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12一、Pubmed简介二、Pubmed使用详解三、Endnote使用介绍目录3Pubmed简介一、发展历史1879年NLM出版的INDEXMEDICUS(IM)。1964年开发MEDLARS(MedicalLiteratureAnalysisandRetrievalSystem,医学文献分析与检索系统)。1971年建成联机数据库MEDLINE(MEDLARSonline)。20世纪80年代,MEDLINE光盘问世。1997年6月26日,MEDLINE的网络版PubMed向Internet用户免费开放。4Pubmed简介IndexMedics(IM)《医学索引》(IndexMedicus,IM)由美国国立医学图书馆(NationalLibraryofMedicine,NLM)编辑出版。NLM的宗旨是搜集覆盖全世界多种语言的医学刊物,为美国和世界的读者服务。《医学索引》创刊于1879年,其刊名、编辑形式及出版机构,几经变更,至1960年才定型为IndexMedicus。5Pubmed简介IndexMedics(IM)IndexMedicus60年代初收录期刊仅1800余种,80年代增至2800余种,90年代上升至3000余种。2004年,IndexMedicus收录约3700种期刊。收录的期刊以生物医学为主,对非生物医学期刊(在引用刊名字顺表中刊名前标有“S”),仅选录其中与生物医学有关的文献。收录内容包括被收录期刊中的各类文献,如原始论文、综述、编辑部社论、著名人物传记、通信及具有实质内容的讣告等。其特点是收集文献种类多,报道速度快。6Pubmed简介MEDLARS1964年NLM建立了MEDLARS(MEDicalLiteratureAnalysisandRetrievalSystem),MEDLARS是计算机化的医学文献分析与检索系统,实现了文献加工、检索与编制的计算机化。报道时差仅2-3个月。7MEDLINE(MedicalLiteratureAnalysisandRetrievalSystemOnline)MEDLINE是IndexMedicus的联机检索版。MEDLINE中增加了500种护理和口腔类刊物,由护理和口腔专业学会负责选择。MEDLINE光盘储存了1949年到现在全部MEDLINE数据库中的内容,其中包括三种重要的索引:《医学索引》(IndexMedicus)、《牙科文献索引》(IndextoDentalLiterature)、《国际护理索引》(InternationalNursingIndex)。8Pubmed简介MEDLINE收录了全世界范围37种语言(包括老期刊,有60种语言)的5200多种期刊的文献。其中大约有90%的文献为英文文献,文献来源以美国为主(47%)。目前MEDLINE的记录数已经超过了1600多万条,覆盖了基础医学、临床医学、护理学、牙科学、兽医学、卫生保健、营养卫生、职业卫生、卫生管理等。数据库不提供全文,79%的文献都带有英文文摘(1975年以前的文献无文摘)。9Pubmed简介PUBMED由美国国立医学图书馆(NLM)所属国家生物技术信息中心(NCBI)建立。PUBMED是NCBI’sEntrezretrievalsystem众多数据库之一。PUBMED目前收录的文献记录超过1900多万篇。PUBMED提供全文链接。10Pubmed简介PUBMED(是NCBI的Entrez系统中的数据库之一)检索入口:NationalCenterforBiotechnologyInformation,NCBI(美国国立生物技术信息中心)NationalLibraryofMedicine,NLM(美国国立医学图书馆)NationalInstitutesofHealth,NIH(美国国立卫生研究院)11Pubmed简介EntrezEntrez是由美国国立生物技术信息中心(NCBI)主持的一个数据库检索系统,它包括PubMed,NucleotideandProteinSequences,ProteinStructures,CompleteGenomes,Taxonomy等等数据库。简介PUBMED收录范围13Pubmed简介MEDLINECitations:是美国国立医学图书馆(NationalLibraryofMedicine,NLM)首要的生物医学文献数据库,MEDLINE最明显的特征就是用MedicalSubjectHeadings(MeSH)作了标引,内容涉及医学学科的各个领域。记录标注为:[PubMed-indexedforMEDLINE]PUBMED收录范围(1)RetardationofarsenictransportthroughaPleistoceneaquifer.vanGeenA,BostickBC,PhamTK,ViML,Nguyen-NgocM,PhuDM,PhamHV,RadloffK,AzizZ,MeyJL,StahlMO,HarveyCF,OatesP,WeinmanB,StengelC,FreiF,KipferR,BergM.Nature.2013Sep12;501(7466):204-7.doi:10.1038/nature12444.PMID:24025840FreePMCArticleSimilararticles14PUBMED收录范围(2)InProcessCitations:没有完成MeSH标引、加入到MEDLINE之前的数据,是一个临时性医学文献数据库。