novaseq中文说明

仅供研究使用。不得用于诊断。文库制备|测序|分析数据|支持要点••可扩展的平台让数据产出、完成时间与结果相匹配，让每个样本的成本符合研究需求••灵活的性能自由设置测序方法、流动槽类型和读长，以便支持最广泛的应用••简化的操作流程简化、手动操作时间缩短提升了实验室效率简介NovaSeq系列测序系统使用Illumina久经考验的新一代测序（NGS）技术，具有突破性的创新，开创了测序新纪元。NovaSeq系列包含两种仪器配置，NovaSeq5000测序系统和NovaSeq6000测序系统，为用户带来前所未有的通量、速度和灵活性，让他们能够比以往更快速更经济地完成项目（图1）。多种类型的流动槽和读长组合让通量能够有效扩展，从而最好地契合研究需求。那些需要大量数据的应用，如人类全基因组测序（WGS）、超深度外显子组测序和肿瘤-正常图谱分析，如今能够更加经济高效地完成。同样一台仪器也能用于那些数据不太密集的方法，如靶向重测序。无论每个项目的规模或目标如何，它们都将受益于简单的即插即用操作、集成的仪器内簇生成，以及数据存储与分析工具的无缝整合，这些简化了整个实验流程。无论是运行单台NGS系统，还是运行一个庞大的组合，NovaSeq系列为各种类型的样本和应用开辟了新的可能。可扩展的平台有了NovaSeq系列，研究人员如今能够比以往更经济地达到最高的通量水平。NovaSeq6000系统在推出时就可以实现更多样本和更高覆盖度的研究。将在2017年晚些时候推出的NovaSeq5000系统*以较低的入门价格带来了强大且高通量的基因组学解决方案。无论项目规模如何，NovaSeq系统都能让用户以最符合其研究目标的规模开展研究。图1：NovaSeq系列系统-将通量、灵活性和易用性组合起来改变测序，满足几乎所有方法、基因组和规模。让数据产出满足项目需求NovaSeq6000系统可在~2天内带来高达6Tb的产出和200亿（B）条reads，而NovaSeq5000系统可在~2.5天内生成高达2Tb的数据和16亿条reads。（表1和2，图2）多种类型的流动槽和读长的组合使得产出和运行时间可以根据项目需求来调整，实现经济且快速的测序，满足广泛的应用。NovaSeqS1和S2流动槽*适用于两种系统，提供快速而强大的测序，适用于大多数高通量应用。与HiSeq®2500†或HiSeq4000的流动槽相比，NovaSeqS1流动槽有更少的reads可供选择，让HiSeq系统的现有用户能够轻松转换，而无需在每次运行中增加样本。NovaSeqS2流动槽则为那些需要更高测序产出的用户提供了更多的reads。NovaSeqS3和S4流动槽*为NovaSeq6000系统所专享，具有高通量，在各个物种和覆盖深度下都能实现经济高效的全基因组测序。使用NovaSeqS3或S4流动槽，让内部开展WGS对更多实验室而言变得更具吸引力，更经济实惠。随着实验室的发展，NovaSeq5000系统可完全升级到NovaSeq6000系统，实现未来的可扩展性。*NovaSeq™系列测序系统对几乎任何基因组、任何测序方法和规模的项目，都有可扩展的通量，灵活简便*NovaSeq5000系统、NovaSeq5000系统升级、适用于S1、S3或S4流动槽的NovaSeqReagentKits目前尚未开放订购。†基于v4（高产出）流动槽的规格，与HiSeq2500系统的reads进行了比较。仅供研究使用。不得用于诊断。文库制备|测序|分析数据|支持NovaSeq6000系统（S4流动槽）NovaSeq6000系统（S3流动槽）NovaSeq5000/6000系统（S2流动槽）HiSeqX系统HiSeq4000系统HiSeq2500系统（v4试剂）NovaSeq5000/6000系统（S1流动槽）HiSeq2500系统（v3试剂）产出（百万reads/流动槽）060008000400020001000012000图2：NovaSeq系列提供了最大的产出范围-NovaSeq系列在单个流动槽模式下可产生167Gb和16亿条reads到3Tb和100亿条reads。