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序列比对BLAST案列分析•1)运用Blast工具检索一下序列的信息:基因名称、发布时间、发布人员和与其最相似的5个序列的检索号atggggccaagctactgctctcctctcttcctctgtctcctgctgtgcgggggcacggagctgtgctgtgccctgcctctgtggctcttgcccggtggaactgcgaacccagtgacgtct•2)综合运用BLAST方法检索以下信息属于什么基因的一部分:MRCLVVLLAALALSQASGITRIPLHKGKTLRKALKERGLLEDFLQRQQYAVSSKYSSLGKVAREPLTSYLDSQYFGKIYI•首选分析1),2)中的字母组成可知,1)为核酸序列,2)为氨基酸序列;•其次根据个人喜好分别登陆NCBI,EMBL,DDBJ相关位点进行序列比对(Blast)NCBI核酸比对蛋白质/氨基酸比对先做1)题选择核酸比对拷贝1)中的序列粘贴到对话框匹配率最高最高基因名称发布时间发布人员最相似的序列检索号2)核酸序列比对蛋白质/氨基酸序列比对2)中序列选择蛋白质/氨基酸比对对话框中考入2)中序列前两个匹配率相等,名字相同,可任选一个则2)中序列为Chymosin凝乳酶的一部分EMBL默认为蛋白质数据库比对选择核酸查询考入1)中核酸序列耐心等待相似度最高的5个序列检索号匹配率最高的序列即为所查询的序列查询核酸序列基因名称发布时间检索号发布人EMBL默认为蛋白质数据库比对拷贝入2)中氨基酸序列该序列为chymosin凝乳酶的一部分DDBJ默认核酸序列比对考入核酸序列最相似的5个序列的检索号得分最高的序列,最可能是查询的序列的全长,点击基因名称发布时间发布人DDBJ查询2)的结果2)中序列是氨基酸序列,所以选取Blastp进入蛋白质/氨基酸序列比对界面考入2)中序列该序列为chymosin凝乳酶的一部分
本文标题:序列比对BLAST案列分析
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