微生物的分类与命名

1微生物的分类与命名2微生物的范围细菌支原体螺旋体立克次体衣原体放线菌真菌病毒原核型单细胞真核型单细胞非细胞形态3分类等级界(kingkom)门(divisions)纲(classes)目(orders)科(families)属(genera)种(species)4原核生物和真核生物的比较原核生物真核生物核无核膜、核仁、只有拟核有核膜、核仁和染色体细胞器无线粒体、细胞器不完善完整的细胞器、有线粒体细胞壁基本成分肽聚糖无肽聚体细胞分裂二分裂有丝分裂、芽生5第二节细菌的分类单位、系统和命名6一、细菌的分类单位和命名种:是细菌分类的基本单位。形态学和生理学性状相同的细菌群体构成一个菌种。属：性状相近、关系密切的若干菌种组成属。科：相近的属归为一个科。7菌株：同一种不同来源的细菌称为该菌的不同菌株。标准株（standardstrain：具有某种细菌典型特征的菌株称为该菌的标准株。8细菌种的科学命名法：1、英文名拉丁文双命名法属名在前：为名词，首字母大写种名在后：为形容词，首字母小写斜体例：结核分枝杆菌Mycobacteriumtuberculosis2、中文译名种名在前、属名在后亚种以上分类按命名法规的规定，亚种以下命不受法规约束。9《国际细菌命名法规》（InternationalCodeofNomenclatureofBacteria，简称ICNB）：决定细菌的命名。《国际系统菌学杂志》(InternationalJournalofSystematicBacteriology;IJSB)：发表新细菌命名提案。10二、细菌的分类系统1、《伯杰系统细菌学手册》（Bergey’sManualofSystemicBacteriology）11自1923年《伯杰鉴定细菌学手册》（Bergey’smannualofdeterminativebacteriology）第一版问世以来，每隔四五年修订一次，至1974年已出版至第八版。1984年将其易版为《伯杰系统细菌学手册》（Bergey’smanualofsystemicbacteriology），共分4卷。在此新版中，对细菌的高级分类作了重新安排，以细菌细胞壁的结构特点，将原核生物界分为4个菌门：薄壁菌门（Gracilicutes）、厚壁菌门（Firmicutes）、软壁菌门（Tenericutes）和疵壁菌门（Mendosicutes）。12伯杰系统细菌学手册第1卷（1984年）登载医学、工业和普通微生物中重要革兰阴性细菌；第2卷（1986年）为放线菌外的革兰阳性菌，第3卷为古细菌、蓝藻菌和其他革兰阴性菌；第4卷为放线菌。132、CDC（centerfordiseasecontrolandprevention）分类该系统由美国疾病控制和预防中心（centerfordiseasecontrolandprevention，CDC）使用核酸杂交和核酸序列分析结果编排。14三、细菌的分类方法15一、生理学与生物化学分类法1、传统分类法19世纪以来，以细菌的形态、生理特征为依据的分类奠定了传统的分类基础。选择一些较为稳定的生物学性状，如细菌的形态结构、染色体、培养特性、生化反应、抗原性作为分类依据，然后按主次顺序逐级区分。这种方法使用方便，分类亦较为明确，但往往带有一定程度的盲目性。162、数值分类法20世纪60年代，随计算机的应用而发展的细菌分类方法。它对细菌的各种生物学性状按“等重要原则”进行分类，一般需选用50项以上的生理、生化指标逐一进行比较，通过计算机分析各菌间相似度，划分细菌的属和种，并确定它们的亲缘关系。17二、遗传学分类法1、DNAG+Cmol%测定DNA分子两条链上4种碱基的总分子量为100，测定其中G+G或A+T摩尔百分比，能反映出细菌间DNA分子同源程度，习惯上以G+C作为细菌分类标记。不同菌属间的G+Cmol%范围很大，在25%~75%之间，但同一种细菌G+Cmol%相当稳定，不受菌龄、培养条件和其他外界因素影响，亲缘关系越近的细菌，它们G+Cmol/%越相近。目前测定的技术多用加热变性法。18加热变性的DNA由于双链DNA分开，使A260紫外吸收度增加。紫外吸收度的增加与解链程度成正比。用Tm表示DNA分子中50%解链时的温度，Tm随G+Cmol%的含量线性增加。在通常条件下，G+Cmol%为40的DNA其Tm约为87℃，每增加1%G+Cmol含量，Tm约增加0.4℃，因而通过Tm可测出G+Cmol%含量。192、核酸同源值测定利用DNA分子杂交技术测定DNA分子的相似度，此办法较精确。其基本步骤均是先提取菌株的DNA，加热变性解链，然后将两种变性的DNA（其中一种为标记DNA或rRNA）混合液在一定的温度下保温复性，重新得到杂交的双螺旋DNA分子，鉴定其双螺旋结合率。结合率的大小反映了DNA碱基序列的相似程度和菌种之间的亲缘关系的亲疏。DNA/DNA杂交时，同一菌的结合率为100%，80%~90%的同源为同一种内、同一亚种的细菌，60%~70%的同源性为同一种内不同亚种的细菌，20%~60%则认为是同一属中的不同菌种。203、核蛋白体RNA碱基序列测定细菌核蛋白体RNA序列比较保守，其变化十分缓慢。分离细菌16SrRNA，用T1核酸酶消化，分析寡核苷酸的碱基序列可测出rRNA的相关性。目前，由细菌16SrRNA序列分析已分出了真细菌和古细菌，前者包括；后者主要为伯杰手册中疵壁菌门内的细菌。