癌症基因蓝图

癌症基因蓝图在过去的几十年，综合测序的成果已经显示了中国癌症常见形式的基因蓝图，对于大多数的癌症类型，这个蓝图包含了小数量的“山脉”（高百分比的肿瘤基因改变）和大数目的“丘陵”（基因改变的很少）。至今，这些研究揭示了140个基因：当基因内的突变发生改变，将促进或者“驱使”肿瘤的发生。一个典型的肿瘤包含了二到八个这样的“驱使基因”突变，剩下的突变是那些不给予选择性生长优势的突变。驱动基因可分为12个信号通路调节细胞的三个核心步骤：细胞命运，细胞生存和基因组的维护。更好的理解这些途径是在基础癌症研究中最紧迫需求的一个途径。即使到现在，然后，我们关于癌症基因的知识是足够领导发展减少癌症发病率和死亡率的更有效的方法。十年前，所有癌症基因突变可以通过碱基对分辨的想法就像科幻小说。而今天，此类全基因组分析通过外显子测序或者全基因组测序是常见的。原型的癌症外显子研究评估~20种肿瘤花费100,000$/案例（1-3),今天这个测序的花费已经减少了100fold，研究报导的给出类型的100多种肿瘤的测序已成为标准（TABLES1A),尽管现在大量的数据很容易获得，在有意义的方面解密这些信息仍然一直在变化。这儿，我们将复习从这些测序研究中学到的癌症基因—并且，更重要的是，这些信息教了我们生物学和未来癌症的管理策略。多少个癌症基因在典型的人类癌症中完成了巧妙的突变。在普通的固体肿瘤中例如从结肠、胸部、大脑、胰腺等，平均33到66个基因显示微妙的体细胞突变,会改变他们的蛋白质产品(图1)。95%的这些突变是单碱基替换（例如CG),然而剩下的是一个或几个基地的缺失或者插入（例如CTTCA)（TABLES1B),基地的替换，90.7%导致了错义突变，7.6%导致无义突变，1.7%导致了接合点的改变和非编码区域马上临近的开始或者终止密码子（TABLES1B)。某个肿瘤展示了很多比平均更多或者更少的突变（图1b)。尤其值得注意的在这些异常的尤其是黑色癌和肺癌，每种肿瘤中大约包含了200个非同义突变（TABLES1C)，这些大数据反应了在这些癌症类型的发病机理中有效突变（分别为紫外线和香烟）的牵连。因此肺癌在吸烟者中有十倍的体细胞突变相比较于不吸烟者。在DNA修复上有缺陷的肿瘤形成了离群团体。例如，有错配修复缺陷的肿瘤可以含有几千个突变(Fig.1B)。