生物化学与生物物理进展Progress

多肽分子疏水性的电喷雾飞行时间质谱法快速测定作者：周跃明，王伟萍，梁华正，张燮，陈焕文，陈兰慧，ZHOUYue-Ming，WANGWei-Ping，LIANGHua-Zheng，ZHANGXie，CHENHuan-Wen，CHENLan-Hui作者单位：周跃明,王伟萍,梁华正,张燮,ZHOUYue-Ming,WANGWei-Ping,LIANGHua-Zheng,ZHANGXie(东华理工学院应用化学系,抚州,344000)，陈焕文,CHENHuan-Wen(东华理工学院应用化学系,抚州,344000;吉林大学化学学院,长春,130021)，陈兰慧,CHENLan-Hui(东北师范大学化学学院功能材料化学研究所,长春,130024)刊名：生物化学与生物物理进展英文刊名：PROGRESSINBIOCHEMISTRYANDBIOPHYSICS年，卷(期)：2006，33(10)引用次数：0次参考文献(34条)1.DillKAThemeaningofhydrophobicity1990(4978)2.PrivalovPL.GillSJ.MurphyKPThemeaningofhydrophobicity-response1990(4978)3.LeskAMHydrophobicity-gettingintohotwater2003(2-3)4.TrovatoA.HoangTX.BanavarJRWhatdeterminesthestructuresofnativefoldsofproteins?2005(18)5.PhoenixDA.HarrisF.DamanOAThepredictionofamphiphilicalpha-helices2002(2)6.TossiA.SandriL.GiangasperoAAmphipathic,alpha-helicalantimicrobialpeptides2000(1)7.TanfordCHowproteinchemistslearnedaboutthehydrophobicfactor1997(6)8.马飞.武耀廷.许晓风遗传密码子和氨基酸若干物理化学特性的相关性研究[期刊论文]-安徽农业大学学报2003(4)9.王克夷疏水作用和蛋白质[期刊论文]-生命的化学1999(5)10.MahatoRI.NarangAS.ThomaLEmergingtrendsinoraldeliveryofpeptideandproteindrugs2003(2-3)11.KraftA.HowarthNM.EvansRDeterminationofliposome-waterpartitioncoefficientsofpharmaceuticaldrugsusingasimplelaboratorytitrator200512.DuQS.LiDP.HeWZHeuristicmolecularlipophilicitypotential(HMLP):Lipophilicityandhydrophilicityofaminoacidsidechains2006(6)13.BerthodA.Carda-BrochSDeterminationofliquid-liquidpartitioncoefficientsbyseparationmethods2004(1-2)14.DeboltSE.KollmanPAInvestigationofstructure,dynamics,andsolvationin1-Octanolanditswater-saturatedsolution-molecular-dynamicsandfree-energyperturbationstudies1995(19)15.EssexJW.ReynoldsCA.RichardsWGTheoreticaldeterminationofpartition-coefficients1992(10)16.DunneLAFan-deltasandbraiddeltas-Varietiesofcoarse-graineddeltas-discussion1998(8)17.BennaimATheRoleofhydrogen-bondsinproteinfoldingandproteinassociation1991(3)18.JorgensenWL.BriggsJM.ContrerasMLRelativepartition-coefficientsfororganicsolutesfromfluidsimulations1990(4)19.AbrahamDJ.KelloggGE.InKH3D-QSARinDrugDesign:Theory,MethodsandApplications199320.LehningerAL.NelsonDL.CoxMMPrinciplesofbiochemistry199321.HeidenW.MoeckelG.BrickmannJAnewapproachtoanalysisanddisplayoflocallipophilicity/hydrophilicitymappedonmolecularsurfaces1993(7)22.王亭.