NGS高通量测序公司实验组(内部培训教材)课程1

NGS实验部培训1锐翌生物科技陈璟2020/2/29未来的设想-便携式测序+快速分析（百度筷）硬件的发展1911-1946电子管1890前机械1947-1958晶体管1959-1970集成电路1971-1979微处理器1980-至今现代PCITandBTITandBT19811985至今一个例子测序技术的发展1975-SouthernDNA杂交技术1977-Sanger双脱氧链终止法测序技术Maxam、Gilbert’s化学法DNA测序技术1980-自动化原位寡核苷酸合成仪1985-Cetus公司的Mullis发明PCR技术1992-Affymetrix公司（Fodor的集团）的基因芯片1995-ABI公司第一代全自动测序仪2006-第二代DNA测序仪上市2007-单分子测序技术（Singlemoleculesequencingtechniques）ABI-377一代测序仪二代测序仪三代测序仪OtherTechnology.CellsgentlylysedtoextractlonggenomicDNAmolecules(150kb)–piecesofmicrobialchromosomesDNAcapturedinparallelarraysofsingleDNAmoleculesusingmicrofluidicdeviceDigestionrevealsrestrictioncleavagesitesas“gaps”,underfluorescentmicroscopy,afterstainingwithintercalatingdye目前的技术主流目前主流测序平台-二代illuminaPE101+8+101Illumina技术的主要错误-测序原理Illumina技术的主要错误-建库过程No.ofNo.AmpliconCyclesCopiesofTarget122438416532664201,048,576301,073,741,8241cycle=2Amplicon2cycle=4Amplicon3cycle=8Amplicon4cycle=16Amplicon5cycle=32Amplicon6cycle=64Amplicon7cycle=128AmpliconIllumina技术的主要错误-机器误差Illumina技术数据的格式Illumina技术数据的质量控制1.读长2.插入片段数据产品的主要属性信息分析与技术应用孤儿基因簇-药物筛选RNA结构-基因功能GWAS分析-基因功能预测及动植物育种微生物群落分析-医学应用ctDNA检测-无创产前Thanks