微生物鉴定行业现状及市场进展

微生物鉴定的研究进展一、细菌自动鉴定及药敏系统的发展史细菌的鉴定是细菌分类的实验过程，长期以来，临床微生物实验室一直沿用100多年前由Gram、Pasteur、Koch、Petri等创造的传统的微生物学鉴定方法。这些传统的鉴定方法不仅过程烦琐，费时费力，且在方法学和结果的判定、解释等方面易发生主观片面而引起的错误，难以进行质量控制。20世纪60年代以后，微生物学家和工程技术人员密切合作，对微生物的研究采用了物理的、化学的分析方法，发明了许多自动化仪器，并根据细菌不同的生物学性状和代谢产物的差异，逐步发展了微量快速培养基和微量生化反应系统，使原来缓慢、烦琐的手工操作变得快速、简单，并实现了自动化和机械化。微生物鉴定自动化方法，包括(1)临床微生物鉴定系统；(2)气液色谙分析；鉴定厌氧菌和分枝杆菌多用于研究；(3)核酸杂交；多用于研究；(4)化学发光技术；可鉴定一些细菌少数分枝杆菌属和一些真菌。80到90年代发展迅速，并广泛用于临床。1985年第一台自动化细菌分析仪器Vitek-AMS进入中国并成功使用。1999年底法国梅里埃公司推出VITEK2系统，从接种物稀释、密度计比较及卡冲填和封卡等步骤均实现了全自动化。目前已有多种微生物自动鉴定及药敏测试系统问世，如VITEK-AutoMicrobicSystem(AMS)、PHOENIXTM、MicroScan、Sensititre、ABBott(MS-2System)、AUTOBACIDXSys-tern等。这地自动化系统具有先进的微机系统，广泛的鉴定功能，适用于临床微生物实验室、卫生防疫和商检系统，主要功能包括细菌鉴定、细菌药物敏感性试验及最低抑菌浓度(MIC)的测定等。其准确性和可靠性均已大大提高。二、细菌自动鉴定及药敏系统原理及性能比较1.原理：临床微生物鉴定系统使细菌鉴定过程规范化和程序化，将细菌对底物的生化类型与已建立数据库类型相比较。测试原理主要是利用物质产生PH值变化，能释放色源或荧光源复合物的酶学反应，四氮唑标记碳水化合物代谢活性的产生，挥发或非挥发酸产生，或可见生长。鉴定系统反应原理系统反应需要生长分析阳性结果显示系统例子PH基础反应（多为15-24小时）是碳源利用PH指示剂颜色变化；利用碳源源产生酸，利用氮源产碱APICrystalVITEKMicroScan酶谱（多为2-4小时）否微生物已有的酶当无色复合物被适当酶水解时，色源/荧光源释放引起颜MicroScanIDS色变化（Remel）碳源利用是有机产物因转移电子至无色四唑氮标记碳源使染料变为紫色Biolog挥发的或非挥发的酸检测是细胞脂肪酸以检测代谢产物为基础的层析技术，与数据库中的资料相比较MIDL生长可见检测是不同底物微生物利用某一底物产生浊度酵母校菌2．采有上述原理的各种鉴定系统可鉴定肠杆菌科，菌。目前较完善的鉴定系统性能比较。非发酵菌，革兰阳性球菌，革兰阴性球菌，厌氧菌和酵母自动鉴定系统性能比较性能VitekAutoSCAN-4Walk/AwaySenititre无限60polor系统容量32/60/120无限40/9692无限数据库中可鉴定菌种数566480需氧革兰阴性杆菌（GN）11611213914724624078需氧革兰阳性杆菌504949否否815否厌氧菌否5854否否50否苛氧菌否2120否194否酵母菌364042否GN中孵育否28否分枝杆菌否否否否手工自动否接种自动手工手工自动分开联机自动孵育联机分开联机联机4或16h30min分开需氧革兰阴性杆2-1824或2或5或4301菌h48h15-42h18h或16hmin8-24h需氧革兰阳性球菌2-15h24或48h2或15-42h30min厌氧菌否4h4h30min酵母菌24或48h4h30min分枝杆菌否否否否手工加试剂否是否室温4室温是贮存温度（℃）4室温，4室温，4室温其它性能是否否药敏试验是是是否否否是尿筛检/鉴定是否否是是是是DMS是是是是计算机界面是是是BiologyMISAutoSce三、常见细菌自动鉴定及药敏系统工作原理（一）半自动微生物鉴定和药敏系统1．