向GenBank提交序列

序列的提交=genbankGenBank序列提交要求•向GenBank提交的序列应该是由提交者确定和注释的新序列。•来源于或用于构建非GenBank的第三方数据库的数据也可能用Bankit提交。•以下几种情形不允许提交到数据库序列长度小于200bp，除非它是完整的外显子、非编码RNA（ncRNA）、微卫星或古DNA。人工拼接的不连续的序列：例如拼接了多个外显子而没有内含子序列，或者内含子区域有误。仅有引物序列仅有蛋白质序列单条序列标注多种分子类型，例如即标注为基因组序列，又标注为mRNA序列表达序列标签（EST），ESTs应当通过dbEST系统进行提交。基因组勘测序列（GSS），GSSs应当通过dbGSS系统提交。序列标签位点（STS），STSs应当通过dbSTSA系统提交。GenBank序列提交需要的条件•通过登录系统注册MyNCBI•序列可以通过复制粘贴或文本形式上传（多条序列必须是FASTA格式）•提交序列公布的期限（是立即公布还是指定特定日期）•序列提交者、文章作者、题名等相应的参考文献等基本信息。•序列来源物种名称等描述信息•序列特征（例如CDS，gene，rRNA，tRNA，内含子，产物名称等）依次填入：名、姓、部门、机构、街道地址、城市、省份、邮编、国家、电话、传真、电子邮箱信息。点击继续continue参考文献信息：填写序列提交者姓名、文章题名、发表状态等在该页面中，可以指定序列信息公布时间、说明序列是否为16SrRNA，序列分子类型、拓扑结构、基因组信息完整性。分子类型分为基因组DNA，由cDNA到mRNA，基因组RNA，RNA前体，转运RNA，非编码RNA，小胞浆RNA，cRNA，其他RNA和其他DNA。拓扑结构为线性或环形。点击Continue后会跳出一个确认窗口，如果信息准确无误，则可以点继续，如果部分信息有误，则会指出错误位置。选择提交数据类型：Original是由提交者直接提交，ThirdPartyAnnotation是从其它数据库中第三方进行注释的序列。测序技术的选择传统的桑格的双脱氧测序方法，一般单条短序列测定都采用此方法。罗氏公司的高通量测序平台ABI公司的高通量测序平台线粒体线粒体：动质体质体：叶绿体、apicoplast（原生动物质体样细胞器）、有色体、蓝色小体、白体、原生质体、核形体。前病毒染色体外的大核。检查输入信息无误后，点继续。