湘雅临床大数据调研报告

湘雅大数据调研报告-湘雅二医院调研项目:艾滋病临床大数据系统指导老师:二级学院:软件学院专业名称:软件工程班级:调研报告人:中南大学2014年4月30日1摘要本文在下面章节描述了湘雅大数据调研的详细过程，并对大数据及艾滋病背景做了简要的叙述，结合湘雅二医院的实际，对湘雅二医院的已有的医疗信息系统及平台，大数据项目需求以及大数据方法与技术进行了详细的阐述。在调研之际我们还对医院感染科已有的信息平台中的信息与数据的格式，规范与要求进行了介绍。感染病是一项传播疾病，在大数据时代到来之际我们应该充分利用大数据分析平台来处理沉积在医院数据库系统中的数据，这有利于临床医生的工作效率和他们的科学研究。在此之中我们也应该清楚的认识到大数据平台除了在商业应用成功之外在其余的方面这样的成功的案例很少，这给我们带来新的挑战，故本文仅提供了解决湘雅大数据建设的初步的设想和相关技术方面的描述。关键字：湘雅大数据，艾滋病，疾病传播，医疗信息系统，数据库系统2目录第一章绪论..................................................................................................................31.1项目背景...........................................................................................................31.1.1艾滋病背景介绍....................................................................................31.1.2医疗大数据背景介绍............................................................................31.2临床工作和临床数据积累的基础..................................................................5第二章目前信息系统概况........................................................................................72.1湘雅二医院信息系统......................................................................................72.1.1解决人财物的管理问题.....................................................................72.1.2涉及临床信息的处理系统..................................................................82.2湘雅二医院目前使用的电子病历系统..........................................................8第三章艾滋病规范化诊疗随访系统建设需求与分析..............................................93.1临床病例随访系统需求分析..........................................................................93.2临床大数据系统建设的内容、方案和技术路线..........................................93.3临床数据资料的收集...................................................................................103.3.1确诊前的相关信息..............................................................................103.3.2确诊后的资料收集..............................................................................103.3.3治疗过程资料的收集..........................................................................103.4随访管理系统的需求...................................................................................11第四章艾滋病临床病例随访系统所需用到相关技术与方法................................124.1临床病例追踪系统所需用到相关技术........................................................124.2临床病例追踪系统所需用到的方法............................................................13第五章艾滋病临床病例随访系统解决问题的可行性方案....................................14第六章结论................................................................................................................15参考文献(References)：.............................................................................................153第一章绪论1.1项目背景1.1.1艾滋病背景介绍艾滋病（AIDS）是一种严重威胁人类生命健康的传染病。