CiteSpace高级功能及总结

第7讲CiteSpace高级功能介绍李杰1，陈超美21.首都经济贸易大学-安全与环境工程学院2.DrexelUniversity-CollegeofComputingandInformatics配套教程:李杰,陈超美著.CiteSpace科技文本挖掘及可视化[M].首都经济贸易大学出版社.2016.作者博客:李杰博客：；陈超美博客：本讲主要内容1.网络的叠加分析2.期刊的双图叠加分析3.CiteSpace与其他可视化工具的结合4.科学知识图谱工具总结及展望1.网络叠加第一步：对数据整体网络的初步分析。此处的数据采用软件自带的“terrorism”案例数据。文献Overlay分析的关键点是在时间维度上的图层叠加，首先选择的时间切片为1996-2003，得到的恐怖主义研究的文献共被引网络如图，得到了N=309，E=1107的网络。1.网络叠加第二步：构建叠加图层。这里构建的图层是需要叠加在底图上的网络图，因此是底图的子图。保存底图后，关闭网络可视化窗口，将分析时间设置为从1996-2000，其他参数不变，点击“GO”生成新网络。在网络可视化窗口中选择菜单Networkoverlays，并进一步SaveAsanetworklayer。CiteSpace会自动将该图层命名为“network216.layer”。1.网络叠加第三步：叠加分析。按照步骤一运行得到整体网络。然后在Networkoverlays菜单下选择AddaNewNetworklarer，完成叠加后，增加的图层会叠加在整体网络上，并显示出所叠加网络的节点标签。叠加图层的标签显示可能会导致网络比较混乱，这时可以在Networkoverlays菜单下选择Show/HideOverlayNodesLabels。此时网络显得比较清晰，叠加图层的共被引连线也清晰可见（红色标示）。为了增加底图和叠加图层的对比性，可以切换来显示底图网络颜色。1.网络叠加用同样的方法可以将2001-2003年的文献共被引网络进行叠加分析。当然在网络叠加结束后也可以对网络进行聚类，进一步考察所叠加的网络在整个网络中的哪些聚类中。Traditionalco-citationnetworkandproximity-levelco-citationnetworkoverlaysLiuS,ChenC.Theproximityofco-citation[J].Scientometrics,2011,91(2):495-511.传统的共引网络和邻近级的共引网络的叠加分析2.期刊双图叠加Dual-map于2014年10月27日嵌入到CiteSpace3.8.R7（64-bit）中，用户只需要下载最新版的CiteSpace即可。当前的overlay分析还仅仅支持期刊的双图叠加，专利数据的叠加还没有开放。用户最多能够增加12个图层，即12个不同的主题数据，来对不同数据进行双图叠加的比较。citingpatterncitedpattern技术性论文参见：Chen,C.,Leydesdorff,L.(2014)Patternsofconnectionsandmovementsindual-mapoverlays:Anewmethodofpublicationportfolioanalysis.JournaloftheAmericanSocietyforInformationScienceandTechnology,65(2),334-351.~cchen/papers/2013/JASIST_DualMaps_preprint.pdf2.期刊双图叠加-数据检索2.期刊双图叠加数据检索结果111113141362741616132926612421930173060500100015002000250019741993199419961998199920002001200220032004200520062007200820092010201120122013201420152016大数据研究发表的论文量时间注：数据收集时间为2015年12月6日，因此2015年和2016年的数据都是不全的。2.期刊双图叠加-功能位置及其界面12期刊双图叠加功能位置期刊双图叠加功能界面2.期刊双图叠加-打开软件后得到底图底图背景颜色的编辑期刊节点为实心填充或者空心显示或者隐藏期刊聚类名称显示聚类边界显示期刊聚类名称聚类标签颜色的调整聚类方式的调整2.期刊双图叠加-加载数据342.期刊双图叠加-加载数据52.期刊双图叠加-加载数据62.期刊双图叠加-结果2.期刊双图叠加-保存结果2.期刊双图叠加-结果的调整+保存图中椭圆含义论文量（椭圆纵轴），作者数量（横轴）左侧调整椭圆的大小右侧调整椭圆的大小2.期刊双图叠加-局部放大2.