生物化学考研名词解释 (华师大)part1

生物化学名词解蛋白质化学两性离子指在同一氨基酸分子上含有等量的正负两种电荷，又称兼性离子或偶极离子。氨基酸是含有一个碱性氨基和一个酸性羧基的有机化合物，氨基一般连在α-碳上。等电点pI使分子处于兼性分子状态，在电场中不迁移（分子的静电荷为零）的pH值必需氨基酸指人体（和其它哺乳动物）自身不能合成，机体又必需，需要从饮食中获得的氨基酸。凯氏定氮法蛋白质与亚硝酸反应，产生氮气，通过产生的氮气的量，来计算蛋白质的含量茚三酮反应在加热条件下，氨基酸或肽与茚三酮反应生成紫色（与脯氨酸反应生成黄色）化合物的反应。纸层析是用滤纸作为支持物的一种分配层析，他是利用极性和非极性氨基酸在水和有机溶剂中溶解度不同的特点，在滤纸上进行分离的一种方法分配层析利用固定相与流动相之间对待分离组分溶解度的差异来实现分离的一种方法Rf值样品中某成分在纸层析或薄层层析特定溶剂系统中移动的距离与流动相前沿的距离之比。肽两个或两个以上氨基通过肽键共价连接形成的聚合物肽键一个氨基酸的羧基与另一个的氨基的氨基缩合，除去一分子水形成的酰氨键。双缩脲反应白质在碱性溶液中与硫酸铜作用形成紫蓝色络合物的呈色反应。在540nm波长处有最大吸收。可用于蛋白质的定性和定量检测。一级结构指蛋白质多肽链中氨基酸的排列顺序，以及二硫键的位置二级结构指在蛋白质分子中的局部区域内，多肽链沿一定方向盘绕和折叠的方式。三级结构指蛋白质在二级结构的基础上借助各种次级键卷曲折叠成特定的球状分子结构的构象。四级结构指多亚基蛋白质分子中各个具有三级结构的多肽链以适当方式聚合所呈现的三维结构。超二级结构指蛋白质分子中相邻的二级结构单位组合在一起所形成的有规则的、在空间上能辨认的二级结构组合体。结构域指蛋白质多肽链在二级结构的基础上进一步卷曲折叠成几个相对独立的近似球形的组装体。构型指在立体异构体中不对称碳原子上相连的各原子或取代基团的空间排布。构型的转变伴随着共价键的断裂和重新形成。构象指有机分子中，不改变共价键结构，仅单键周围的原子旋转所产生的原子的空间排布。一种构象改变另一种构象时，不涉及共价键的断裂和重新形成。构象改变不会改变分子的光学活性。离子键带相反电荷的基团之间的静电引力，也称为静电键或盐键。氢键指负电性很强的氧原子或氮原子与N-H或O-H的氢原子间的相互吸引力Edman降解从多肽链游离的N末端测定氨基酸残基的序列的过程。N末端氨基酸残基被苯异硫氰酸酯修饰，然后从多肽链上切下修饰的残基，再经层析鉴定，余下的多肽链（少了一个残基）被回收再进行下一轮降解循环。肽平面肽链主链上的肽键因具有双键性质，不能自由旋转，使连接在肽键上的6个原子共处的同一平面。α螺旋蛋白质中常见的二级结构，肽链主链绕假想的中心轴盘绕成螺旋状，一般都是右手螺旋结构，螺旋是靠链内氢键维持的。每个氨基酸残基（第n个）的羰基与多肽链C端方向的第4个残基（第4+n个）的酰胺氮形成氢键。在古典的右手α-螺旋结构中，螺距为0.54nm，每一圈含有3.6个氨基酸残基，每个残基沿着螺旋的长轴上升0.15nm.疏水键非极性分子之间的一种弱的、非共价的相互作用。范德华力中性原子之间通过瞬间静电相互作用产生的一种弱的分子间的力。当两个原子之间的距离为它们的范德华半径之和时，范德华力最强。波尔效应CO2浓度的增加降低细胞内的pH，引起红细胞内血红蛋白氧亲和力下降的现象。DPG2,3-二磷酸甘油酸是红细胞中大量存在的糖代谢的中间产物。它能降低血红蛋白与氧气的亲和力，使血红蛋白的氧合曲线右移，但对氧和血红蛋白没有影响。盐析质溶液中加入一定量的高浓度中性盐（如硫酸氨），使蛋白质溶解度降低并沉淀析出的现象称为盐析。盐溶在蛋白质溶液中加入少量中性盐使蛋白质溶解度增加的现象。蛋白质的复性指在一定条件下，变性的蛋白质分子恢复其原有的天然构象并恢复生物活性的现象。层析按照在移动相（可以是气体或液体）和固定相（可以是液体或固体）之间的分配比例将混合成分分开的技术。