生信理论题汇总

()是指进化树的拓扑形状是由序列上的每个状态决定的。距离依靠法(distancemethods)独立元素法(discretecharactermethods)BLAST搜索结果中EVALUE的含义是什么？S值可靠性的评价两条序列的相同碱基或者氨基酸的个数预测蛋白质上的跨膜区，可使用以下哪种软件或方法（）GORTmpred对Chou-Fasman算法GeneSplicer以下不属于蛋白质序列数据库的是（）PIR是PDB蛋白质三维结构Swiss-Prot是TrEMBLEMBL的翻译数据库下列哪个矩阵通过计算一个氨基酸残基转变到另一个氨基酸残基所需的密码子变化数目而得到，矩阵元素的值对应于代价？疏水性矩阵PAM矩阵等价矩阵遗传密码矩阵GCM以下哪个软件可以用来预测玉米的ORF？GENSCAN对GeneMarkGenMarkGENESCAN做blastp时使用下列哪个打分矩阵？对等价矩阵BLOSUM矩阵对疏水性矩阵遗传密码矩阵以下哪个软件通过对特征序列(GT-AG)的分析进行直接内含子/外显子剪接位点识别？GTAGNetGene2对Spidey基于单个同源基因差异构建的系统发生树称为基因树基本局部比对搜素工具是（）对BLAST对MegaGCGClustalW要在数据库查询一段与某DNA序列编码蛋白质最相似的序列，应选择（）对tblastp库里答案tblastn错蛋白-核酸比对blastx错核酸-蛋白比对blastn错核酸-核酸比对blastp蛋白-蛋白()是指进化树的拓扑形状由两两序列的进化距离决定的。距离依靠法(distancemethods)独立元素法(discretecharactermethods)登录NCBI主页，分别使用BLOSUM62和PAM30打分矩阵，其他条件均使用BLAST默认条件，搜索同一蛋白质序列。分析获得的序列，大多数情况下哪一个数据库搜索获得的匹配序列多？BLOSUM62对PAM30如果想要查找单核苷酸多态性数据，优先选择下列数据库中的哪一个？OMIMSNP对UniGenePubMed下列哪个程序是用蛋白质序列搜索蛋白质序列数据库？blastntblastxblastpblastxblast+相对于blast模块化了以下哪三个过程？setup、scanning、trace-backBLAST是序列（）比对工具。局部构建进化树前需要进行多序列比对吗？需要不需要亲缘关系远的序列之间的比对选用下面哪个打分矩阵合适？PAM250对BLOSUM80PAM1下列哪个矩阵是根据氨基酸残基替换前后疏水性的变化而得到得分矩阵？PAM矩阵疏水性矩阵等价矩阵遗传密码下列哪个程序是将核酸序列按6条链翻译成蛋白质序列后搜索由核酸序列数据库按6条链翻译成的蛋白质序列数据库？blastxblastnblastptblastxTblastx是核酸-核酸比对。此种查询将库中的核酸序列和查询的核酸序列都翻译成蛋白质（每条核酸序列会产生3条可能的蛋白序列）。这种说法是否正确？是否以下哪个命令是blast2.2.30+用来格式化数据库的？formatdbmakeblastdb下列哪个程序是将核酸序列按6条链翻译成蛋白质序列后搜索由核酸序列数据库按6条链翻译成的蛋白质序列数据库？blastnblastpblastxtblastx使用BLAST2.2.30+比对时，下列哪一个参数是用来设置e-value值？-e`-evalue下列哪个值越小表示进行blast的两条序列之间相似的程度越大？identitiespositivesS值E值基于单个同源基因差异构建的系统发生树称为基因树物种数使用BLAST2.2.30+比对时，-outfmt共有几种输出格式？1112109PIR是（）mRNA数据库蛋白质数据库核酸数据库启动子数据库多序列比对工具是ClustalW多序列MegaGCGBLAST以下属于直接药物设计方法的是（）从头设计方法数据库搜索方法药效团方法QSAR方法药物与受体结合的作用类型主要有（）静电作用氢键作用范德华作用疏水作用计算机辅助药物设计方法包括分为如下两类（）间接药物设计从头药物设计直接药物设计多重药物设计生物信息学涉及到下列哪些学科？