VITEK-ATBATB鉴定系统是将肉眼观察的结果输入电脑，计算机数据库由许多细菌条目(taxa)组成，将输入结果与数据库内细菌条目比较，自动地得到鉴定结果。ATB敏感性试验采用半固体琼脂培养丛，不同的药敏试条含有不同种类的抗生素，每种抗生素都设有两个关键性的浓度，在24小时内通过观察有(+)无(一)细菌生长以判断药敏试验结果。结果可直接判读为：敏感，中介或耐药。由读数仪和电脑两部分组成。系统是由API金标准改良而成，拥有庞大的细菌资料库以及严格的质控，可鉴定多达550种细菌。另外，ATB系统操作方便，只需将培养结果输入电脑，就可得到结果。2．MicroScanPanel使用测试板及快速接种系统，人工判读，将编码结果输入电脑，由电脑软件得出反应结果。操作简便，价格便宜。3．SensititreManualSystem(手动装置)原理和操作方法同以上两种半自动方法。（二）自动微生物鉴定和药敏系统1．AutoScan-4自动微生物鉴定／药敏分析仪试剂板在培养箱孵育，然后放主机，用比色法及比浊法对鉴定及药敏(MIC)进行测定，96条不同波长光导纤维，对96孔板同时测定。仪器由主机，电脑和打印机组成。将菌液加入试剂板，放培养箱孵育(35～C左右)18～24小时。将试剂板放入主机，仪器自动判读结果。可同时做鉴定和药敏，自动判读结果，操作简便。2．AutoReader自动微生物鉴定／药敏分析仪用荧光检测技术，在测定板底物中加入入酶介物，使其与细菌生长中的酶结合生成荧光物质。荧光物质通过荧光读数仪得出的生物编码（BIOCODE）来判定菌种。（三）Vitek-AMS（AutomatedMicrobicSystem）全自动细菌鉴定和药敏分析系统工作原理1．概况：Vitek-AMS（AutomatedMicrobicSystem）全自动细菌鉴定和药敏分析系统，1960年由美国航天系统的麦克唐纳，道格拉斯公司为了鉴定宇宙环境中的微生物而研制的。1973年正式应用于临床微生物检验。1989年该系统由麦克唐纳，道格拉斯公司转让给法国生物梅里埃集团。全世界有4246家实验室应用，国内用户110台。(1996年资料)自1985年第一台自动化细菌分析仪器Vitek-AMS进入中国并成功使用。价格7．8万美元。2．结构组成VITEKCC4自动鉴定系统由菌液接种、封闭装置(此装置分上下两部分，下部分为真空室，上部是一热切割器)．读数器、孵箱和电脑、打印机三部分组成。(1)充液/封口部件这一部件分为上、下两部分。上部为封口器并有切割作用，下部为真空充液接种装置。将制备好菌悬液的试管和试卡用一弯形塑料管相连并置充液接种仓中，当接Fill钮时，即开始抽真空，真空形成后进气阀开放，仓内形成负压，菌液从试管通过弯形塑料管进入试卡内即完成接种，上部封口为一热切割器，温度可升至200℃以上，完成按种的试卡可置热切割器中，密闭并切割平整。(2)孵箱／读数器孵箱内有一直立圆形转盘，每隔900置一卡片架，每个孵箱共可放4个卡片架，每一个卡片架分别用A、B、C、D标记，每—卡片架可放32张测试卡。孵箱直接由计算机控制，读数器是665nm波长的光扫描器，每15min自动扫描一次，并将光信号转换为电信号传送至计算机。(3)计算机、终端和键盘计算机就像整个系统的神经中枢，始终保持与孵箱／读数器、打印机和终端的联络，控制孵箱温度，自动定时读数，收集记录，储存和分析资料。当卡片反应完成时，计算机可指示打印机自动打印报告。使用者可随时从终端查询试卡检测结果，配有IMS装置的计算机还具有数据统计功能，该系统计算机还可同时带动两个孵箱／读数器并可与自动免疫诊断系统——VIDAS联用。终端是由21cm彩色显像管组成。终端可提供人机对话并与各部件联络，当系统出现故障会自动报警。键盘为102标准键擞，通过键盘可建立适合各类实验室的框架。