生物医学资讯实验室

生物醫學資訊實驗室BioMedicalInformaticsLaboratoryDr.Der-MingLiouAssociateProfessor&ChairmanInstituteofHealthInformaticsandDecisionMakingNationalYang-MingUniversity個人簡歷•學歷–清華大學化學工程學士–伊利諾理工電腦科學碩士–伊利諾理工電機工程博士•經歷–美國AudioDigitalImageCo.軟體工程師及經理–逢甲大學資訊工程系副教授–逢甲大學資訊中心建教合作組主任–陽明大學資訊與通訊中心主任Visions•Toprovidephysicianatransparentandintegratedviewfromdisease、organtogenome•Toprovidepublichealthresearcheratransparentviewtopublichealthdataresources•ToprovidepeopleatransparentviewtoaccesspersonalhealthinformationDiseasesDiseasesClinicalInformaticsImagingInformaticsPublicHealthInformaticsBioInformaticsClinicalInformaticsImagingInformaticsPublicHealthInformaticsBioInformaticsDiseasesPatientIndividualOrganTissueSocietyCountryGeneCellDiseases臨床資訊系統護理資訊系統多媒體電子病歷醫學辭彙與疾病分類自然語言處理遠距醫療3D影像重組影像辨識影像註解傳染病通報與疫情調查疫情資訊系統衛生行政資訊系統健保資料倉儲微陣列資料庫微陣列資料分析反應路徑資料庫反應路徑視覺化模擬Diseases尹彙文大夫陳維雄大夫陳世真大夫宋晏仁老師陳志誠老師台大陳秀熙老師楊永正老師DiseasesBioInformaticsSoftwareTools(BIST)SystemArchitectureMicroArrayRepositorySystemImageProcessingSystemDataAnalysis&SystemViewPathwayDrawingToolsPathwaySimulation&VisualizationPathwayLoaderPathwayDatabaseManagementSystemAnalysisWorkflowSystemPathwayMiningToolsIntegratedResourceFinderGeneOntologyImageProcessingFunctionalities–TIGR•SpotFinding•BackgroundSubtraction•Reproducibility•Measure–medianvs.mean•QualityMeasuresDataAnalysis&ViewSystemFunctionalities-TIGR•Presentation•MultipleViews•Normalization•IdentificationofDifferentiallyExpressedGene•MultipleExperimentsMicroArrayRepositorySystem(MARs)MicroarrayDatabaseMARsSybaseJava-basedClientClientClientClientMARsFunctionalities•DataStorage–Experiments–Images–protocols•DataLoadandRetrieve•AccessControlPathwayDrawingToolsFunctionalities•Drawpathwayswitheasytousegraphicstools•Storepathwaytodatabase•Retrievepathwayfromdatabase•Importgraphicfile•ExportgraphicfileDataAnalysisandViewSystemFunctionalities•ProvideWebService•Integrateanalyticsoftware•Createpersonalprofile•Addsoftwarecomponenttopersonalprofile•RemovesoftwarecomponentfrompersonalprofileIntegrateResourceFinderFunctionalities•Firststage–AccomplishwithIBMDiscoveryLinkandMessageQueue•Secondstage–Createmessageserver–Createmediator–Createwrapper•Thirdstage–LinkwithGeneOntologyClinicalInformaticsEMRPACsRISBedSideMonitorImageModalityMobileDeviceforNurse/PhysicianLISLabInstrumentTransparentIntegratedViewHINTIntegratedEnvironmentMedicalRecordFreeTextBrowser-basedMultimediaPatientRecordFromInternet多媒體電子病歷系統研究方向WebServices•Naturallanguageprocessing/speechrecognition•Multimediadatabase-coreof–EMR–RIS–PACs•HL-7medicalrecordexchange•DICOMmedicalimage遠距醫療研究方向•遠距醫療(居家照護)環境建置–Tele-monitoring–Tele-consultation–Tele-diagnosis–HealthcareIA•緊急醫療資訊系統–GIS/GPS–PDAwithwirelesscommunicationfacility•PHS,GPRS,3G資料倉儲研究HISHISHISDWDataMining提供公共衛生及醫管人員快速資料分析的工具及環境過去及現在執行之研究計劃HINT•醫學數位圖書館系統建置與服務支援之規劃與實現(86/10~87/6)•國家衛生研究院核心計劃：醫學衛生研究資訊網規劃建置與服務推廣計劃第一期(87/7~88/6)•國家衛生研究院核心計劃：醫學衛生研究資訊網規劃建置與服務推廣計劃第二期(88/7~89/12)•國家衛生研究院核心計劃：醫學衛生研究資訊網系統維護與服務支援提升之規劃與實現(90/1~90/12)•國家衛生研究院核心計劃：醫學衛生研究資訊網系統維護與服務支援提升之規劃與實現(91/1~91/12)HINT的後續研究方向•Documentdeliversystem•Evident-basedmedicalsystem–建立本土化病歷參考中心•LinkwithUMLS(UnifiedMedicalLanguageSystem)•LinkwithGeneannotationdatabase•Linkwithdiseasedatabase生物資訊研究計劃•基因體定序及資料庫相關研究之生物資訊支援計劃第一期(87/8-88/7)•基因體定序及資料庫相關研究之生物資訊支援計劃第二期(88/8-89/7)•基因體定序及資料庫相關研究之生物資訊支援計劃第三期(89/8-90/7)•微陣列數據資料庫的設計與建置(90/8~91/7)•WebbioProject•Bio-MirrorProject•S-StarProject衛生資訊行政系統計劃•基層衛生局所網路標準架構與網路問題解決資訊系統之規劃與建立(88/1~88/6)•基層衛生局所資訊系統架構與網路應用之規劃(88/1~88/6)•全國基層衛生醫療資訊網路建設之諮詢顧問服務導入計劃(89/4~89/12)•二代全國醫療資訊網計劃-電子病歷交換標準格式測試系統(89/7~90/3)疫情資訊系統計劃•傳染病通報管理資訊系統疫情調查子系統以Intranet方式開發第一期計劃(86/1~86/6)•傳染病通報管理資訊系統疫情調查子系統以Intranet方式開發第二期計劃(86/7~87/6)•傳染病通報管理資訊系統疫情調查子系統以Intranet方式開發第三期計劃(87/7~88/6)•新防疫資訊系統整合開發計劃(88/1~88/6)•HL7在傳染病通報資料交換之研究(90/1~90/12)目前執行研究計劃•以醫療資訊學作為醫牙學基礎教育之基礎(教育部)•社區整合型預防保健資訊管理系統之設計及評估-基隆地區先趨性研究(國科會)實驗室•醫學館214室(研究生)•醫學館211室(研究助理)–莊人祥老師借用•醫學館209室(設備機房)實驗設備•一部SUN880伺服器–CPU*2–4GBRAM•二部HPLH6000伺服器–CPU*4–1GBRAM–DiskArray•三部SunUltraWorkstation•一部SunSPARCWorkstation•一部IBMR6000Workstation•一部HPE-60伺服器實驗室成員•博五黃衍文•博五蕭盛雄•博三陳立昇•博二王哲彥•博二張偉斌•博一?•碩三黃曉怡•碩二李宜芳•碩二唐愷隆•碩二賴淑美•碩二黃國權•碩二王俊人•碩二張幸宇•碩一?實驗室畢業同學•賴明和：疾病管制局•孫漣：衛生署醫政處•蔡國卿：耕莘醫院資訊室•邱淑怡：國家衛生研究院研究資源處企劃組•杜屏瑩：英瑞得資訊•林伊蓉：明尼蘇打大學醫學資訊博士班•朱自強：思訊科技•劉松明：智庫科技•潘美連：耕莘護專•張芳聆：英瑞得資訊•陳曉婷：智庫科技•吳尚蓉：東元電機碩士班研究生訓練目標•技術導向–從參予計劃中學習–UNIX,Windows/NT,Linux–SQLServer,Sybase,Oracle–N-tierclient-server,Distributedsystem•畢業要求—可以獨立作業–從有想法開始–可行性評估–系統設計–系統實作–系統評估博士班研究生訓練目標•研究導向–理論為基礎–技術為導向–參與專案–協同主持專案•畢業要求—可獨立研究及專案管理–提出兩個研究計劃申請案並獲得通過–帶領碩士班研究生完成計劃