基因DNA序列BLAST及系统发育树构建操作步骤

基因DNA序列BLAST及系统发育树构建操作步骤1、输入“”网址。得到：图12、单击nucleotideblast图13、得到新页面：图24、复制粘贴测序公司提供的DNA序列到blastn窗口5、勾选“结果显示在新窗口”，单击“blast”图26、得到新窗口：图3图37、下拉页面，如：图48、选择Accession下的基因编码。入选第一个“HQ711983.1”图49、得到新窗口如：图510、单击FASTA图511、得到如：图612、复制菌株种名跟16SrDNA序列，并粘贴到“.txt”文件中图613、新建“.txt”文件，如：图714、把测序菌株16SrDNA序列和选取blast所得的匹配度高的菌株16SrDNA序列粘贴在“.txt”文件下，在菌株种名前加“”，每个序列后空一行图715、复制“.txt”文件，改“.txt”文件为“.fasta”文件，如：图8图816、用MEGA4.0.2软件打开“.fasta”文件，如：图9图917、单击Alignment里的AlinmentExplorel/CLUSAC，如：图10图1018、单击Alignment里的AlignbyclustalW，如：图11图1119、在弹出窗口中单击OK，如：图12图1219、在弹出窗口中单击OK，如：图13图1320、等待数据运算，如：图14图1421、运算结束，关闭当前窗口。如：图1522、在弹出的第一个窗口单击NO图1523、在弹出的第一个窗口单击YES，如：图16图1624、将文件以“.meg”格式保存，如：图17图1725、关闭其余窗口，打开刚刚保存的“.meg”文件，如：图18图1826、选择phyloeny下的BootsteapTestofphylogeng下的Neighbor-Joining...,如：图19图1927、在弹出窗口单击Compulte，如：图20图2028、单击树状图，得到系统发育树，建议截图保存，如：图21图21