输入指令或菜单，控制系统的运动状态，输入各检测样本的流行病学资料。(4)打印机打印机始终与计算机保持联络，接受计算机发出的命令，自动打印每一试卡的最终报告，包括实验室保留的shortreport和发给临床医生的patientreport，并自动打印系统出现的故障资料。3．原理(1)鉴定原理：常规革兰刚(阴)性板对各项生化反应结果(阴性或阳性)的判定是根据比色法的原理，将菌种接种到鉴定板后进行培养，由于细菌各自的酶系统不同，新陈代谢的产物也有所不同，而这些产物又具有不同的生化特性，因此各生化反应的颜色变化各不相同。仪器自动每隔1小时测定每—生化反应孔的透光度，当生长对照孔的透光度达到终点阈值时，指示已完成反应。由光电技术、电脑技术和细菌八进位制数码鉴定相结合。每个鉴定卡内含有30项生化反应，每3项为一组，各确立阳性反应值为1、2、4：如3项反应全部阳性，其组值为7；如第1、2项反应阳性，其组值为3；第1、3项反应阳性，其组值为5。30项生化反应可获得10位数的生物数码，在鉴定时有时还需外加补充试验，共可获得11位生物数码，系统将其最后一次判读的结果所得生物数码与菌种资料库标准菌生物模型相比较，得到鉴定值和鉴定结果，并自动打印出实验报告和发给病人的病房报告。(2)药敏实验原理药敏测试板(卡)的药物敏感性试验实质是微型化的肉汤稀释试验。应用光电比浊原理，根据不同的药物对不同的菌最低抑菌浓度不同，每一种药物一般选用3种不同药物浓度，每一药敏试卡可同时作10种药物的MIC(minimalinhibitoryconcentration)测定，经6小时孵育后，每隔一定时间自动测定小孔中细菌生长状况，即可得到待测菌在各浓度的生长率。待检菌斜率与阳性对照孔斜率之比值，经回归分析得到MIC值，并根据NCCLLS(美国国家临床实验室标准化委员会)标准获得相应的S、I和R结果。药敏报告含MIC值，敏感度，药物一次剂量和在该剂量下的血清和尿液内最高药物浓度。4．主要操作步骤(1)光电比浊仪革兰氏阳性菌配制相当0.5麦氏管菌悬液，革兰氏阴性菌配制相当1麦氏管菌悬液、酵母菌配制相当2麦氏管菌悬液，厌氧菌配制相当大于2麦氏管菌悬液。(2)菌液接种和封闭(3)卡片装入读数器／孵箱。(4)输入病人人口统汁学资料。(5)自动打印实验室和病人报告。5．系统功能和特点(1)鉴定功能系统具有对不同菌类的鉴定能力，含有鉴定试卡十种，包括A．GNI卡(革兰氏阴性杆菌)：可鉴定肠道菌和非发酵菌117种。B．GPI卡(革兰氏阳性球菌)：可鉴定葡萄球菌、链球菌及其他细菌49种。C．YBC卡(酵母菌)：可鉴定酵母样真菌36种。D．BAC卡(需养芽孢杆菌)：可鉴定芽孢杆菌12种。E．ANI卡(厌氧菌)：可鉴定87种。F．NIH卡(奈瑟氏菌、嗜血杆菌)：可鉴定奈瑟氏菌、嗜血杆菌和其它苛氧菌30种。G．NFC卡(非发酵型革兰氏阴性细菌)：可鉴定非发酵型革兰氏阴性细菌。H．GNI+卡：快速革兰氏阴性菌鉴定卡。筛选卡L．UID-3卡：尿道感染专用鉴定和药敏卡M．ESP-3卡：肠道病原菌可鉴定不同种类的细菌近500种。系统设计，直接同样本鉴定，使结果提前二十四小时，并报告菌落计数，鉴定功能和参考方法比可获得百分之九十五以上的相关率。(2)药敏试验革主氏阴性杆菌药敏试二十种，革兰氏阳试卡三种，尿道分离菌药敏试卡，超广谱(—内酰胺酶试卡，最近又开发出四十五孔试卡。涉及为九十七种抗生素，并含有测定超广谱(—内酰胺酶(ESBL)功能的试卡(GNS—NT)。在革兰氏阳性菌药敏试卡中含有(—内酰胺酶试验。(3)专家系统软件所谓专家系统是用计算机软件来代替有丰富经验的专家审核，该系统产生报告中的技术错误和异常的药物表型，TITEK专家系统有144条规则，规则分为三级水平，一级水平是极不可能出现的表型，二级是罕见表型，三级是利用一种药物表型推理另外一些药物的耐药性。专家系统规则，每天审核异常药敏规则，使检验医生可对报告进行修订或重复处理。(4)数据处理软件可根据用户需要，打印出二