周家驹疏水作用及其研究进展1999(13)23.HessaT.KimH.BihlmaierKRecognitionoftransmembranehelicesbytheendoplasmicreticulumtranslocon2005(27)24.FauchereJL.PliskaVHydrophobicparameters-PIofamino-acidside-chainsfromthepartitioningofN-acetyl-amino-acidamides1983(4)25.KitchellJA.ClarkDL.GombosAMBiologicaselectivityofextinction:alinkbetweenbackgroundandmassextinction1986(1)26.ConstantopoulosTL.JacksonGS.EnkeCGChallengesinachievingafundamentalmodelforESI2000(1)27.HendricksonCL.EmmettMRElectrosprayionizationFouriertransformioncyclotronresonancemassspectrometry199928.BenNAHydrophobicInteraction198029.NichollsA.SharpKA.HonigBProteinfoldingandassociation-insightsfromtheinterfacialandthermodynamicpropertiesofhydrocarbons1991(4)30.MeekJL.RossettiZLFactorsaffectingretentionandresolutionofpeptidesinhigh-performanceliquid-chromatography1981(1)31.GuoDC.MantCT.TanejaAKPredictionofpeptideretentiontimesinreversed-phasehigh-performanceliquidchromatography.1.determinationofretentioncoefficientsofamino-acid-residuesofmodelsyntheticpeptides198632.GuoDC.MantCT.TanejaAKPredictionofpeptideretentiontimesinreversed-phasehigh-performanceliquidchromatography.2.correlationofobservedandpredictedpeptideretentiontimesandfactorsinfluencingtheretentiontimesofpeptides198633.GaillardP.CarruptPA.TestaBMolecularlipophilicitypotential,atoolin3dQsar--methodandapplications1994(2)34.HeidenW.MoeckelG.BrickmannJAnewapproachtoanalysisanddisplayoflocallipophilicityhydrophilicitymappedonmolecular-surfaces1993(5)相似文献(10条)1.学位论文于泓鹏大豆蛋白水解多肽的聚集机理及其调控2005本文主要以大豆蛋白水解过程的聚集行为为研究对象，较为系统地研究了水解物或其疏水性多肽组分的动态聚集过程，掌握了它们在不同条件下的聚集行为和规律；并利用多肽的聚集机理，探索了新型蛋白凝胶技术、新型活性肽分离技术及新型“抗消化蛋白”(anti-digestiveproteins)功能性基料的生产制备技术等。采用SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)，分析比较了枯草杆菌蛋白酶、胰蛋白酶、胰凝乳蛋白酶、木瓜蛋白酶和细菌碱性蛋白酶对大豆分离蛋白(SPI)的降解模式，结果表明：木瓜蛋白酶对大豆分离蛋白的降解最迅速、彻底，而胰蛋白酶和胰凝乳蛋白酶对大豆蛋白的降解能力较差，枯草杆菌蛋白酶对SPI的降解也较快，它对β-伴球蛋白(β-conglycinin)以外的其他亚基均有较强的水解能力。大豆球蛋白酸性亚基的A,x多肽链最容易被水解，所有的酶对其都有作用，而碱性亚基和β-伴球蛋白最难被水解。同时分析比较了几种检测聚集行为的方法，建立了简便可行的浊度法检测聚集行为。采用浊度法可以观测到这几种蛋白酶均能诱导SPI蛋白聚集，但它们聚集的趋势不尽相同，其中枯草杆菌蛋白酶诱导的聚集过程各个阶段均较清晰，聚集过程较有代表性，本文主要以它为对象进行深入研究。酶促聚集过程的浊度变化结合pH-stat法测定的水解度变化表明，聚集过程明显受水解度影响，多肽的生成和聚集行为密不可分。SDS-PAGE分析结果进一步显示，组成聚集物的主要组分是分子量小于6.5kDa小分子多肽。聚集速率随着SPI蛋白和枯草杆菌蛋白酶的浓度的增加而升高，但是升高的幅度有明显差别；适度的预热处理有利于酶促聚集速率的提高，但过度的热处理不利于酶促聚集；蛋白酶抑制剂PMSF在聚集的不同阶段对聚集行为的影响不尽相同，但总的来说会延缓聚集行为；高温有利于多肽的聚集，65℃时聚集的速率约为25℃时的四倍，而低温有利于最终聚集物结构的稳定存在；低离子强度条件下pH4.0时聚集物的浊度最大，在pH4.0附近加入NaCl使浊度变低，而在偏离pH4.0时浊度升高；聚集物在溶液中的浊度随着溶液介电常数的降低而降低，而冷冻干燥后的聚集物的浊度变化呈相反趋势。β-伴球蛋白和大豆球蛋白对大豆蛋白的酶促聚集的贡献不同，β-伴球蛋白对大豆蛋白酶促聚集的贡献最大，而大豆球蛋白对聚集过程贡献较小。表面疏水性和荧光光谱分析显示酶解造成SPI蛋白疏水核心的暴露，而在在聚集过程中球蛋白发生了结构重排，将疏水区域重新埋藏在聚集物结构的内部。溶解度实验表明非共价键(主要是疏水相互作用)是聚集的主要作用力，而二硫键并未参与或较少参与聚集物的形成，氨基酸分析进一步证实了这种观点，聚集物中疏水性氨基酸含量高于SPI，而亲水性氨基酸含量相对较低。通过以上研究可以推论酶促聚集的机理：大豆分离蛋白热处理时，球蛋白部分展开，加速了蛋白酶对大豆球蛋白的降解。在水溶液中蛋白酶首先攻击处于蛋白质分子表面亲水性区域的链段，处于分子内部的疏水性区域暴露出来，一部分肽链可以通过自组装重新将这些疏水性区域埋藏起来，更多的含有疏水性区域