需要指出的是在双流动槽模式下运行时，产出可以达到6Tb和200亿条reads。可调节的产出让NovaSeq系列适合广泛的应用。实验室仅凭此单台仪器便可扩展其通量能力。表1：NovaSeq系列的流动槽规格aNovaSeq5000b和6000系统NovaSeq6000系统流动槽类型S1bS2S3bS4b通过过滤的reads数量多达16亿28-33亿多达66亿多达100亿产出2x50bp高达167Gb280-333GbN/AcN/Ac2x100bp高达333Gb560-667GbN/AcN/Ac2x150bp高达500Gb850-1000Gb高达2000Gb高达3000Gba.所有产出和read数量规格都基于单个流动槽计算。NovaSeq5000和6000系统可同时运行1个或2个流动槽。规格是基于支持的簇密度下的IlluminaPhiX对照文库所计算。b.NovaSeq5000系统和适用于S1、S3或S4流动槽的NovaSeqReagentKits尚未推出，因此性能参数有可能更改。c.N/A：不适用。表2：NovaSeq6000系统上S2双流动槽运行的性能规格读长质量分数（Q30）运行时间2x50bp≥85%≤19小时2x100bp≥80%≤29小时2x150bp≥75%≤40小时质量分数是基于NovaSeqS2ReagentKits在NovaSeq6000系统上的运行所计算的，利用了IlluminaPhiX对照文库。根据文库类型和质量、插入片段大小、上样浓度及其他实验因素的不同，性能可能有所差异。此处显示的性能指标只适用于NovaSeq6000系统；NovaSeq5000系统的运行时间可能略长。灵活的性能NovaSeq5000和NovaSeq6000系统在测序选择上提供了极大的灵活性，支持各种应用下的研究探索。用户可以混搭4种类型的流动槽（S1、S2、S3或S4*），每次运行1个或2个流动槽，并从多个读长中选择，从而轻松调整每个测序运行的产出。这两款系统与Illumina的文库制备试剂盒兼容，支持表达谱分析、WGS及其他各种方法（表3）。如今，用户可随时随地开展他们需要的运行。简化的操作NovaSeq5000和NovaSeq6000系统通过创新的用户设计功能、简化的流程和简短的手动操作时间来提高实验室的效率。其先进的功能包括（图3）：•与HiSeq系列系统相比，即插即用的试剂卡盒使得耗材量减少了80%•带有RFID条码的耗材实现了自动的试剂追踪，确保了所有测序试剂和流动槽的兼容性•自动化的流动槽上样和仪器集成的簇生成最大限度减少了手动操作时间以及手动操作的可变性即插即用的试剂在每个流动槽运行中，NovaSeq系列用1个预装有边合成边测序（SBS）试剂的卡盒和1个簇生成试剂卡盒取代了各种瓶瓶罐罐。这些卡盒只需要解冻，无需其他准备，用户也不用干预，最大限度减少了失误，也大大缩短了运行的设置时间。总之，NovaSeq5000或NovaSeq6000系统的运行设置只需要几分钟。仅供研究使用。不得用于诊断。文库制备|测序|分析数据|支持表3：与各种应用兼容的文库制备试剂盒示例全基因组测序TruSeq®NanoDNALibraryPrepKitaTruSeqDNAPCR-FreeDNALibraryPrepKitbNextera®MatePairLibraryPrepKit靶向重测序TruSeqExomeLibraryPrepKitTruSeqRapidExomeLibraryPrepKitc转录组测序TruSeqStrandedTotalRNALibraryPrepKitaTruSeqStrandedmRNALibraryPrepKitaTruSeqRNAAccessLibraryPrepKita表中列出的文库制备试剂盒是与NovaSeq系列兼容的试剂盒示例。