很好—生物信息相关数据库资源介绍

生物信息学数据库资源大全生物信息学相关数据库资源1.核酸及其相关数据库（序列数据库、基因组相关数据库、核酸三维结构数据库、其他）2.蛋白质相关数据库（序列数据库、蛋白质三维结构数据库、蛋白质组数据库（二维凝胶电泳数据库）、信号传导及蛋白质-蛋白质相互作用相关数据库、DNA和蛋白质相互作用数据库）3.基因或蛋白质一些特定数据库4.糖类及其相关数据库5.蛋白质翻译后修饰相关数据库6.基因表达数据库7.人类基因突变及疾病相关数据库8.进化相关数据库及资源专利数据库9.资源目录服务器或网页1.核酸及其相关数据库（序列数据库、基因组相关数据库、核酸三维结构数据库、其他）2.蛋白质相关数据库（序列数据库、蛋白质三维结构数据库、蛋白质组数据库（二维凝胶电泳数据库）、信号传导及蛋白质-蛋白质相互作用相关数据库、DNA和蛋白质相互作用数据库）3.基因或蛋白质一些特定数据库4.糖类及其相关数据库5.蛋白质翻译后修饰相关数据库6.基因表达数据库7.人类基因突变及疾病相关数据库8.进化相关数据库及资源专利数据库9.资源目录服务器或网页核酸及其相关数据库1）、核酸序列数据库BIOSINO我国的核酸序列公共数据库EMBL-EMBLNucleotidesequencedatabase(EBI)GenBank-GenBankNucleotideSequencedatabase(NCBI)DDBJ-DNADataBankofJapandbEST-DatabaseofExpressedSequenceTags（表达序列标签）(NCBI)dbSTS-DatabaseofSequenceTaggedSites（序列标签位点）(NCBI)2）.基因组及相关数据库GenomicDatabasesGenomeWeb(HGMP)-AcatalogueofusefulWebsitesforGenomicswithasetofcollectionsofgenomedatabasesGSDB-GenomeSequencedatabase(NCGR)GOLD-GenomesOn-linedb一些数据库的直接链接3）.核酸三维结构数据库NDB-NucleicAcidDatabank(3Dstructures)BNASDB-NucleicacidstructuredbfromUniversityofPune4）.其他AsDb-AberrantSplicingdb（异常拼接）ACUTS-AncientconserveduntranslatedDNAsequencesdbCodonUsageDb-ThefrequencyofcodonuseineachorganismismadesearchablethroughthisWorldWideWebsite.EPD-EukaryoticPromoterdb（真核启动子）HOVERGEN-HomologousVertebrateGenesdb（同源脊椎动物）IMGT-ImMunoGeneTicsdb[MirroratEBI]（免疫遗传学）ISIS-IntronSequenceandInformationSystemRDP-RibosomaldbProjectgRNAsdb-GuideRNAdbPLACE-Plantcis-actingregulatoryDNAelementsdb5）其它核酸数据库PlantCARE-Plantcis-actingregulatoryDNAelementsdbsRNAdb-SmallRNAdbssurRNA-SmallribosomalsubunitdblsurRNA-Largeribosomalsubunitdb5SrRNA-5SribosomalRNAdbtmRNAWebsitetmRDB-tmRNAdBtRNA-tRNAcompilation（编辑）fromtheUniversityofBayreuthuRNADB-uRNAdb5）其他核酸数据库RNAediting-RNAeditingsiteRNAmoddb-RNAmodificationdbTelDB-MultimediaTelomere（端粒）ResourceTRADAT-TRAnscriptionDatabasesandAnalysisToolsSubviralRNAdb-SmallcircularRNAsdb(viroidandviroid-like)（类病毒）5）Transgenics（转基因）CreTransgenicDatabase-CretransgenicmouselinesTransgenic/TargetedMutationDatabase-Informationontransgenicanimalsandtargetedmutations2.蛋白质序列和相关数据库蛋白质序列数据库PIR-international-TheProteinInformationResource(proteinsequence)（国际蛋白质信息中心，NBRF+JIPID+MIPs,PIR1\PIR2\PIR3\PIR4)）SWISS-PROT-SWISS-PROTannotated（注释）proteinsequencedb(SIB+EBI,EBI创建蛋白质专家分析系统ExPASy，北京)MIPS–(Munichinformationcenterforproteinsequence)（德国慕尼黑蛋白质序列信息中心）蛋白质相关数据库PROSITE-PROSITEdictionaryofproteinsitesandpatternsInterPro-IntegratedResourcesofProteinsDomainsandFunctionalSitesBLOCKS-BLOCKSdbDOMO-Proteindomaindb(