分级盐析不同蛋白分子发生盐析所要求的离子浓度不同，因此可以通过在蛋白质溶液中加入不同量的中性盐，使不同蛋白质分别沉淀蛋白质的沉淀作用在外界因素影响下，蛋白质分子失去水化膜或被中和其所带电荷，导致溶解度降低从而使蛋白质变得不稳定而沉淀的现象称为蛋白质的沉淀作用。蛋白质的变性蛋白质分子的天然构象遭到破坏导致其生物活性丧失的现象。蛋白质在受到光照、热、有机溶剂以及一些变性剂的作用时，次级键遭受到破坏，导致天然构象的破坏，使蛋白质的生物活性丧失。超滤利用压力或离心力，使水和其它小分子物质通过半透膜，而大分子蛋白质被截留在膜上，从而起到浓缩和脱盐的作用。疏水作用层析是利用蛋白质表面的非极性基团和介质上的非极性基团间的疏水作用来分离蛋白质的方法凝胶过滤层析也叫做分子排阻层析。一种利用带孔凝胶珠作基质，按照分子大小分离蛋白质或其它分子混合物的层析技术。亲和层析利用共价连接有特异配体的层析介质，分离蛋白质混合物中能特异结合配体的目的蛋白质或其它分子的层析技术。SDS-聚丙烯酰氨凝胶电泳（SDS-PAGE）：在去污剂十二烷基硫酸钠存在下的聚丙烯酰氨凝胶电泳。SDS-PAGE只是按照分子的大小，而不是根据分子所带的电荷大小分离的凝胶电泳以凝胶为介质，在电场作用下分离蛋白质或核酸等分子的分离纯化技术。透析（dialysis）通过小分子经过半透膜扩散到水（或缓冲液，将小分子与生物大分子分开的一种分离纯化技术。等电聚胶电泳（IFE）：利用一种特殊的缓冲液（两性电解质）在聚丙烯酰氨凝胶制造一个pH梯度，电泳时，每种蛋白质迁移到它的等电点（pI）处，即梯度足的某一pH时，就不再带有净的正或负电荷了高压液相层析（HPLC）：使用颗粒极细的介质，在高压下分离蛋白质或其他分子混合物的层析技术。双向电泳等电聚胶电泳和SDS-PAGE的组合，即先进行等电聚胶电泳（按照pI）分离，然后再进行SDS-PAGE（按照分子大小分离）。经染色得到的电泳图是二维分布的蛋白质图镰刀型细胞贫血病血红蛋白分子遗传缺陷造成的一种疾病，病人的大部分红细胞呈镰刀状。其特点是病人的血红蛋白β—亚基N端的第六个氨基酸残缺是缬氨酸（val），而不是下正常的谷氨酸残基(Gln)。分子病：蛋白质分子一级结构的改变引起其生物功能的显著变化，甚至引起疾病。这种现象称为分子病米伦反应米伦试剂是硝酸汞、亚硝酸汞硝酸和亚硝酸的混合物，蛋白质加入米伦试剂后即产生白色沉淀，加热后变成红色。酚类化合物有此反应，酪氨酸及含酪氨酸的化合物都有此反应乙醛酸反应在蛋白溶液中加入乙醛酸，并沿试管壁慢慢注入浓硫酸，在两液层之间就会出现紫色环，凡含有吲哚基的化合物都有此反应。不含色氨酸的白明胶就无此反应。坂口反应精氨酸的胍基能与次氯酸钠（或次溴酸钠）及α萘酚在氢氧化钠溶液中产生红色物质。此反应可用来鉴定含精氨酸的蛋白质，也可定量测定精氨酸含量。费林反应（Folin-酚）酪氨酸的酚基能还原费林试剂中的磷钼酸及磷钨酸，生成蓝色化合物。可用来定量测定蛋白含量。它是双缩脲反应的发展，灵敏度高。化学修饰是指在较温和的条件下，以可控的方式使蛋白质与某种化学试剂起特异反应，以引起蛋白质中个别氨基酸侧链官能团发生共价化学改变。核酸化学核苷是嘌呤或嘧啶碱通过共价键与戊糖连接组成的化合物。核糖与碱基一般都是由糖的异头碳与嘧啶的N-1或嘌呤的N-9之间形成的β-N-糖键连接核苷酸核苷的戊糖成分中的羟基磷酸化形成的化合物。稀有碱基又称修饰碱基，这些碱基在核酸分子中含量比较少，但他们是天然存在不是人工合成的，是核酸转录之后经甲基化、乙酰化、氢化、氟化以及硫化而成。多半是主要碱基的甲基衍生物。tRNA中含有修饰碱基比较多，有的tRNA含有的稀有碱基达到10％。假尿苷假尿嘧啶核苷是由于碱基与核糖连接方式的与众不同，即尿嘧啶5位碳与核苷形成的C-C糖苷键。是一种特殊的核苷cAMP环化核苷酸磷酸同时与核苷上两个羟基形成酯键，就形成环化核苷酸。最常见的是3',5'-环化腺苷酸(cAMP)和cGMP。它们是激素作用的第二信使，起信号传递作用。