大数据应用之中医药数据中心子项目

大数据应用之中医药数据中心子项目子项目汇报内容提纲（一）项目基本情况简介（二）2006年度实施进展及成效（三）典型服务案例（四）主要经验与问题（五）下一步工作计划（一）项目基本情况简介医药卫生科学数据共享网(物理上合理分布,逻辑上高度统一)医药卫生科学标准规范建设共享政策、机制、管理和运行(办公室)医药卫生科学数据资源建设医药卫生共享技术平台建设基础医学数据中心临床医学数据中心中医药学数据中心公共卫生数据中心药学主体数据库共享服务节点共享服务节点服务目标政府卫生决策医学科技创新卫生技术进步公众健康服务健康产业优化1.中医药学科学数据中心--医药卫生科学数据共享网的组成部分医药卫生科学数据共享网中医药信息网格支撑平台中医药科学数据共建共享运行机制及管理模式中医药科学数据服务体系中医药科学数据共享平台中医药科学数据主体数据库群中医药科学数据规范标准平台中医药科学数据共建平台中医药科学数据汇交平台中医药科学数据中心的基本构架项目背景与意义1.2001年的调查显示，中医药领域相关数据库100多种，但数据共享不足20%；2.数据库建设缺乏统筹规划；数据库多类型、多结构、重复建设严重；3.数据库缺乏统一的建库标准和通用的建库语言；标准术语5000条，不足1/40；4.绝大多数是课题在实施中所建立的数据库，没有维护和持续发展，形成信息孤岛；5.缺乏专业化的科学数据建设的队伍和技术平台。项目总体建设思路协同建设，与基础、临床、公卫合理分工，避免行业内重复研究相关政策，建立管理体制，完善运行机制，提供共享服务集中全国力量，凝聚一支队伍，更新一批设备，建设一批分中心完成顶层设计，明确建设目标，统一建库规范，共同建立数据体系（二）2006年度实施进展及成效主要任务•在医药卫生科学数据共享网基础上，形成国内外中医药与传统医学领域中最大规模、性能优良的科学数据共享平台。1．中医药科学数据中心技术平台进一步得到完善主要工作流程建议整合数据确立整合数据平台组调研专家组审核立项数据服务平台数据查询信息动态在线分析系统集成中医药科学数据中心主题主题主题主题主题主题分中心分中心分中心…科研监控加工审校数据管理软件维护系统管理设备管理安全管理标准建立质量控制人员培训机制建立组织管理数据部技术部确定整合项目进行项目主题分解确立实施方案组织参与单位签订任务合同发布专题技术方案进行专题技术培训设计网上共建平台平台与方案测试数据加工整合数据三级审核数据发布平台研制数据发布中医药科学数据中心工作模式基于网格技术的中医药数据系统构架已经形成OGSIWebService数据/知识SemanticWeb虚拟医院虚拟研究院虚拟中医药企业基础架构层信息网格核心层中医药应用层2003-8-19TCM-InfoGridBuildOut虚拟组织层KB-GridDB-Grid资源服务层协同服务层系统工具层SharedUpper-LevelOntologies:ObjectsandProcesses模型检测本体论知识服务规则知识服务推理服务案例知识服务相似度比较OntologiesRulesCases应用工具层临床研究和诊疗决策新药开发电子病历系统中医药数据库网格知识库元信息目录虚拟知识库语义浏览器知识服务器语义搜索引擎VDHA中医药KDD与KDT功能服务层语义浏览服务语义查询服务语义搜索服务数据库元信息目录虚拟数据库智能数据仓库NegotiationTransportTransactionAuthorizationManagementTable/DataSchemastatement虚拟数据库建模工具虚拟数据库查询分配器语义索引服务知识共享服务知识管理服务基于本体论的联合查询服务基于本体论的联合建模服务中医药专家系统HPCClusterOSHPCClusterFileSystem•2006.12-2007.4原始数据采集•2007.4-2007.6加工程序研制与测试•2007.7-2007.12完成数据总任务量30万条。