临床微生物学检验第五版第6章细菌的分类与命名

第6章细菌的分类与命名概述细菌分类学（Bacterialtaxonomy）是微生物分类学的一个分支，是对细菌进行分类（classification）鉴定（identification）、命名（nomenclature）的一门科学1.分类分类的任务是通过收集大量的个体资料，经过科学的归纳、整理，使之形成一个完整的分类系统。基本概念分类理论和方法：（1）表型与系统进化学分类(pheneticandphylogeneticclassifications)理论：在表型与系统进化学分类理论中，表型分类突出菌株间的相互联系，不包含菌株间的进化关系及与祖细胞的联系，系统进化分类则突出菌株与祖细胞的关系。表型与系统进化学分类理论具有方法稳定、客观、可预见性，且适用于所有细菌的特点，在分类实践中，将表型与系统进化学分类的优点相结合的分类方法也称为多相分类学（polyphasictaxonomy）。分类理论和方法：（2）分类方法：基因分型方法，如DNA杂交法、rRNA寡核苷酸分析和鸟嘌呤加胞嘧啶碱基比例的测定；表型分类法，如传统分类法数值分类法及自动细菌鉴定法等；化学分类学法等。分类等级：界（Kingdom）门（Division）纲（class）目（Order）科（Family）属（Genus）种（Species）《伯杰鉴定细菌学手册》（第2版伯杰系统细菌学手册(Bergey’sManualofSystematicBacteriology)，本版包括五册，共30篇，主要根据细菌的rRNA、DNA及蛋白质序列进行分类：第一册为古细菌、蓝绿藻菌、光合作用菌和具分支菌属。第二册为变形菌门（Proteobacteria）。第三册为GC比低的革兰阳性菌。第四册为GC比高的革兰阳性菌。第五册为浮霉菌门（Planctomycetes）、螺旋体门（Spirochaetes）、纤维杆菌门（Fibrobacters）、拟杆菌属（Bacteroides）、梭杆菌门（Fusobacteria）。2.命名在分类基础上，给予每种细菌一个科学名称，使之在生产实践、临床实践和科学研究工作中相互交流成为可能。按照细菌命名的法规，能保证所有的科研工作者以同样方式给予细菌命名。命名法细菌科学名称（学名）的命名法采用生物双名法（binominalnomenclature）。具备拉丁化文字的形式和明确的分类等级两个特点，即由一个属名和一个种名构成。细菌学名的中文译名：种名在前，属名在后。如：Mycobecteriumtuberculosis（结核分枝杆菌）Salmonellatyphi（沙寒沙门菌）细菌鉴定（1）定义：将未知细菌按分类原则放入系统中某一适当位置和已知细菌比较其相似性，用对比分析方法确定细菌的分类地位。若与已知细菌相同即采用已知菌的名称，不同者则按命名原则确定一个新名称。（2）方法：传统鉴定方法和自动鉴定系统