它每天都在不断地接受新数据,可为用户提供基本的文献条目和文摘,其文献条目在标引和加工后向MEDLINE移交。记录标注为:[PubMed-inprocess]Pubmed简介PCorPCV,ThatIstheQuestion:PrimaryAnaplasticOligodendroglialTumorsTreatedwithProcarbazineandCCNUWithandWithoutVincristine.WebreC,ShonkaN,SmithL,LiuD,DEGrootJ.AnticancerRes.2015Oct;35(10):5467-72.PMID:26408710Similararticles15Pubmed简介OLDMEDLINECitations:1948-1965年出版的CumulatedIndexMedicus(CIM)和CurrentListofMedicalLiterature(CLML)两种索引所含有的180万篇文献记录(大多数无摘要)。记录标注为:[PubMed–OLDMEDLINE]从2005年始,文献记录中原来的主题用当前主题词重新匹配,工作完成后,记录标注为:[PubMed–indexedforMEDLINE]PUBMED收录范围(3)Acrodyniafollowingtheuseofbichlorideofmercurydiaperrinse;reportof2cases.McCOYGE.JIndianaStateMedAssoc.1950Nov;43(11):1095-7.Noabstractavailable.PMID:14784580Similararticles16Pubmed简介PUBMED收录范围(4)PublisherSuppliedCitations:出版商直接向PubMed提供电子记录,记录中用[PubMed-assuppliedbypublisher]标记表示。大部分记录会发展为“in-process”状态,稍后成为“indexedforMEDLINE”状态,但是,并不是所有的记录都能被MEDLINE收录。出版商也可能还会提供一些期刊发行前的一些数据,这些记录会被标记为:[Epubaheadofprint]。记录标注为:[PubMed-assuppliedbypublisher]ProtectiveeffectsofForsythiasuspenseextractwithantioxidantandanti-inflammatorypropertiesinamodelofrotenoneinducedneurotoxicity.ZhangS,ShaoSY,SongXY,XiaCY,YangYN,ZhangPC,ChenNH.Neurotoxicology.2015Sep23.pii:S0161-813X(15)00138-2.doi:10.1016/j.neuro.2015.09.009.[Epubaheadofprint]PMID:26408940Similararticles17Pubmed简介PUBMED收录范围(5)出版商提供的一些不可能成为MEDLINECitations的文献。这些文献没有用MeSHTerms标引。这些记录用[PubMed]or[PubMed–assuppliedbypublisher]标注。这些记录在PUBMED中存在,但不是MEDLINECitations。有如下几种类型:18Pubmed简介PUBMED收录范围(5):Non-MeSHIndexedCitationsOut-of-scopearticlesfromselectivelyindexedMEDLINEjournals记录标注为:[PubMed]ArticlesfromissuesofjournalspublishedpriortoselectionforMEDLINEindexing记录标注为:[PubMed–assuppliedbypublisher]ArticlesreportsonresearchfoundedbytheNIH19Pubmed简介PUBMEDRecordProcessing20Pubmed检索以下网页供自主学习:PubmedHelp::新手入门21Pubmed检索基本检索主题词/副主题词检索刊名检索引文检索药物检索临床查询布尔逻辑符Advance查询(检索字段)检索方式22Pubmed检索Pubmed检索主要特点AutomaticTermMapping(词汇自动转换功能)在PubMed主页的检索框中键入检索词,系统将按如下顺序对检索词进行转换后检索:Subjects(usingtheMedicalSubjectHeadings)JournalsAuthors一旦找到匹配项,则停止自动转换功能;如果均未找到匹配项,则将短语或词组拆分后检索,并在AllFields中检索,具体的检索过程可见Searchdetails.23举例:①Pubmed输入acousticmicroscopyglaucoma(声学显微镜青光眼)=acoustic+microscopy+glaucoma系统将进行主题词转换,如下:24举例:②输入CancerResearch(肿瘤研究期刊)注意一定要输入刊名全称=Cancer+Research系统将进行刊名转换,如下:25举例:③输入smithja(人名,格式为名+姓的首字母)=smith+ja系统将进行作者姓名转换,如下:26Pu
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