期刊双图叠加-Z-score合并（新）大数据研究的期刊双图叠加图中椭圆含义论文量（椭圆纵轴），作者数量（横轴）ThedatawasdownloadfromWebofScienceCoreCollection,threesub-databaseswereincludined,ScienceCitationIndexExpanded,SocialSciencesCitationIndexandConferenceProceedingsCitationIndex-Science.thedatawasretrival28thMay,2015,thetimespansetfrom2005to2015,TOPIC:(bigdata).Totally3424recordsweredownloaded.ByJieLiBigDataDual-mapThisisabigpictureofthecurrentbigdataliterature.Thedual-mapoverlayisbasedon1,246publicationsonbigdata,retrievedonDecember11,2014fromtheWebofScience(alongwiththeusualcaveatofhowrepresentativeitis).Themapshowsyouquiteafewthingsintuitively,forexample,whichjournalsaremostpopularintermsofhowfrequentlytheypublishpapersonthetopic,whichdisciplinesthesejournalsbelongto,whichareasrepresentbigscience(alargeauthor-to-paperratio)vssmallscience,whichjournalsaremostinfluentialintermsofhowoftentheyarecitedinconnectiontothetopicofbigdata,andmore.ByChaomeiChen,Detailinformationforthismap:案例：期刊的比较数据SafetyScience（2013-2014）VsScientometrics（2013-2014）SafetyScience2013-2014Scientometrics2013-2014其他软件的图层叠加分析CitingCited李杰绘制，使用Loet工具及其VOSviewer进行分析和可视化大数据期刊的叠加大数据分布领域叠加李杰绘制，使用Loet工具和VOSviewer进行可视化大数据分布领域叠加李杰，绘制（使用SCI2进行分析和可视化）小提示点击该文件运行CiteSpace运行期刊双图得加功能该窗口可以显示期刊双图叠加的过程3.Citespace与其他可视化工具的结合CiteSpace2Gephi3.Citespace2Netdraw3.Citespace2MapequationAnalluvialflowofcitedreferences.ByChaomeiChen种常用免费科技文本挖掘及可视化软件软件名称开发者功能描述推荐指数CiteSpaceChaomeiChen科学计量与可视化分析VOSviewerVanEck,N.J等科学计量与可视化分析SCIofSCIKatyBörner团队科学计量与可视化分析SciMATM.J.Cobo,A.G等科学计量与可视化分析LoetToolsleydesdorff科学计量与可视化前处理BibExcelOllePersson科学计量与可视化前处理HistCiteEugeneGarfield科学计量及引证网络CitNetExploreVanEck,N.J等引证网络及可视化PublishorPerishAnne-WilHarzing谷歌学术数据采集及分析MapequationDanielEdler等网络及演化的可视化Gephi——网络可视化分析PajekVBatagelj等网络可视化分析NetdrawBorgatti,S.P网络可视化分析Cytoscape——网络可视化分析UcinetBorgatti,S.P.等网络文件的统计分析BICOMB崔雷等矩阵的提取和统计(中文)SATI刘启元矩阵的提取和统计(中文)Carrot2AudilioGonzales等辅助文本可视化JigsawJohnStasko团队辅助文本可视化GPSVisualizer——辅助地理可视化注释：推荐指数为作者自己根据使用经验增加的栏目，对于读者这里仅仅作为参考。4.展望与总结：将多种工具进行综合介绍荷兰莱顿大学科学技术研究中心VOSviewer开发者Nees（于荷兰代尔夫特理工大学安全科学系办公室）国际科学计量学最高奖获得者-Loet（于阿姆斯特丹某咖啡馆）Loet同样开发了一系列用于科学计量分析的工具包参考文献1.Chen,C.(2014)TheCiteSpaceManual.李杰,陈超美.如何使用CiteSpace的一组示范及常见问题解答李杰.CiteSpace中文指南.李杰，陈超美.(2016)CiteSpace科技文本挖掘及可视化[M].首都经济贸易大学出版社.5.李杰,(2015)安全科学知识图谱导论[M].化学工业出版社.6.李杰等,(2014)安全科学技术信息检索基础[M].首都经济贸易大学出版社.7.陈悦，陈超美等(2014)引文空间分析原理与应用[M].科学出版社.