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1WesternBlot实验详细介绍(一)主要试剂的配制1.细胞裂解液:根据目的蛋白所处的位置选择恰当的裂解液:(1)胞浆蛋白很容易提取,裂解液中可以不添加任何去污剂;(2)跨膜蛋白由于膜成分的干扰,就需要添加适当的去污剂,例如选取NP-40裂解液或者RIPA缓冲液;(3)与细胞骨架结合的一些蛋白的提取则需要添加如SDS等强去污剂。(4)核内蛋白的提取可以选择RIPA缓冲液。注:Trizol提取的方法在实践中也常常采用,但是会对蛋白质的质量有一定影响,所以此种方法慎用。2.30%(w/v)聚丙烯酰胺:取290g丙烯酰胺,10gBIS(甲叉双丙烯酰胺),加600ml去离子水,充分搅拌溶解,加去离子水将溶液定容至1L,用0.45μm滤器滤去杂质,于棕色瓶中4℃存放。消化道、呼吸道、皮肤粘膜等多种接触途径,可导致遗传物质损伤和基因突变,具有神经毒性,可致癌。3.10%(w/v)SDS:取10g高纯度的SDS,加80ml去离子水,68℃加热溶解,缓慢加入浓盐酸至PH7.2,加蒸馏水至100mL,室温保存。SDS属于强去污剂。4.1.5mMTris-HCL(pH8.8):取181.7gTris-base,加800ml去离子水,充分搅拌溶解缓慢加入浓盐酸至PH8.8,让溶液冷却至室温,加蒸馏水至1L,高温高压灭菌后,室温保存。5.0.5mMTris-HCL(pH6.8):取60.6gTris-base,加800ml去离子水,充分搅拌溶解缓慢加入浓盐酸至PH6.8,让溶液冷却至室温,加蒸馏水至1L,高温高压灭菌后,室温保存。6.10%(w/v)AP(过硫酸铵):提供两种丙稀酰胺聚合所必须的自由基。取1g过硫酸铵,加10ml去离子水后充分溶解,4℃避光保存。注:最好临用前配制,4℃保存1周。超过期限会失去催化作用。对皮肤粘膜有刺激性和腐蚀性。27.TEMED(四甲基乙二胺):催化AP形成自由基而加速两种丙稀酰胺的聚合。PH太低时,聚合反应受到抑制。注:TEMED味道很难闻,每次取200μL左右放入一个干净的离心管中,4℃存放。极易挥发,用完一定要盖紧盖子!8.SDS-PAGE加样缓冲液:pH6.8Tris缓冲液、甘油、SDS、巯基乙醇(高毒、杀虫剂原料、易爆品,新鲜配制!)、溴酚蓝混匀备用。9.10×Tris-甘氨酸电泳缓冲液:30.3gTris,188g甘氨酸,10gSDS,用蒸馏水溶解至1000ml,得0.25mol/LTris-1.92mol/L甘氨酸电极缓冲液。临用前稀释10倍。10.1×转移缓冲液:配制1L转移缓冲液,需称取2.9g甘氨酸、5.8gTris、0.37gSDS,并加入200ml甲醇,加水至总量1L。提前配制。注:甲醛先不加,先将其他配好的溶液搅拌,在开始转膜时,再讲甲醛加进去搅拌。11.NaN30.02%叠氮钠(有毒,戴手套操作):溶于磷酸缓冲盐溶液(PBS),可以防止抗体失活,但会稍影响结合效率,并使HRP失活。12.TBST(洗脱效果好):配制1LTBST:量取100ml10xTBS+900ml超纯水+1mlTween20。13.脱脂奶粉封闭液:100mlTBST中加入5g脱脂奶粉,搅拌均匀。(二)蛋白样品制备1、单层贴壁细胞总蛋白的提取:倒掉培养液→预冷的PBS洗涤细胞→弃去洗液→加裂解液(PMSF100mM/PI1:100),吹匀置于冰上。→冰上裂解30min(不要超过1h),为使细胞充分裂解要经常弹细胞。→于4℃下12000rpm离心10min。→离心后的上清取1ul测浓度,其余加loading煮样后分装放于-20℃保存(1周),-80℃(1月-1年)。注:细胞破碎多采用物理方法,如反复冻融法、冷热交替法、超声波法等。2、组织中总蛋白的提取:用干净的剪刀将组织块尽量剪碎,将少量组织块置于1~2ml匀浆器中球状部位匀浆使组织破碎。然后按照每20毫克组织加入150-250微升裂解液的比例加入裂解液。