数据总量50G•2007.7-2007.1225个数据库发布•2006.12-2007.4完成•2007.4-2007.6完成•2007.7-2008.1完成30多万条数据；数据量57G2007.7-2008.225个数据库已经发布中医药科学数据的整合与增量完成了既定任务2006年度计划2006年度完成情况1．中医药科学数据中心数据整合与增量1中医防治呼吸系统疾病数据库2中医防治哮喘病数据库3中医中风病防治数据库4中医防治病毒性肝炎数据库5中医防治艾滋病数据库6中医糖尿病防治数据库7中医防治肾病数据库8中医防治老年性痴呆数据库9中医防治高血压病数据库10中医防治冠心病数据库11中医防治消化系统疾病数据库12中医防治心血管系统疾病数据库13中医防治泌尿系统疾病数据库14中医防治儿科病症数据库15中医防治神经系统疾病数据库16中医防治免疫系统疾病数据库17中医防治肿瘤数据库18中医疾病诊疗数据库19中医诊法与疗法数据库20针灸方法数据库21中医古籍养生数据库22腧穴数据库23针灸古籍资源数据库24针灸医疗器械数据库25古代医家数据库1．中医药科学数据中心数据整合与增量共享网肿瘤主体数据库的中医部分数据库发布平台基础医学临床医学公共卫生中医药学地方节点药学目前已建成包含有用户服务、工作区、论坛区等功能技术平台，并能够提供基于元数据的目录服务和基于SOA的数据应用服务；中医药科学数据的整合与增量成为医学共享网的重要组成部分2．中医药科学数据平台的开放服务与共享（1）采取了多种、多层次共享服务的形式简单检索服务基于结构型库的数据利用服务基于专题的数据平台服务基于语言系统的自然语言检索与关联检索服务（2）主要服务对象与需求需求政策制定临床决策新药开发继承与创新服务人群医教研管理生产经营百姓（3）服务数量及服务成效2007年度服务数量及服务成效网络服务—7X24小时的免费检索服务–网络注册单用户362家单位与个人；比2006年新增24家–网络IP注册:25段,比2006年新增8段,开放IP地址约1万个离线服务：–光盘：数据库的数据总量6G；用户133户；新增30个;涉及数据库30余个。课题服务–为国家支撑计划提供数据49664条。–为973课题中医临床疗效评价提供数据查询与服务;提供总数据量3GIP统计用户名统计用户访问日志3．建立与落实标准与规范（１）应用共享网的标准科技部通用标准学习宣贯应用培训领域专用标准的研究与制订指导标准通用标准物理中心建设共享资源建设技术平台建设数据类服务类建设类数据发现类数据访问类数据表示类数据操作类元数据类数据元类数据模式类分类与编码类网络建设类设备建设类机房建设类安全建设类1.领域专用数据类标准的研究与制订；2.领域国内外术语、代码、卫生信息模型标准资料汇编；3.领域主题数据集概念模型研究与设计；4.标准实施工具软件的设计与开发；5.标准的培训、审核与动态维护。（２）网上发布的标准（３）标准加工平台4．人才队伍的培养•35个分中心:参与本工作人员300个,实名工作人员178名;硕士研究生以上学历占三分之一;•2007年度培养:硕士生13人,博士生2人;博士后入站3人;5．项目组织管理中医药科学数据中心的五个课题分解为35个子课题；每个课题均签订任务书；由课题组、子项目单位、项目单位签字盖章；1.任务管理:•月汇报制度：向共享网提交当月信息与活动情况•月考核制度:子课题与专题项目进度月总结•中期检查制度:项目中期进行总结；进度、质量；•年终总结与表彰：年终总结，表彰先进2.人员管理：•培训：网络培训、集中培训；建立工作考核管理制度工作平台月检查标准与规范6.中医药科学数据共享公认度极大提高“中医药科学数据系统”成为被“推荐品牌•2007年7月19日在北京国际会议中心召开第二届中国数字出版博览会上，中国中医药科学数据系统与中国知网、万方数据资源系统等九家单位一起被第二届中国数字出版博览会评为“推荐品牌”与“万方”“同方”齐名，获得“推荐品牌”奖。