数学生物学计算机科学管理学中国在人类基因组计划中承担是第几号染色体部分区域的测序工作？21313以下不属于蛋白质序列数据库的是（）PIR是Swiss-Prot是PDB蛋白质三维结构TrEMBLEMBL的翻译数据库如果想要了解某个基因的突变与疾病是否存在关联，应该查阅哪一个数据库？UniProtGeneGEOOMIM以下蛋白质三级结构预测方法的是（）折叠识别药效团模型从头预测同源建模以下属于二级结构预测方法的是（）ChouandFasmanJPREDGORPHD如果想要查找某个蛋白相关信息，优先选择下列数据库中的哪一个？SNPPubMedUniGeneUniProtPDB是蛋白质的（）结构数据库分类数据库结构域数据库模体数据库下列哪个程序是将核酸序列按6条链翻译成蛋白质序列后搜索由核酸序列数据库按6条链翻译成的蛋白质序列数据库？tblastxblastxblastnblastp4、当所考虑的谱系间进化速率可变时,(D)比较适用DA、最大简约性法（MaximumParsimonymethods）B、最大可能性法（MaximumLikelihoodmethods）C、距离依靠法包括除权配对法（UPGMAM）D、邻位相连法（Neighbor-joining）8、下列哪个程序是将核酸序列按序6条链翻译成蛋白质序列后搜索由核酸列数据库按6条链翻译成的蛋白质序列数据库?DA、blastnB、blastpC、blastxD、tblastx10、以下哪个软件通过对特征序列(GT-AG)的分析进行直接内含子/外显子剪接位点识别？AA、NetGene2B、SpideyC、GTAG13、某天，你在实验中发现一个有趣的表型，经过一系列实验锁定某个基因，测序结果如下：GATGGGCTGGAAGTAAGGAAACATGTAATGATAGGCGGACTCCCAGCACAGAAAAAAAGGTAGATCTGAATGCTGATCCCCTGTGTGAGAGAAAAGAATGGAATAAGCAGAAACTGCCATGCTCAGAGAATCCTAGAGATACTGAAGATGTTCCTTGGATAACACTAAATAGCAGCATTCAGAAAGTTAATGAGTGGTTTTCCAGAAGTGATGAACTGTTAGGTTCTGATGACTCACATGATGGGGAGTCTGAATCAAATGCCAAAGTAGCTGATGTATTGGACGTTCTAAATGAGGTAGATGAATATTCTGGTTCTTCAGAGAAAATAGACTTACTGGCCAGTGATCCTCATGAGGCTTTAATATGTAAAAGTGAAAGAGTTCACTCCAAATCAGTAGAGAGTAATATTGAAGACAAAATATTTGGGAAAACCTATCGGAAGAAGGCAAGCCTCCCCAACTTAAGCCATGTAACTGAAAATCTAATTAT。如果想通过该序列直接知道是哪个基因，下面哪个程序不适合做这件事情？BA、blastnB、blastpC、blastxD、tblastx14、下列哪个程序是将核酸序列按6条链翻译成蛋白质序列后搜索蛋白质序列数据库？CA、blastnB、blastpC、blastxD、tblastx19、“基因组学”这个术语是1986年由（A、Tom）在芬兰的一次会议上提出A、TomB、SangerC、WalterFiers7、如果想要了解生物医学目前的最新研究进展，可以查阅哪一个数据库？A、PubMedB、UniProtC、ExPASyD、Wikipedia13、DNAmicroarray技术可以用来做些什么？A、基因序列分析B、基因诊断C、基因表达研究D、新基因发现14、下列哪些是生物信息学的研究内容？