我国艾滋病流行呈地区性聚集，湖南省的艾滋病新发感染和发病率逐年增加，已经成为国家重点防控地区之一。艾滋病毒（HIV）感染和发病有其特殊性，感染人群多样化，大大增加了防控和治疗难度。HIV感染主要侵犯机体的免疫系统，逐渐致CD4+T淋巴细胞耗竭，最终使机体免疫功能破坏直至崩溃，导致各种机会性感染和/或肿瘤。艾滋病从感染到出现临床症状有较长的潜伏期，平均8-10年。但是不同的感染途径、不同的人群、不同的免疫状况以及是否有其他合并症等均影响患者的发病时间，因此患者一旦确诊HIV感染需定期随访检查相关指标以便及时治疗。另外确定HAART治疗后仍然需定期随访，因为治疗方案为多药联合治疗，药物可能有一定的毒副作用需要定期观察处理，长期治疗可能出现药物耐药需要及时更换治疗方案等。艾滋病的治疗主要以抗病毒（highlyactiveanti-retroviraltherapy,HAART）为主，到目前为止尚无特效治愈方法，因此一旦启动治疗需要终生用药。有研究报道，只要及时采用HAART治疗，艾滋病的预期寿命可与普通人相差无几。1.1.2医疗大数据背景介绍随着大数据时代的到来，医疗行业的信息化也迎来自己的“大数据时代”，而如何将患者的被动性参与转向主动健康管理，从单一案例效果评估转向过程性、全程性的整体评估和体验；从病种数据管理扩展到健康数据管理，从关注争端和4治疗技术跨到预防、护理和康复环节是未来医疗行业需要关注和解决的问题，而大数据，正是一条重要的道路。所谓大数据是指无法在一定时间内用传统数据库软件工具对其内容进行抓取、管理和处理的数据集合。大数据技术，是指从各种各样类型的数据中，快速获得有价值信息的能力。适用于大数据的技术，包括大规模并行处理（MPP）数据库，数据挖掘电网，分布式文件系统，分布式数据库，云计算平台，互联网，和可扩展的存储系统。具体来说，大数据具有4个基本特征：一是数据体量巨大。百度资料表明，其新首页导航每天需要提供的数据超过1.5PB（1PB=1024TB），这些数据如果打印出来将超过5千亿张A4纸。有资料证实，到目前为止，人类生产的所有印刷材料的数据量仅为200PB。二是数据类型多样。现在的数据类型不仅是文本形式，更多的是图片、视频、音频、地理位置信息等多类型的数据，个性化数据占绝对多数。三是处理速度快。数据处理遵循“1秒定律”，可从各种类型的数据中快速获得高价值的信息。四是价值密度低。以视频为例，一小时的视频，在不间断的监控过程中，可能有用的数据仅仅只有一两秒。而在医疗数字化的过程中，医院成了大数据产生的重要来源，病历、影像、远程医疗等都会产生大量的数据。医疗行业相比其他行业更加严谨，因为更多的是“人命关天”的业务，因此在IT创新的脚步上是相对较慢的。而引入更多的数据源，包括内部与外部数据，医疗机构是否已经准备好迎接大数据的挑战？有专家认为，医疗行业的大数据应用还处在起步阶段，但大部分医疗机构已经开始意识到大数据对于他们的重要性。因为要真正在医疗健康领域创造价值，仅仅掌握医院内部数据是远远不够的。而艾滋病（AIDS）作为一种严重威胁人类生命健康的传染病。我国艾滋病流行呈地区性聚集。艾滋病毒（HIV）感染和发病有其特殊性，感染人群多样化，大大增加了防控和治疗难度。根据传染病疫情报告以及艾滋病随访的特殊要求，每个治疗的患者必须定期随访检查并网络上报相关资料，因此随访患者均有网络信息随时可以调取。目前在各医院的信息系统中积累了大量的、宝贵的临床信息，尤其是结构化的电子病历系统更是产生了大量的、临床科研所必须的临床病例信息，这些数据又是分散的存储于这些信息储存在电子病历、收费、医嘱、药品、检验、PACS、5手术等业务系统中。绝大多数的医疗数据是处于归档状态，如果要检索是十分复杂的。同时缺乏数据标准，导致无法统一。所以未来的数据利用前景是十分广阔的，不仅用于临床诊断，临床科研，而且为政府公共卫生决策及个人管理健康都会发挥积极的作用。1.2临床工作和临床数据积累的基础湘雅二医院艾滋病研究室是湖南省最早成立的艾滋病临床科研研究室，是湖南省艾滋病学组组长单位。自2001年成立以来，承担了大量的艾滋病临床科研工作，在国内较早开展艾滋病的临床诊疗工作；先后启动了湖南省第一例成人和儿童艾滋病的抗病毒治疗，成功进行艾滋病母婴阻断20多例，每年接诊HIV/AIDS患者200多例，长期在本研究室治疗随访的患者400多例，根据传染病疫情报告以及艾滋病随访的特殊要求，每个治疗的患者必须定期随访检查并网络上报相关资料，因此随访患者均有网络信息随时可以调取，病源覆盖全省和周围省份，与兄弟单位有良好的合作基础；同时本研究室还保存了800多份HIV/AIDS患者的原始资料和血清标本。在此基础上本研究室还开展了大量的科研工作，主要在以下几个方面开展：①抗HIV/AIDS的HAART疗法的临床科研，长期系统研究其抗病毒效果、毒副作用、免疫重建效果和病毒耐药机制；②在发现HIVvpr基因多态性现象的基础上开展了HIV致病机理的研究;③艾滋病的中西医结合治疗方法和效果的研究；④与美国和国内同行密切合作，开展了阻断HIV母婴传播新方法的探索；⑤HIV与HCV混合感染的抗病毒治疗策略研究。这些课题均密切结合临床并已形成了稳定的研究方向。本研究团队近年共获11项艾滋病相关的研究课题，包括国家“十五”“十一五”“十二五”重大科技专项分课题、国家自然科学基金、全球基金-中盖艾滋病项目、卫生部重点课题、教育部博士点基金课题和中国中医研究院等单位委托进行的“艾宁颗粒”新药II期临床研究等，总资助经费260多万元人民币。获省科技厅和省卫生厅科技进步奖各一项，在国内外学术杂志上发表防治艾滋病的文章50多篇(其