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ARMS-PCR法目录•ARMS技术•ARMS法与测序法比较•实时荧光定量PCR原理ARMS技术•目前,突变扩增阻滞系统(amplificationrefractorymutationsystem,ARMS)已成为国际上肿瘤个体化分子检测最重要、最先进的技术之一,其在临床应用中的优势已被业内专家广泛认可。ARMS技术•等位基因特异性扩增法(Allele-specificamplification,ASA)ASA于1989年建立,是PCR技术应用的发展,也称扩增阻碍突变系统(amplificationrefractorymutationsystem,ARMS)、等位基因特性PCR(allele-specificPCR,ASPCR)等,用于对已知突变基因进行检测。•该法通过设计两个5’端引物,一个与正常DNA互补,一个与突变DNA互补,对于纯合性突变,分别加入这两种引物及3’端引物进行两个平行PCR,需有与突变DNA完互补的引物才可延伸并得到PCR扩增产物。如果错配位于引物的3’端则导致PCR不能延伸,则称为ARMS。•ARMS和ASPCR借鉴多重PCR原理,可在同一系统中同时检测两种或多种等位基因突变位点。ARMS技术优点•ARMS方法检测灵敏度明显高于直接测序法等其他方法(表1),可检测出样品中含量低至0.1~1.0%的突变基因;该方法在设计上可以最大限度地缩短目标产物的长度,可以解决石蜡包埋组织标本提取的DNA大部分片段化而无法得到准确检测结果的难点;该方法结合实时PCR平台实现闭管操作,操作简单,无需产物的后处理,能最大程度地避免扩增产物的污染。ARMS法与测序法比较测序法ARMS法敏感度10~20%1%FFPE标本成功率低高商用试剂盒无有流程与速度复杂\慢简单\快数据分析要求高低试剂成本低略高仪器成本高低假阳性机会(交叉污染)多少实时荧光定量PCR•ARMS技术利用特异引物对突变靶序列进行高精准PCR扩增放大,与此同时,利用探针对扩增产物进行检测,在实时荧光定量PCR平台上实现对样品DNA中稀有突变的检测,以达到对基因突变检测的高特异性和高灵敏度。实时荧光定量PCR•该技术的基本原理是利用Taq酶的5’外切酶活性,当引物延伸至被荧光探针结合的模板处,Taq酶即从5’→3’方向降解并释放荧光探针5’端的核苷酸。•由于探针的两端均有一个荧光分子标记,其中3’端的荧光分子(荧光淬灭基团)能够吸收5’端荧光分子(荧光报告基团)的荧光信号,当探针完整时,报告基团发射的荧光信号正好被淬灭基团接收,因此就检测不到荧光信号;•当Taq酶将探针5’端带有荧光报告基团的核苷酸降解下来时,破坏了两荧光分子间的荧光共振能量转移(FRET),从而发出荧光,每扩增一条DNA链,就有一个荧光分子形成,荧光分子数与PCR数量成比例,从而实现了荧光信号的累积与PCR产物形成完全同步。因此,根据PCR反应液的荧光强度即可计算出初始模板的数量。TaqMan荧光探针常用报告基团有FAM、TET、VIC和HEX,淬灭基团有TAMRA。——TaqMan技术ARMS-PCR基本原理操作流程及数据解读DNAARMS-PCR数据分析谢谢!
本文标题:ARMS-PCR
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