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PubMed检索系统PubMed检索系统PubMed系统是由美国国立生物技术信息中心（NCBI）开发的用于检索MEDLINE、PreMED-LINE数据库的网上检索系统。MEDLINE是美国国立医学图书馆（U.S.NationalLibraryofMedicine）最重要的书目文摘数据库，内容涉及医学、护理学、牙科学、兽医学、卫生保健和基础医学。收录了全世界70多个国家和地区的4000余种生物医学期刊，现有书目文摘条目1000万余条，时间起自1966年。PreMEDLINE是一个临时性医学文献数据库。它每天都在不断地接受新数据，可为用户提供基本的文献条目和文摘，其文献条目在标引和加工后每周向MEDLINE移加一次。PubMed还通过电子通讯方式接受出版商提供的文献条目数据，这种条目带有[MEDLINErecordinprocess]的说明，并标有[Recordassuppliedbypublisher]的标识。这种条目每天都在不停地向PreMEDLINE数据库中传送，但其中有些条目由于超出了MEDLARS数据库的收录范围，将永远不会被PreMEDLINE或MEDLINE条目所取代，例如在综合性的科学杂志（Science或Nature）上发表的地理学文章等。PubMed系统的主要特点PubMed检索Details键的用法存储检索策略--URL键的用法特征栏（FeatureBar）介绍检索结果的显示、存盘、打印PubMed详解PubMed系统的主要特点1.词汇自动转换功能（AutomaticTermMapping）在PubMed主页的检索提问框中键入检索词，系统将按顺序使用如下4种表或索引，对检索词进行转换后再检索。（1）MeSH转换表（MeSHTranslationTable），包括MeSH词、参见词、副主题词等。如果系统在该表中发现了与检索词相匹配的词，就会自动将其转换为相应的MeSH词和TextWord词（题名词和文摘词）进行检索。例如：键入“Vitaminh，系统将其转换成Biotin[MeSHTems]ORVitaminh[Textword]后进行检索。（2）刊名转换表（JournalTanslationTable），包括刊名全称、MEDLINE形式的缩写和ISSN号。该转换表能把键入的刊名全称转换为“MEDLINE缩写[JournalName]后进行检索。如：在检索提问框中键入：“newenglandjournalofmedicine,PubMed将其转换为NEnglJMed[JournalName]后进行检索。（3）短语表（Phraselist）。该表中的短语来自MeSH、含有同义词或不同英文词汇书写形式的统一医学语言系统（UMLS:UnifiedMedicalLanguageSystem）和补充概念（物质）名称表[SupplementaryConcept(Substance)Name]。如果PubMed系统在MeSH和刊名转换表中未发现与检索词相匹配的词，就会查找短词表。（4）著者索引（AuthorIndex）。如果键入的词语未在上述各表中找到相匹配的词，或者键入的词是一个后面跟有1~2个字母的短语，PubMed即查著者索引。如果仍然找不到匹配词，PubMed就会把该词断开后再重复上述自动词汇转换过程，直到找到与键入的词语相匹配词语为止。若仍然没有匹配词，单个词会被联一起（用AND）在全部字段中检索。如：singlecell，系统就会自动将其分成两个词：“single“和“cell”检索，其检索表达式为：“singleANDcell”。要查验检索词的转换情况，可点击“Details”键。2.截词检索功能PubMed允许使用“*”号作为通配符进行截词检索。如：键入“bacter*”，系统会找到那些前一部分是bacter的单词（如bacteria,bacterium,bacteriophage等），并对其分别进行检索。如果这咱词少于150个，PubMed会逐个词检索，若超过150个（如：Staph*）,PubMed将显示如下警告信息：“Wildcardsearchfor'term*'usedonlythefirst150variations.Lengthentherootwordtosearchforallendings。截词功能只限于单词，对词组无效。如：“infection*”包括“infections”，但不包括“infectioncontrol”等。使用截词功能时，PubMed系统会自动关闭词汇转换功能。3.强制检索功能如上所述，在PubMed主页的检索提问框中键入一个短语后点击“Go”，系统会高速用自动转换功能查找到相应的匹配词后再进行检索；但是，当键入的词语无匹配词时，PubMed就会将键入的词语断开后再重复上述自动词汇转换过程，若仍然没有匹配词，系统就将短语分解成单词，再用AND联在一起在全部字段中检索。很明显，这样检索的结果是不符合用户要求的。因此，PubMed允许使用双引号（“”）来强制系统进行短语检索。例如，在PubMed主页的检索提问框中键入“Singlecell”，并用双引号引起来，然后点击“Go”，系统会将其作为一个不可分割的词组在数据库的全部字段中进行检索。使用双引号检索，会自动关闭词汇转换功能。4.链接功能（1）链接相关文献。PubMed系统中的每条文献记录均有一个相关文献链接，在检索结果的显示状态下，每条记录的右边均有“RelatedArticles”超链。点击该链，系统按文献的相关度从高到低显示相关文献。利用检索史（History）按钮能进一步限制相关文献。点击“History”，把相关检索式的编号录入检索提问框，然后再键入附加条件词，最后点“Go”。如在检索提问框中键入“#7ANDenglish[la]”，可将检索进一步限定在英文文献范围内。（2）链接NCBI（NationalCenterforBiotechnologyInformation）数据库。