•“中医药科学数据系统”成为被“推荐品牌”与“万方”“同方”齐名•到2007年共获中华医学会、北京市科委、中国中医科学院科技进步奖共七项。国外影响1）中医药科学数据共享平台应用的网络技术在2005年的GlobusWorld国际会议上,得到了网络之父IanFoster认可,并引起了来自美国、德国、英国、意大利、俄罗斯、日本等国家的关注。（2）美国加州大学伯克利分校公共卫生学院学者MichaelMcCulloch等在权威主流医学期刊——《美国公共卫生杂志》发表了有关中草药与干扰素治疗乙型肝炎随机对照试验的Meta分析。McCulloch及其同事认为，中国中医药数据库在其研究中起到了非常重要的作用。就此，他们专门致信表示感谢。（3）2005年3月由世界卫生组织西太区资助在中国北京召开了传统医学信息标准化研讨会，成立了三个小组从三个方面入手研制传统医学信息标准化。（4）2008年得到美国科学基金委与我国国家自然基金委的资助，组织召开了“中美传染性疾病信息学和生物检测研讨会”有包括美国CDC、哈佛大学、霍普金斯大学、麻省理工等15名美国专家参加交流，对中医药科学数据研究表示了极大兴趣。（三）、典型服务案例中医药信息学中医药科学数据紧密相关互相促进1.数据标准术语2.科研项目数据服务3.数据分析4.知识发现促进中医药现代化发展中医药科学数据已经成为中医药现代化的重要支撑在国家重点基础研究发展计划、国家高技术研究发展计划、科技部“十一五”支撑计划、国家中医药管理局重点课题、北京市中医药管理局北京市中医药科技创新工程51510工程等课题中发挥了作用基于临床文献数据独立评价中医临床效应的方法研究－－科技部“十一五”支撑计划（2006BAI08B02-03）中医各家学说及其理论创新研究－－973计划课题2005CB523504中国中医药科学数据网格服务应用－－863项目2006AA01A122中医疾病分类代码等基础标准示范研究－－科技部“十一五”支撑计划（2006BAI21B03）公共卫生突发事件中医药信息资源共享平台研究－－北京市中医药科技创新工程51510工程jj-2006-9“有毒中药”质量控制及有毒成份限量示范研究－－国家中医药管理局2004zx051.科研项目数据服务门诊系统1.门诊病历空白模版2.门诊病历专科模版3.名老中医个体化模版个体诊疗临床数据采集系统研究临床标准术语成为个体诊疗临床数据采集系统的重要基础临床信息采集系统使用培训临床信息采集系统采集病例及诊次为中风等疾病研究提供数据统计与分析数据分析知识发现研究同一疾病，不同证候的用药组分药理作用规律：123402040608010024pharmacologicalactionThepercentofpharmacologicalactionPrescriptionPrescription:1--Prescription12--Prescription23--Prescription34--Prescription4Pharmacologicalaction:1--Myocardialprotectiondrug2--Antiviraldrug3--Antimyocardialischemiadrug4--Antiarrhythmicdrug5--Immunoregulatorydrug“中风”的数据统计与在线分析（四）主要经验与问题体会必需有政府部门的主导必需作好顶层设计语言系统是共享实现的基础虚拟研究院是值得推广的组织形式必需是全行业协同工作必需有标准规范支撑主要问题数据质量问题虚拟研究院积极性调动问题数据积累的可持续发展问题应用宣传（五）下一步工作计划1．今年工作目标（1）整合17个中、大型数据库；总数据量为15-20万条，约达到40G。（2）完善中医药科学数据中心数据共建与共享服务平台功能，实现为国内外用户提供不同级别的7*24小时不间断共享服务。（3）深入研究科研项目与成果数据汇交方法；建立6-7家试点单位。（4