关于Illumina文库制备试剂盒的完整列表，请访问。a.IlluminaQualified方法，获得Beckman、Eppendorf、Hamilton、PerkinElmer和Tecan液体处理系统的支持。b.IlluminaQualified方法，获得Beckman、Eppendorf、PerkinElmer和Tecan液体处理系统的支持。c.IlluminaQualified方法，获得Eppendorf液体处理系统的支持。仪器集成的簇生成NovaSeq5000和NovaSeq6000系统特有全自动的仪器集成簇生成，大大缩短了手动操作时间。制备出的文库可直接上样到放置在试剂卡盒中的样本管内，并直接上样到系统中，实现全自动的簇生成。无缝整合NovaSeq系列是综合测序和信息学生态系统中的组成部分，这个系统包括自动化的流程管理和BaseSpace®Clarity实验室信息管理系统（LIMS）。在NovaSeq5000或NovaSeq6000系统上生成的数据可直接汇入BaseSpaceSequenceHub，进行即时的分析和解读。前沿的技术NovaSeq系列代表了Illumina迄今为止最强大、简约、可扩展且可靠的高通量测序平台，让数据质量无懈可击。这些系统的核心是久经考验的IlluminaSBS技术。目前世界上90%以上的测序数据是利用Illumina的SBS技术产生的‡。这种基于可逆终止子的专利方法实现了数十亿个DNA片段的大规模并行测序，在单个碱基掺入不断增长的DNA链时检测它们。这种方法明显减少了因为核苷酸链重复（均聚物）而产生的错误和检出丢失。‡根据Illumina公司2015年的存档数据计算。ABCD图3：NovaSeq系列操作简单易懂-NovaSeq系列的许多功能旨在简化基因组研究，包括A.直观的触摸屏界面，B.发光的LED显示流动槽状态，C.嵌入式的卡盒包含即插即用的试剂，D.废液缸可轻松取出进行处理。巧妙的设计NovaSeq系列将最新的高性能成像与Illumina新一代的流动槽技术结合在一起，使得运行通量大幅提高。NovaSeq系列出色的光学元件能以高分辨率进行高速扫描，与HiSeqX®系统相比明显提升。这种更快的扫描速度让NovaSeq5000和NovaSeq6000系统成为Illumina迄今为止通量最高的平台。NovaSeq系列使用了在HiSeqX系统上首次采用的图案化流动槽，且密度更高。每个流动槽包含数十亿个固定位置的纳米孔，这种设计使得簇间隔均匀、特征大小均一，从而带来极高的簇密度。经过重新设计的NovaSeq流动槽进一步缩小了纳米孔之间的间隔，大大提高了簇密度和数据产出。将这种簇密度的提高与专利的排除扩增成簇方法相结合，使得来源于单个DNA模板的DNA簇所占据的纳米孔数量最大化。其结果是数据产出的提升。仅供研究使用。不得用于诊断。文库制备|测序|分析数据|支持制备文库测序分析数据高通量自动化管理流程BaseSpaceClarityLIMS高通量和低通量的选择BaseSpaceSequenceHub解读数据BaseSpaceVariantInterpreter(Beta),BaseSpaceCohortAnalyzer图4：NovaSeq系列是综合测序生态系统的一部分-NovaSeq系列与BaseSpaceClarityLIMS、Illumina的文库制备试剂盒组合、IlluminaQualified方法支持以及BaseSpaceSequenceHub兼容，通过单个统一的流程简化了测序操作。综合的测序生态系统NovaSeq系列是综合测序生态系统的基石，这个系统包括流程管理、手动或自动的文库制备、测序、数据分析和解读，以及服务和支持（图4）。LIMS：从制备好的样本到分析信息管理NovaSeq系列在开箱后即与BaseSpaceClarityLIMS完全兼容。通过使用LIMS，实验室可凭借全面的样本和试剂追踪、自动化的流程和整合的仪器操作来提高