Automaticallygenerated)Pfam-Proteinfamiliesdb(HMMderived)[MirroratSanger]PRINTS-ProteinMotiffingerprintdbProDom-Proteindomaindb(Automaticallygenerated)PROTOMAP-Anautomatichierarchical（分等级）classificationofSWISS-PROTproteinsSBASE-SBASEdomaindb(Proteindomainsequencelibrary)SMART-Proteinsignallingandextracellulardomainpatterns(SimpleModularArchitectureResearchTool)ProClass-Proteinsequencealignmentsandcurationofproteinfamilies蛋白质三维结构和相关数据库PDB-ProteinDataBank[MirrorsinEBI]BioMagResBank–Repository（知识）fordataonproteins,peptides,andnucleicacidsfromNMRspectroscopy（光谱学）SWISS-MODELRepository-AutomaticallygeneratedproteinmodelsdbModBase-DbofcomparativeproteinstructuremodelsCATH-UCLBSMstructuralclassificationofproteinsSCOP-Structuralclassificationofproteins[MirroratUSA|Israel|Singapore|Australia]Mol_R_Us-MoleculesRUs,browserforPDBBMMDomainServer-BiomolecularModellingLaboratory(ICRF)proteindomainserverPRESAGE-Collaborativeresourceforstructuralgenomics蛋白质三维结构和相关数据库SBASE-SBASEdomaindb(Proteindomainsequencelibrary)SMART-Proteinsignallingandextracellular（细胞外）domainpatterns(SimpleModularArchitectureResearchTool)ProClass-ProteinsequencealignmentsandcurationofproteinfamiliesKabat-KabatdbofproteinofimmunologicalinterestPMD-ProteinMutantdb蛋白质二维凝胶电泳数据库WORLD-2DPAGE-Acompleteindexof2D-PAGEdbandserversPhoretixlinks-Phoretixpageoflinksto2Dgeldb3、信号传导及蛋白质-蛋白质相互作用相关数据库DIP-DbofInteractingProteinsINTERACT-Protein-ProteininteractiondbProNet-Protein-ProteininteractiondbCANSITE-SignalTransduction‘s（信号传导）WebSPAD-SignalingpathwaydbCSNDB-CellSignalingNetworksdbDNA和蛋白质相互作用数据库DPInteract-DNA-Proteinsinteractionsdb特定基因或蛋白质的数据库AAA-AAAfamilyofATPasesserverAcetylcholinesterasesALDH-Aldehydedehydrogenase（醛脱氢酶，醛氧化酶）genesuperfamilydbAminoacyl-tRNAsynthetasesinSWISS-PROT-Listofaminoacyl-tRNAsynthetasesinSWISS-PROTAARSDB-Aminoacyl-tRNAsynthetasesdbAllergensinSWISS-PROT-Nomenclatureandindex（命名和索引）ofallergens（过敏原）inSWISS-PROT特定基因或蛋白质的数据库AMSDb-Antimicrobialsequencesdb（抗菌）Antibodyresourcepage-LinkstoantibodyrelatedWebresources（抗体）Australianvenomandtoxindb（澳大利亚蛇毒）Bacillusthuringiensistoxinspecificitydb（Bt）TFII-Basaltranscriptionfactors（转录子）BloodgroupantigensinSWISS-PROT（血型抗原）BCGD-BreastcancergenesdbfromMBCR（乳癌）BRENDA-Dbofenzymefunctionaldata特定基因或蛋白质的数据库EF-handCaBP-EF-handcalcium-bindingproteinsdbCAZy-Carbohydrate-ActiveenZYmesWebsiteCBSdomain–Cystathionine（胱硫醚,丙氨酸丁氨酸硫醚）BetaSynthasedomainCDantigensinSWISS-PROT-Nomenclatureforsurfaceproteinsofhumanleucocytes(白血球CD)特定基因或蛋白质