Gephi快速入门指南

Gephi快速入门指南fxleyu软件介绍数据导入基本操作效果预览保存总结软件介绍Gephi软件介绍Gephi是一款开源免费跨平台基于JVM的复杂网络分析软件,其主要用于各种网络和复杂系统，动态和分层图的交互可视化与探测开源工具。可用作：探索性数据分析，链接分析，社交网络分析，生物网络分析等。Gephi是一种开源软件，允许开发者去扩展和重复使用。Gephi是在Netbeans平台上开发，语言是JAVA，并且使用OpenGL作为它的可视化引擎。依赖于它的APIs，开发者可以编写自己感兴趣的插件，创建新的功能。数据导入文件导入文件-打开...，进入如下操作界面，其中显示了支持的文件格式文件导入输入一文件后，产生一个输入报告，如下图：数据库导入文件-数据输入-边名单，到如下操作界面：再点击确定，产生一个输入报告，和上述的输入报告一样。在此不再用图展示。输入完成后……单击输入报告中的确定后，产生如下的初始图像：输入完成后……完成输入后，在它是数据资料模块就会以表格形式展现输入数据，如下图所示：基本操作基本操作之前……可视化操作布局选择左图中一个算法后，产生如右图的操作界面，可以修改默认算法参数，也可使用默认的参数。单击图中运行按钮，布局算法生效。布局布局算法运行后，产生如下的布局效果：统计图的特征可在统计功能模块中计算得到，其模块如左图。单击左图中标记区域，可计算相应的图的特征数值，如要查看详细内容，可单击右图中相应标记区域，可产生类似于下图的报告。下图报告是图度的报告。排序排序模块如下图，基本功能在图中标示。举例如右所示以介数中心度为参数，对节点颜色排序，操作完成界面如下所示：以度为参数，完成对节点大小的排序，操作界面如下图所示：排序前的效果对节点进行颜色排序后效果图对节点进行大小排序后效果图排序操作基本类似，将不对其他产生进行排序的演示。对边的排序也是一样，也不进行演示了。分割分割的操作模块如下图，在进行选择前，要先进行刷新，就是下图所示的1操作。在选择分割参数。在我们将要进行的实例中，我们选择了模块类为分割参数，如下图所示：选择后，如下图所示。其中，还可进行分组显示，如下图标示：进行分割前效果图进行模块类别分割后效果图选中分组后的效果图过滤过滤模块的操作界面如左图。在此，我们以边的权重为过滤对象，具体操作如下：1，点击边-边的权重，选中边的权重2，选择要过滤保留的权重范围，本例以3.56–9为权重范围，非此范围的权重边将被过滤掉。点击滤波，可完成滤波。点击选择，可提前看到过滤后的效果。展示在图的可视化界面展示。边权重过滤前的效果图边权重过滤后的效果图所有的过滤操作类似，在此将不一一演示。效果预览预览按序进行下列操作，可以得到预览图像预览图预览图如下：保存预览图保存预览图保存项目保存文件-保存总结总结在这个指南中，我们了解了使用Gephi的基本流程。流程具体内容为分为：打开，可视化，一些具体操作，网络渲染等几步。参考百度百科：入门指导：软件下载：简要教程Gephi是一款开源免费跨平台基于JVM的复杂网络分析软件,其主要用于各种网络和复杂系统。Gephi软件可以从官方网站免费获得。gephi软件使用前需要安装JavaRuntimeEnvironment（简称JRE，可以从天空软件园下载获得）。用Gephi处理网络的主要步骤：1.收集现有网络，得到用边两边节点表示的CSV文件。如果得到excel文件，可以用另存为获得csv文件。得到例如：1,2原文链接：运行gephi软件。如图。选择File-Open。将FileType改为CSV，选择对应的csv文件，点击Open打开。3.出现如图的导入对话框。可以修改Directed/Undirected等。确认无误点击Ok。4.导入后出现如图界面。中间是图的一个可视化表示。5.右手边的Statistics栏目中可以计算度分部、模块度、社团划分、PageRank等。6.如果需要分析随机图，在第二步时点击File-Generate-RandomNetwork。即可生成ER随机图。7.以此图为例，先到Statistics栏计算AverageDegree和Modular。点击run后获得结果。8.回到左手边的Partition窗口。点击Nodes下面的刷新按钮，再从下拉菜单选择Modularityclass。后选择Apply。即可根据社团结构染色。9.在左手边的Ranking窗口，选择第一栏第四个图标，下面标准选择Degree。点击Apply即可按照度大小改变节点大小可视化。10.左下角的Layout可以调整可视化图的布局。Choosealayout的下拉栏选择ForceAtlas，在下面的Adjustbysize右边勾选.点击Run即可开始。得到合适的布局时点击Stop。11.完成后选择file-export-PNGfile即可输出图形文件。更多资源尽在校苑数模论坛