可被磷酸二酯酶催化水解，生成相应的5'-核苷酸。转化（作用）一个外源DNA通过某种途径导入一个宿主菌，引起该菌的遗传特性改变的作用。转导（作用）借助于病毒载体，遗传信息从一个细胞转移到另一个细胞。拓扑异构酶通过切断DNA的一条或两条链中的磷酸二酯键，然后重新缠绕和封口来改变DNA连环数的酶。拓扑异构酶Ⅰ、通过切断DNA中的一条链减少负超螺旋，增加一个连环数。某些拓扑异构酶Ⅱ也称为DNA促旋酶。核小体用于包装染色质的结构单位，是由DNA链缠绕一个组蛋白核构成的。限制性内切酶一种在特殊核甘酸序列处水解双链DNA的内切酶。Ⅰ型限制性内切酶既能催化宿主DNA的甲基化，又催化非甲基化的DNA的水解；而Ⅱ型限制性内切酶只催化非甲基化的DNA的水解。限制性内切酶一般识别具有回文序列的结构反向重复序列在同一多核甘酸内的相反方向上存在的重复的核甘酸序列。在双链DNA中反向重复可能引起十字形结构的形成。限制酶图谱（指纹图谱）同一DNA用不同的限制酶进行切割，从而获得各种限制酶的切割位点，由此建立的位点图谱有助于对DNA的结构进行分析。黏性末端II型限制酶在限制性片段上留下的单链末端，可与对应的单链末端互补结合。平整末端当限制酶从识别序列的中心轴线处切开时，切开的DNA两条单链的切口，是平整的，这样的切口叫平末端。链终止法核酸模板在核酸聚合酶、引物、四种单脱氧碱基存在条件下复制或转录时，如果在四管反应系统中分别按比例引入四种双脱氧碱基，只要双脱氧碱基掺入链端，该链就停止延长，链端掺入单脱氧碱基的片段可继续延长。如此每管反应体系中便合成以共同引物为5’端，以双脱氧碱基为3’端的一系列长度不等的核酸片段。反应终止后，分四个泳道进行电泳。以分离长短不一的核酸片段(长度相邻者仅差一个碱基)，根据片段3’端的双脱氧碱基，便可依次阅读合成片段的碱基排列顺序。夏格夫法则所有DNA中腺嘌呤与胸腺嘧啶的摩尔含量相等（A=T），鸟嘌呤和胞嘧啶的摩尔含量相等（G=C），既嘌呤的总含量相等（A+G=T+C）。DNA的碱基组成具有种的特异性，但没有组织和器官的特异性。另外，生长和发育阶段`营养状态和环境的改变都不影响DNA的碱基组成。大沟和小沟绕B-DNA双螺旋表面上出现的螺旋槽（沟），宽的沟称为大沟，窄沟称为小沟。大沟，小沟都、是由于碱基对堆积和糖-磷酸骨架扭转造成的。Hoogsteen配对形成三股螺旋时，中间一条肯定是多聚嘌呤，在三条链中，双螺旋的两条链通过正常的Watson-Crick配对，而第三条链与中间那条链的配对称为Hoogsteen配对（形成Hoogsteen氢键）H-DNA是由部分未缠绕的复合DNA中的一个富嘧啶链，经回折同复合体中伸展的富嘌呤链间形成Hoogsteen氢键而形成的分子内三螺旋，即DNA的双链所形成的三链螺旋。超螺旋DNA的三级结构是指双螺旋的进一步扭曲。其基本形式是超螺旋，即螺旋的螺旋。因为超螺旋是在双螺旋的张力下形成的，所以只有双链闭合环状DNA和两端固定的线形DNA才能形成超螺旋，有切口的DNA不能形成超螺旋。cDNA与RNA链互补的单链DNA，以其RNA为模板，在适当引物的存在下，由依赖RNA的DNA聚合酶（反转录酶）的作用而合成，并且在合成单链cDNA后，在用碱处理除去与其对应的RNA以后，以单链cDNA为模板，由依赖DNA的DNA聚合酶或依赖RNA的DNA聚合酶的作用合成双链cDNA。A260/A280核酸在260nm有紫外吸收峰，蛋白质在280nm。一般测定OD260/OD280，DNA=1.8，RNA=2.0。变性在一定条件下，双链DNA解链变成单链DNA的现象称为变性或熔化。熔解温度（Tm值）双链DNA熔解彻底变成单链DNA的温度范围的中点温度。增色效应:当DNA从双螺旋结构变为单链的无规则卷曲状态时，它在260nm处的吸收便增加，这叫“增色效应”。减色效应变性DNA复性形成双螺旋结构后，其260nm紫外吸收会降低,这种现象叫减色效应复性分数1f1kCotCot指一定条件下的复性速度，Co