DS_CDOCKER_V2.5.5

单击此处编辑母版标题样式单击此处编辑母版副标题样式Copyright©2010,NeotridentTechnologyLtd.Allrightsreserved.DSCDOCKER培训资料DiscoveryStudio中文培训资料Version2010Copyright©2010,NeotridentTechnologyLtd.Allrightsreserved.单击此处编辑母版标题样式单击此处编辑母版文本样式第二级第三级第四级第五级Copyright©2010,NeotridentTechnologyLtd.Allrightsreserved.DSCDOCKER培训讲义单击此处编辑母版标题样式单击此处编辑母版副标题样式Copyright©2010,NeotridentTechnologyLtd.Allrightsreserved.培训内容•DS中的分子对接简介•DSCDOCKER概述•DSCDOCKER原理简介•DSCDOCKER参数设置技巧•DSCDOCKER应用实例•DSCDOCKERhands-on练习•Q&A单击此处编辑母版标题样式单击此处编辑母版副标题样式Copyright©2010,NeotridentTechnologyLtd.Allrightsreserved.培训内容•DS中的分子对接简介•DSCDOCKER概述•DSCDOCKER原理简介•DSCDOCKER参数设置技巧•DSCDOCKER应用实例•DSCDOCKERhands-on练习•Q&A单击此处编辑母版标题样式单击此处编辑母版副标题样式Copyright©2010,NeotridentTechnologyLtd.Allrightsreserved.分子对接根据几何匹配和能量匹配，寻找两个分子之间的最佳匹配（相互作用）模式。单击此处编辑母版标题样式单击此处编辑母版副标题样式Copyright©2010,NeotridentTechnologyLtd.Allrightsreserved.应用单击此处编辑母版标题样式单击此处编辑母版副标题样式Copyright©2010,NeotridentTechnologyLtd.Allrightsreserved.生物大分子-小分子相互作用的理论锁-钥匙模型诱导契合模型受体、配体均为刚性受体刚性，配体柔性受体，配体均为柔性刚性对接柔性对接半柔性对接配体构象集受体、配体构象集或利用力学优化实现柔性分子对接分类单击此处编辑母版标题样式单击此处编辑母版副标题样式Copyright©2010,NeotridentTechnologyLtd.Allrightsreserved.分子对接的技术内幕分子对接核心步骤1.搜索配体与受体的可能结合模式•配体的可能构象•配体在活性位点的可能取向2.对配体与受体的结合模式进行打分•经验打分函数•能量打分函数•一致性打分（ConsensusScore）分子对接要解决的问题•更可靠有效的搜索算法•更准确的打分函数单击此处编辑母版标题样式单击此处编辑母版副标题样式Copyright©2010,NeotridentTechnologyLtd.Allrightsreserved.DS中关于分子对接的方案单击此处编辑母版标题样式单击此处编辑母版副标题样式Copyright©2010,NeotridentTechnologyLtd.Allrightsreserved.培训内容•DS中的分子对接简介•DSCDOCKER概述•DSCDOCKER原理简介•DSCDOCKER参数设置技巧•DSCDOCKER应用实例•DSCDOCKERhands-on练习•Q&A单击此处编辑母版标题样式单击此处编辑母版副标题样式Copyright©2010,NeotridentTechnologyLtd.Allrightsreserved.DS分子对接算法分类生物大分子-小分子相互作用的理论锁-钥匙模型诱导契合模型刚性对接柔性对接半柔性对接单击此处编辑母版标题样式单击此处编辑母版副标题样式Copyright©2010,NeotridentTechnologyLtd.Allrightsreserved.CDOCKER——强大的分子对接算法•基于格点的分子对接方法•采用高温动力学产生配体的多构象，bindingpose采用模拟退火进行优化•计算受体-配体的相互作用能及配体的张力单击此处编辑母版标题样式单击此处编辑母版副标题样式Copyright©2010,NeotridentTechnologyLtd.Allrightsreserved.培训内容•DS中的分子对接简介•DSCDOCKER概述•DSCDOCKER原理简介•DSCDOCKER参数设置技巧•DSCDOCKER应用实例•DSCDOCKERhands-on练习•Q&A单击此处编辑母版标题样式单击此处编辑母版副标题样式Copyright©2010,NeotridentTechnologyLtd.Allrightsreserved.