PubMed在其主页上与NCBI的5个数据库建立了超链接。这些数据库包括：Protein[氨基酸（蛋白质）序列]数据库，Nucleotide(DNA序列)数据库，Popset(种群、种系发生或突变序列)数据库，Structure（分子结构模型）数据库和Genome(基因组序列)数据库。（3）链接外部资源。PubMed提供从检索结果到期刊全文、生物学数据、序列中心等的链接。该功能通过链接上述资源站点的方式来实现。在检索结果显示状态下，点击“LinkOut”进入相关网站。（4）链接相关图书。点击“Books”，可参考相关书籍的文摘页。书籍文摘页上的某些短语是超链接，点击短语超链，可连到相关图书的页码表，可在表上找到有关短语。此外，PubMed系统允许用户查看被引期刊名称表，点击主页上的PubMedJournalBrower即可，PubMed向用户提供期刊的缩写名称和ISSN号。PubMed检索PubMed系统检索范围：MEDLINE数据库和PreMEDLINE数据库。1.词语（主题）检索在PubMed主页的提问框中键入英文单词或短语（大写或小写均可后回车或点击“Go”，PubMed即使用其词汇自动转换功能进行检索，并将检索结果直接显示在主页下方。例如：键入“vitaminccommoncold”后回车或点击“Go”，PubMed开始检索并将检索结果显示出来。如果检索结果不符合要求，可以在提问框中增加或删除词语，或者在Details状态下（参见Details键的用法）来修改检索式，也可使用“Limits”（参见Limits的用法）选择限定条件后再进行检索。此外，用户可根据需要使用通配符“*”或双引号进行截词检索或强制检索。2.著者检索在提问框中键入著者姓氏全称和名字的首字母缩写，格式为：著者姓空格名字首字母缩写，例如smithja，然后回车或点击Go，系统会自动到著者字段去检索，并显示检索结果。如果在录入了著者的姓氏，系统将首先在MeSH转换表中查找该著者的姓。查到后，系统检索主题字段和题名与文摘字段，否则，系统将在全部字段中检索。如果在著者姓名前后使用双引号，并用著者字段标识——[au]加以限定，如“smithja”[au]，那么系统只检索著者字段。3.刊名检索在提问框中键入刊名全称或MEDLINE形式的简称、ISSN号，例如：molecularbiologyofthecell,或molbiolcell,或1059-1524，然后回车或点击Go,系统将在刊名字段检索，并显示检索结果。如果刊名与MeSH词表中的词相同，例如：GeneTherapy、Science或Cell等，PubMed将把这些词作为MeSH词检索。在这种情况下，需要用刊名字段标识——[ta]加以限定，如“genetherapy[ta]”。单个词的刊名也需要用[ta]限定，如：Scanning[ta]。否则，系统将在全部字段中检索。使用刊名全称或MEDLINE简称可检索到数据库中的全部相关记录。使用ISSN号进行检索，则不能保证检到数据库中较早的记录。若刊名有括号，录入时应将括号省略。如：JHandSurg[Am]应键入JHandSurgAm。4.布尔逻辑检索PubMed系统允许使用布尔逻辑检索，但要在提问框中键入布尔逻辑运算符（AND，OR或NOT）。如：vitamincORzinc。布尔逻辑检索的运算顺序为从左至右，但可使用圆括号来改变其运算顺序。如commoncoldAND(vitamincORzinc),圆括号中的检索式最先运算。布尔逻辑检索允许在检索词后附加字段标识以限定检索字段（字段标识要用方括号括起来，位于检索词这后）。其检索表达式的格式为：检索词[字段标识]布尔运算符检索词[字段标识]。如：dna[mh]ANDcrick[au]AND1993[dp];又如：ansthma/therapy[mh]ANDreview[pt]ANDchild,preschool[mh]。各种字段标识见表1。表1字段标识一览表字段标识字段名称简要说明ADAffiliation第一责任者的工作单位、地址，合同号ALLAllFields全字段AUAuthorName著者姓名RNEC/RNNumber酶学委员会分配给特定酶的编号和化学文献社的登记号EDATEntrezDate录入PubMed系统数据库的日期FILTERFilter由PubMed系统链接的外部资源站点所使用的用来限定文献的技术标识IPIssue期刊的期号TAJournalTitle期刊名称或IISN号LALanguage语言文种MHDAMeSHDate标引MeSH主题词的日期MAJRMeSHMajorTopic主要MeSH主题词MHMeSHTerms全部MeSH主题词PGPageNumber期刊页码PSPersonalNameasSubject人名主题词DPPublicationDate文献出版日期PTPublicationType文献类型，包括综述、临床试验、通信等SHPSubheadingsMeSH副主题词SISecondarysourceID用于限定检索与PubMed系统中的文献条目相关的分子序列资源数据库（如Genbank[si]）和/或该数据库中的存取号（如：AF001892[si]）SBSubset用于限定检索PubMed下属的文献数据库（包括MEDLINE，PreMEDLINE,Publisher和AIDS数据库）。如：Publisher[sb];aids[sb]NMSubstanceName化学物质名称TWTextWords题名词和文摘词TITitlewords题名词UIDUniqueIdentifiersPubMed系统或MEDLINE数据库惟一记录标识号，即PMID或UI。单独用其检索时，该标识可以省略。但当用该号与其他词一同检索时，必须使用[uid],如：smith[au]AND(10403340[uid]ORvaccines[mh])。VIVolume期刊卷号5.日期或日期范围检索在