂的有效性,我们建议进行阳性对照实验。按照实验操作方法,使用试剂盒中提供的ControlInsert,可以进行10次阳性对照实验。6.转化效率的计算。取0.1ng的pUC19PlasmidDNA加入至100μl的热转化感受态细胞中后,再加入900μl的SOC培养基(0.1ngDNA/ml),将上述培养液稀释10倍后(0.01ngDNA/ml)取100μl涂布平板(0.001ngDNA/100μl),记录菌落数。以得到200个克隆体为例计算转化效率,此时的转化效率=200cfu/0.001ng=2×105cfu/ng=2×108cfu/μgpUC19DNA。●使用注意1.SolutionI请于冰中融解。2.克隆时使用的InsertDNA片段(PCR产物)建议进行切胶回收纯化,否则PCR产物中的短片段DNA(甚至是电泳也无法确认的非特异性小片段)、残存引物等杂质都会影响TA克隆效率。3.按照本实验操作进行连接后,直接进行转化时的连接液不要超过20μl。当要转化的DNA量较大或准备进行电转化时,需对连接液进行乙醇沉淀,纯化DNA后再进行转化。进行乙醇沉淀时使用Dr.GenTLEPrecipitationCarrier(CodeNo.9094)可以提高DNA的回收率。4.连接反应请在25℃以下进行,温度升高(26℃)较难形成环状DNA。连接效率偏低时,可适当延长连接反应时间至数小时。5.本制品来源于pUC18载体,因此,适合pUC18载体的感受态细胞都可以使用,如:JM109等。-5-●Q&AQ-1怎样提高连接转化效率?A-11.确认InsertDNA片段的3’末端是否带有“A”尾。大部分的高保真DNA聚合酶(如:TakaraPyrobest、KOD、Pfx、Pfu等)扩增的PCR产物是平滑末端,不能直接进行TA克隆。2.纯化PCR产物。建议使用切胶回收的PCR片段,以除去PCR产物中的非特异性片段和引物等杂质。进行切胶回收时可以使用Takara凝胶回收试剂盒(CodeNo.9762)。3.请使用转化效率大于108cfu/μgpUC19DNA的感受态细胞。4.DNA片段的立体结构、DNA片段的长短都会影响克隆效率。一般情况下,大片段DNA的克隆效率(连接效率与转化效率)偏低,此时可以延长连接反应时间,或采用电转化方法。5.进行切胶回收纯化DNA片段时,不要使DNA片段在紫外线下暴露时间过长。6.SolutionI应尽量避免反复冻融。7.建议使用新配制的平板培养基。Q-2转化后的菌落全为蓝色,但有目的DNA片段的插入,为什么?A-2插入的DNA片段较短(小于500bp),且插入片段没有影响LacZ基因的读框,此时平板培养基上出现的菌落有可能呈现蓝色(或淡蓝色)。Q-3欲对克隆DNA片段进行测序时,使用何种引物?A-3本载体来源于pUC18载体。因此,用于pUC18载体测序的通用引物都可以使用。注意本产品仅供科学研究使用,不能用于人、动物的医疗或诊断程序,不能使用本产品作为食品、化妆品或家庭用品等。未经TAKARABIOINC.书面许可授权或批准,不得制造、许诺销售、销售、进口Takara产品,或者使用Takara产品所有的相关专利及相关商标。如果您需要其他用途的许可授权,请联络我们,或访问我们网站。您使用本产品必须遵守产品网页上适用的全部许可要求。阅读、了解并遵守此类声明的所有限制性条款是您的责任。所有商标均属于各自商标所有者的财产。某些商标并未在全部行政区注册。技术咨询热线:0411-87641685,876416864006518761,4006518769URL:
本文标题:PMD18-T-Vector-Cloning-Kit-说明书
链接地址:https://www.777doc.com/doc-1891383 .html