RNAseq(转录组)数据提交-NCBI-快速入门指南

RNAseq数据提交NCBI快速入门指南官网：一上传前准备工作1申请NCBI账号：点击申请账号登陆已申请的账号点击申请账号注意：新申请的账号需要登录邮箱验证后才能提交用户名密码邮箱验证码点击注册2准备需要上传的原始数据：注意事项：（1）所有样本的原始数据需放在同一目录下（2）原始数据为fastq格式的压缩文件。测序公司提供（3）若为双端测序，需要提供双端的原始数据，即R1端和R2端二提交SRA的主要步骤1进入提交界面：点击选择SRA数据库点击进入2填写提交者信息：开始提交名姓邮箱primary邮箱是申请账号的邮箱，系统自动匹配，可更改，secondary邮箱为可选项*号为必填项学校学院学校所在街道和城市邮编和国家3填写释放日期信息：是否创建新BioProject，选择Yes是否创建新BioSsamples，选择Yes数据立即释放数据释放日期可自定义，最长可延迟4年释放4填写Project信息：老师研究项目的标题老师研究项目的简短描述是否提交过数据到NCBI，有还是没有都选择No该界面中此模块往下都无需填写5选择BioSample类型：样本为细菌，真菌类型样本为动物类型样本为无脊椎动物类型样本为人红色方框内的类型是转录组样品常用的样品类型6填写BioSample属性表：样本为植物类型样本为病毒类型下载TSV格式，填好后点击“选择文件”上传表格，文件只支持tsv和txt格式上传。此网址详细介绍每一列的信息如何填写动物类型属性表（Model.organism.animal.1.0.tsv）植物类型属性表（Plant.1.0.tsv）绿色为必填项蓝色至少选择一项黄色可不填微生物类型属性表（Microbe.1.0.tsv）7填写SRAMetadata信息：下载文件，填好后点击“选择文件”上传表格，此文件为excel格式。注：所有黄色区域是需要下拉选择的，不需打字，其余区域需要手动填写8开始上传原始数据：网页版网页版传输入口双端数据都需要上传Linux版高速传输ascp入口，命令行支持doc和linux使用说明9提交前预览：检查释放日期，提交后不能更改检查67步上传的文件是否还需要更改检查样本个数以及双端是否正确提交，等待审核，大约1-2个工作日即可完成10查看投稿所用SRA号：等待提交开始审核审核完成点击投稿所需SRA号