(如果裂解不充分可以适当添加更多的裂解液,如果需要高浓度的蛋白样品,可以适当减少裂解液的用量。)裂解30min后,即可用移液器将裂解液移至1.5ml3离心管中,然后在4℃下12000rpm离心5min,取上清分装于0.5ml离心管中。注:组织的破碎多采用机械破碎法,如电动捣碎机或匀浆机。使用匀浆机时要注意机器功率的选择,太大也会破坏组织。特别注意的是:①实验期间将蛋白样本保存于冰上;②每份样本吸取均使用新的、一次性吸头;③操作中配戴手套以防止其他蛋白以及蛋白酶的污染;④不要剧烈震荡或过度用力吸取,以减小蛋白变性可能性。(三)蛋白含量的测定蛋白定量的方法很多,如紫外光吸收法、双缩脲法、Bradford、BCA、Lorry法等。其基本原理为用已知浓度的蛋白作标准曲线,然后测目的蛋白的光吸收值,从曲线上查出对应浓度。以上方法各有优缺点,实验室比较常用的为BCA法,具体测定步骤参见试剂盒说明书。注:先做预实验确定所测蛋白浓度是否在标曲范围内,如果不在,还需要稀释蛋白后再测浓度。(四)蛋白质样品的保存1、蛋白必须低温保存,同时添加相应稳定剂,以保持蛋白的生物活性。2、由于冷变性作用,对于甘油(50%,v/v)或硫酸铵(3.2M)蛋白悬浮溶液来说,应该避免冻存。3、避免酶溶液的反复冻融。如果要冻存酶溶液,将酶溶液分装为小份。4、蛋白冻存要迅速,并保存于液氮环境中。长期保存要于蛋白溶液中添加10-20%的甘油。注:高度稀释的蛋白质溶液通常不稳定。如果无法进行快速浓缩,可添加其他蛋白质(例如:BSA,最大约1%。此外,低分子量物质如甘油或蔗糖可帮助稳定蛋白。特定盐离子(阳离子与阴离子)可显著稳定溶液中的蛋白,广泛使用的稳定剂硫酸铵含有最有效的两种离子:NH4+与SO42-。通过添加还原剂,如β-巯基乙醇(终浓度为5-20mM)或二硫苏糖醇(0.5–1mM),可防止半胱氨酸巯基基团的破坏性氧化反应。4(五)WesternBlot操作流程准备工作:(1)清洗玻璃板:手扣紧玻璃板,洗洁精冲干净,制胶面不挂水,晾干/烘干(注:洁净程度应同细胞用品泡酸后的洁净程度,用眼睛看不到杂质)(2)清洗夹子、架子、胶条、电泳槽、梳齿(3)安装并检漏(注:玻璃板对齐,左右同时夹紧,玻板位于胶条中央。装好后要检查是否漏水。)(4)PAGE胶配制:先配分离胶,分离胶凝固后再配浓缩胶。配方具体参见说明书。(注:加入TEMED后快速摇匀后灌胶,动作轻缓,避免产生气泡。TEMED和30%AP的用量决定其凝胶速度,因此要根据实际条件适量添加。)(5)灌胶:夹紧电泳板块,按浓度灌胶,分离胶在下层,浓缩胶在上层;分离胶灌完后用水液封,使其表面平整,凝胶时间20-30min。然后倒水,灌入浓缩胶,立即保持水平/从一边到另一边插入上样梳子。由于胶凝固时体积会收缩减小,从而使加样孔上样体积减小,所以在胶凝固的过程中在两边边不断补加浓缩胶。待到浓缩胶凝固后,两手分别捏住梳子的两边竖直向上轻轻将其拔出。拨出梳子后用ddH2O冲洗胶孔两遍以去除残胶,随后用0.1%的SDS封胶。(注:45度缓慢加水液封,不要过急,以免胶面不平整。要控制胶面高度、配胶时摇动不要过剧、避免产生气泡,掌握合适凝胶时间。由于季节、区域不同,凝胶条件要适时摸索。)(6)制好的胶连同玻板放入电泳槽中。(注:检查玻板方向、排出底部气泡、防漏液)1、上样样品准备每次上样前要将已调整到一致浓度的样品于200μl的EP管中,加入5×SDS上样缓冲液至终浓度为1×,于pcr仪中,99℃,变性10min。对于多次跨膜蛋白,可以于70°C变性5-10分钟。(注:变性后要10000rpm/min,离心1min。采用煮沸的方式变性,规范的操作顺序是煮沸→离心→震荡→再离心。)2、点样每孔上样量为20-40μg蛋白,使用专用枪头或注射针头,勿溢出加样孔。(注:不要吸进气泡、不要上样太快冲出样品、避免交叉污染、补加平衡液。)53、电泳采用不连续凝胶电泳分离蛋白,上层采用低浓度凝胶(浓缩胶)压紧蛋白样品,下层的较大浓度凝胶(分离胶,主体)分离目的蛋白。