OLEX做拓扑图并分析穿插结构-- 演示文稿

昨天有人在群里问如何看一个结构几重穿插,我当时不太清楚如何用OLEX软件画出穿插的拓扑图,就告诉他用DIAMOND如何如何做.今天打开这个软件,捉摸了一下,好像做法和DIAMOND软件一样,现将操作过程演示一遍,也许很多地方大家会不甚明白,希望到时可以一起讨论!------倏忽2007-09-1011:24打开OLEX软件-----导入数据点Fragments按钮出现如上图----将下边两个复选框去勾(因为不是溶剂分子不参与骨架构筑再点Fragments按钮下拉框,选generate钮,出现如上图勾上’linkchange’—Afrom最后边一个数可以选大点(如3or4)也可以选上’removehydrogens’----OK内容没有完全显示出来,可以点showviewwindow----点fittoscreen(右图上边最靠后的一个钮)出现如上图再点’showstructurenavigator(像一本摊开的书的形状的那个按钮)—再看框里头atoms:之后的数字,如果数字相近且都很大的,就都选上,数字小的不要选,选上几个就说明有几重穿插)再点network------constructnet出现如上图再隐藏非NET键,步骤:点上边BOND—networkbonds-将列出的键全选上如右图再右点窗口图任意处,反选-invertionselection---再把这些选上的键删除拓扑图都出来了,那几重穿插呢?????从结构里先选一个键—再点fragments---properties---出现上图;再monochromatic处选一种自己喜欢的颜色除了原来的红色还有粉红色的了-----再从没有选过的键中再选一个键,如上方法,给其选另一种颜色从上图中可以看出有三种颜色,就知道是三重穿插了做完了