A、比较基因组学B、蛋白质表达分析C、蛋白质结构预测D、计算机辅助药物研发15、下列哪些是生物信息学的研究方向？A、基因组学B、转录组学C、蛋白质组学D、代谢组学17、利用EST文库可以做哪些工作？A、基因表达B、发现新基因C、发现可变剪切D、基因表达调控18、如果想在PubMed中查找标题同时含有“vasculogenesis”和“cancer”这两个关键词的文章，下列检索式中哪些是正确的？A、vasculogenesis[ti]cancer[ti]B、vasculogenesis[ti]ANDcancer[ti]C、vasculogenesis[ti]andcancer[ti]D、(vasculogenesiscancer)[ti]以下哪个软件无法预测TATAbox？CisterPromosePromoserRSATPromoterScan基于单个同源基因差异构建的系统发生树称为物种数基因树以下哪个命令是blast2.2.30+用来格式化数据库的？formatdbmakeblastdb以下哪个软件不是用来识别CpG岛？CpGi130GpGPlotCpGIslandCpGi120Tblastx是核酸-核酸比对。此种查询将库中的核酸序列和查询的核酸序列都翻译成蛋白质（每条核酸序列会产生3条可能的蛋白序列）。这种说法是否正确？否是以下哪个软件通过对特征序列(GT-AG)的分析进行直接内含子/外显子剪接位点识别？SpideyGTAGNetGene2下列哪个值越小表示进行blast的两条序列之间相似的程度越大？identitiesS值E值positives下列哪个矩阵是根据氨基酸残基替换前后疏水性的变化而得到得分矩阵？疏水性矩阵PAM矩阵遗传密码矩阵等价矩阵下列哪个程序是将核酸序列按6条链翻译成蛋白质序列后搜索由核酸序列数据库按6条链翻译成的蛋白质序列数据库？blastptblastxblastxblastnBLAST是NCBI的常用比对工具，发现序列之间的（）相似性局部全局基因组学与分子生物学或遗传学一样，它们主要侧重研究单个基因的功能错对酵母基因组的优点包括（）90%的酵母基因表达产物与人类同源内含子少内含子多基因数目少使用BLAST2.2.30+比对时，-outfmt共有几种输出格式？1291011所谓同源序列,是指从某一共同祖先经（）而形成的不同序列协同进化趋同进化趋异进化“基因组学”这个术语是1986年由（）在芬兰的一次会议上提出SangerTomWalterFiers序列比对可以用于（）寻找蛋白质家族寻找转录因子寻找同源物亲缘关系近的序列之间的比对选用下面哪个打分矩阵合适？BLOSUM1PAM250远BLOSUM45BLOSUM80()是指进化树的拓扑形状是由序列上的每个状态决定的。独立元素法(discretecharactermethods)距离依靠法(distancemethods)登录NCBI主页，分别使用Non-redundantproteinsequences(nr)数据库和ProteinDataBankproteins(pdb)数据库，其他条件均使用BLAST默认条件，搜索同一蛋白质序列。分析获得的序列，大多数情况下哪一个数据库搜索获得的匹配序列多？nr库pdb库构建进化树前需要进行多序列比对吗？需要不需要以下哪个软件不是用来识别CpG岛？CpGi120CpGi130CpGIslandGpGPlot以下哪个软件通过对特征序列(GT-AG)的分析进行直接内含子/外显子剪接位点识别？NetGene2SpideyGTAG下列哪个矩阵通过计算一个氨基酸残基转变到另一个氨基酸残基所需的密码子变化数目而得到，矩阵元素的值对应于代价？遗传密码矩阵疏水性矩阵PAM矩阵等价矩阵如果想知道某条核酸序列是小鼠的哪个基因，下面哪个程序不适合做这件事情？blastnblastxblastptblastx哪些测序仪的读长在1000BP以上？第二代第一代第四代第三代以下哪些矩阵是基于“观察突变”的打分矩阵？等价矩阵BLOS