基于格点技术计算非键作用单击此处编辑母版标题样式单击此处编辑母版副标题样式Copyright©2010,NeotridentTechnologyLtd.Allrightsreserved.培训内容•DS中的分子对接简介•DSCDOCKER概述•DSCDOCKER原理简介•DSCDOCKER参数设置技巧•DSCDOCKER应用实例•DSCDOCKERhands-on练习•Q&A单击此处编辑母版标题样式单击此处编辑母版副标题样式Copyright©2010,NeotridentTechnologyLtd.Allrightsreserved.是否考虑静电相互作用超过最大值后，停止搜索构象能量阈值参数设置一单击此处编辑母版标题样式单击此处编辑母版副标题样式Copyright©2010,NeotridentTechnologyLtd.Allrightsreserved.优化力场是否采用格点计算非键作用（对接用）电荷分配方法参数设置二是否采用格点计算非键作用（计算相互作用能）单击此处编辑母版标题样式单击此处编辑母版副标题样式Copyright©2010,NeotridentTechnologyLtd.Allrightsreserved.培训内容•DS中的分子对接简介•DSCDOCKER概述•DSCDOCKER原理简介•DSCDOCKER参数设置技巧•DSCDOCKER应用实例•DSCDOCKERhands-on练习•Q&A单击此处编辑母版标题样式单击此处编辑母版副标题样式Copyright©2010,NeotridentTechnologyLtd.Allrightsreserved.应用实例——脱氢酶与底物及辅酶的结合作用（一）单击此处编辑母版标题样式单击此处编辑母版副标题样式Copyright©2010,NeotridentTechnologyLtd.Allrightsreserved.应用实例——脱氢酶与底物及辅酶的结合作用（二）单击此处编辑母版标题样式单击此处编辑母版副标题样式Copyright©2010,NeotridentTechnologyLtd.Allrightsreserved.应用实例——脱氢酶与底物及辅酶的结合作用（三）构建脱氢酶同源模型单击此处编辑母版标题样式单击此处编辑母版副标题样式Copyright©2010,NeotridentTechnologyLtd.Allrightsreserved.应用实例——脱氢酶与底物及辅酶的结合作用（四）分子对接研究底物、辅酶、Zn离子与受体的结合——结合位点单击此处编辑母版标题样式单击此处编辑母版副标题样式Copyright©2010,NeotridentTechnologyLtd.Allrightsreserved.应用实例——脱氢酶与底物及辅酶的结合作用（五）分子对接研究底物、辅酶、Zn离子与受体的结合——结合模式底物（L-阿拉伯糖醇）、Zn离子结合辅酶NAD+结合单击此处编辑母版标题样式单击此处编辑母版副标题样式Copyright©2010,NeotridentTechnologyLtd.Allrightsreserved.应用实例——脱氢酶与底物及辅酶的结合作用（六）分子对接研究底物、辅酶、Zn离子与受体的结合——结合模式（2D图）底物（L-阿拉伯糖醇）、Zn离子结合辅酶NAD+结合单击此处编辑母版标题样式单击此处编辑母版副标题样式Copyright©2010,NeotridentTechnologyLtd.Allrightsreserved.培训内容•DS中的分子对接简介•DSCDOCKER概述•DSCDOCKER原理简介•DSCDOCKER参数设置技巧•DSCDOCKER应用实例•DSCDOCKERhands-on练习•Q&A单击此处编辑母版标题样式单击此处编辑母版副标题样式Copyright©2010,NeotridentTechnologyLtd.Allrightsreserved.DSCDOCKER练习请翻看相关word文档操作手册单击此处编辑母版标题样式单击此处编辑母版副标题样式Copyright©2010,NeotridentTechnologyLtd.Allrightsreserved.帮助文档在线帮助文档从原理到操作再到参考文献一应俱全单击此处编辑母版标题样式单击此处编辑母版副标题样式Copyright©2010,NeotridentTechnologyLtd.Allrightsreserved.我们的技术支持帐号[e-mail]单击此处编辑母版标题样式单击此处编辑母版副标题样式Copyright©2010,NeotridentTechnologyLtd.Allrightsreserved.关注我们的网站©2010,NeotridentTechnologyLtd.Allrightsreserved.其他问题？单击此处编辑母版标题样式单击此处编辑母版文本样式第二级第三级第四级第五级Copyright©2010,NeotridentTechnologyLtd.Allrightsreserved.ENDDSCDOCKER