浓缩胶用80V,跑完浓缩胶换110V,40mA跑分离胶,电泳时间为70mim。(注:电泳过程中要保持电压的稳定,确保跑出来的条带平整。)4、切胶转膜A、转膜前要按照一定的规格将PVDF膜剪裁并在右上角标记好放入甲醇中预处理,转膜液要预冷。滤纸、海绵、夹子、玻棒浸泡于转膜液中。B、将夹子打开使黑的一面保持水平。在上面垫一张海绵垫,用玻棒来回擀几遍以擀走里面的气泡,在海绵上垫三层滤纸。C、从两边轻轻撬动揭开上层玻板,将浓缩胶轻轻刮去,要避免把分离胶刮破,根据目的条带切胶,小心剥下切好的分离胶于滤纸上,调整使其与滤纸对齐,可用缓冲液轻轻赶走气泡。然后将PVDF膜盖于切好的胶面上,在PVDF膜上盖三张滤纸并除去气泡,最后盖上海绵垫,夹紧夹子。(注:整个过程要在转移液中进行,要不断除去气泡,膜两边的滤纸不能相互接触,接触后会发生短路。顺序:黑板→海绵→滤纸→胶→PVDF膜→滤纸→海绵→透明板)D、将夹子转移入槽中,要使夹子的黑板对槽的黑面,夹子的透明板面对槽的红面。110V,180mA,70min。转膜时电极方向是膜正胶负。(注:一定是在冰浴中电转膜,因为电转过程会产热。)E、转膜后用镊子小心将膜反转过来至于干净的平皿中,根据目的条带剪膜并在右上角剪一个角标记。5、TBST洗膜:将膜放于干净的平皿中,用TBST在摇床上洗5次,每次3min.6、膜的封闭将洗过的膜转入含有5%脱脂奶粉封闭液的平皿中,封闭90min-2h,摇床转速不要太快。(注:封闭液选择考虑与检测试剂相适应、封闭充分,背景尽量浅。防止非特异性吸附,封闭一定要充分,分子量标准位置进行标记,避免膜的干燥,否则极易产生较高的背景。)封闭结束后,用TBST洗膜,摇床上洗6次,每次5min。7、抗体杂交6(1)一抗孵育:根据说明书按照适当比例使用TBST稀释一抗,然后将膜转移到含有一抗的管中,4℃孵育过夜或室温(22-25℃)摇动孵育2h。(注:一抗可回收,2-3天内使用,但仅限于是在4℃孵育过夜的,如果是在室温下的,一抗则不能重复利用。抗体用量计算:0.1ml/cm2)一抗孵育结束后,用TBST在摇床上洗6次,每次5min,去除残留一抗。(2)二抗孵育:按照适当比例使用TBST稀释标记HRP的二抗(1:5000),室温孵育1h。二抗孵育结束后,用TBST在摇床上洗6次,每次5min。注:a、单抗专一性高,多抗不如单抗专一性高但更容易得到结果;b、如果不存在高背景的问题,某些抗体用含低浓度(0.5–0.25%)脱脂奶粉或BSA的封闭液来稀释,可产生相对更强的信号条带;c、抗体少还要摸条件(稀释度),可以用剪膜剩下的边角料来先做几组点杂交摸条件,省点时间省点试剂;d、转膜前胶要在转移缓冲液里平衡一下防止胶变形,也有助于进一步去掉可能有碍转膜的杂质。也可在这一步浸泡帮助蛋白复性,可以直接在胶上检测蛋白活性。8、曝光检测发光液配制:现用现配,1ml=900ulH2O+50ul显色剂A+50ulB,A:B=1:1。发光—显影:(1)准备好手套、镊子,擦桌、压片夹,确认暗房试剂、工具、X光片。(2)铺上保险膜,将洗完二抗的PVDF膜吸水纸控干,正面向上,快速均匀涂上发光液,1min(5min内)。(3)用纸巾吸去多余的发光液,用保鲜膜封好膜,正面向上置于压片夹内。(4)戴上手套,迅速进暗室中,打开红灯,剪合适大小X光片使胶片暴光1-5分钟,暴光时间几秒~长到数小时。冲洗胶片:先在显影液中冲洗至胶片上出现条带,再放入水中漂洗,最好定影液中漂洗至胶片透明。若取出后发现没有定影好可重新置定影液中定影至完全透明。自来水冲洗(不能用手摸)、晾干。曝光要快。9、凝胶图像分析:将胶片进行扫描拍照,用凝胶图像处理系统分析目的条带的分子量和净光密度,分析表达差异。
本文标题:WesternBlot实验详细介绍
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