(整理)R软件画图常用函数及参数.

精品文档精品文档R的基本画图函数非常容易学，看上去也很普通。然而适当的参数设置，有意义的颜色设置，不同基本图间的互相组合，会使你的图更漂亮也更有力的表达数据。下面介绍一些R基本包里画图函数的参数：hist()：breaks设置每个柱的间距；freq柱图表示count或frequency；polt设置是否画图；density和angle可以设置柱上的斜线；axes设置是否需要画坐标轴；cor设置柱图的颜色；border设置柱图边界的颜色；xlim设置横轴范围；ylim设置纵轴范围。R的许多函数都有类似的参数名，这些函数往往有同样的功能。因此后面就只介绍比较特殊的参数。layout()：mat用矩阵设置窗口的划分，矩阵的0元素表示该位置不画图，非0元素必须包括从1开始的连续的整数值，比如：1……N，按非0元素的大小设置图形的顺序。widths用来设置窗口不同列的宽度，heights设置不同行的高度。par()的mfcol,和mfrow参数也有类似layout的功能，不过相对layout就逊色多了。par()：mar设置图离四个边缘的距离；bg设置背景颜色；xaxt和yaxt设置坐标轴标签的类型（=”n”表示不画轴标签）；xlim和ylim设置坐标轴的范围。axis()：las设置坐标轴标签的方式（水平，垂直……）。mtext()：为四个坐标轴添加标签。精品文档精品文档text()：在给定坐标的位置写字。lines()：lty设置线的类型；lwd设置线的宽度。points()：pch设置点的类型。plot()：最简单的画图函数。type设置画图的类型（type=”n”表示不画数据）；axes设置是否画坐标轴。常用的参数还有：xlim和ylim，xaxt和yaxt。barplot()：space设置bar图间的间距；horiz设置bar的方向是垂直或水平；beside设置height为矩阵时，每列元素的bar排列方式；add设置是否将barplot加在当前已有的图上。legend()：除了利用x,y设置图例的坐标外，用”topleft”，center，bottomright等设置位置非常方便。ncol设置图例的列数,horiz设置图例的排列方向。常有的参数还有col，lty，pch。heatmap()：Rowv和Colv设置是否需要按行或列聚类；scale设置是否需要按行或列标准化；na.rm设置是否移去NA；RowSideColors和ColSideColors可以在行或列边缘添加颜色；keep.dendro设置是否画聚类树。dendrogram()：'nodePar'和'edgePar'都是list，可以方便的设置节点和边的各种属性，如：颜色，样式，宽度，标签……。在初学一个函数的时候，可能不知道函数有哪些参数，尤其是R中用...省略的参数。这时候看看“SeeAlso:”里面提供的相关函数时非常有用的，R函数多是继承其它的更一半的函数，精品文档精品文档所以参数也会继承，理解了这一点，就能灵活应用..省略的参数了。另一方面，一些函数返回的对象的类是比较复杂的，有多个属性（一般会在“Value”里面说明这些对象的属性）。但有些函数的帮助里没有“Value”栏，幸运的是R中的一些函数提供了对各种类通用的处理，通过这些函数你可以大概了解一个对象所有的属性。如：summary()总结对象的基本特征；attributes()列出对象的所有属性；attr()给出对象的指定属性的值；labels()列出对象的标签；str()展示对象的结构……。学会使用这些函数和参数能让你的图更好看，但是理解R的函数结构和参数意义，会更有意义。正所谓，受之与鱼不如受之与渔。3.1par()函数的参数详解函数par()可以用来设置或者获取图形参数，par()本身（括号中不写任何参数）返回当前的图形参数设置（一个list）；若要设置图形参数，则可用par(tag=value)的形式，其中tag的详细说明参见下面的列表，value就是参数值，例如：1#设置边距参数和背景色2par(mar=c(4,4,1,0.5),bg=yellow)目前par()函数涉及到的图形参数大约有70个，这里只是选取其中40多个常用且较易理解的参数进行解释说明如下列表，其它参数请参阅R帮助?par。adj调整图中字符的相对位置；取值：长度为2的数值向量，分别表示字符精品文档精品文档边界矩形框的左下角相对坐标点(x,y)位置的调整，向量的两个数值一般都在[0;1]范围中（有些图形设备中也可以超出此范围），表示字符串以左下角为基准、根据自身的宽度和高度分别向左和向下移动的比例，默认为c(0.5,0.5)。例如c(0,0)表示整个字符（串）的左下角对准设定的坐标点，而c(1,0)则表示字符串横向移动了自身宽度的距离，而纵向不受影响。具体示例参见图3.1左上图ask切换到下一个新的作图设备（通常是作一幅新图）时是否需要用户输入（敲回车键或点鼠标）；TRUE表示是；FALSE表示否。当有多幅图将逐一出现而需要按顺序一步步在图形设备上展示时很有用，这种情况下若设置ask为TRUE，那么作图时每一副新图的出现都要先等待用户输入，否则所有的图将会一闪而过bg设置图形背景色；关于颜色值的设置请参见4.1节bty设置图形边框样式；取值为字符o,l,7,c,u,]之一；这些字符本身的形状对应着边框样式，比如（默认值）o表示四条边都显示，而c表示不显示右侧边，参见图3.2四幅图的边框样式cex图上元素（文本和符号等）的缩放倍数；取值为一个相对于1的数值（默认为1）。具体的细节缩放可以通过如下参数设置（默认值均为1）：cex.axis坐标轴刻度标记的缩放倍数3.1PAR()函数的参数详解25cex.lab坐标轴标题的缩放倍数精品文档精品文档cex.main图主标题的缩放倍数cex.sub图副标题的缩放倍数col图中符号（点、线等）的颜色；取值参见4.1节。与cex参数类似，具体的细节颜色也可以通过如下参数设置：col.axis坐标轴刻度标记的颜色col.lab坐标轴标题的颜色col.main图主标题的颜色col.sub图副标题的颜色family设置文本的字体族（衬线、无衬线、等宽、符号字体等）；标准取值有：serif,sans,mono,symbol，参见图3.2坐标(2,8)处的文本；family='symbol'的情况没有显示出来fg设置前景色（若后面没有指定别的颜色设置，本参数会影响几乎所有的后续图形元素颜色，若后续图形元素有指定的颜色设置，那么只是影响图形边框和坐标轴刻度线的颜色）；颜色值参见4.1节。font设置文本字体样式；取值为一个整数；通常1、2、3、4分别表示正常、粗体、斜体和粗斜体1，4.6节有进一步的介绍，参见图3.2的图主标题字体font.axis坐标轴刻度标签的字体样式font.lab坐标轴标题的字体样式font.main图主标题的字体样式font.sub图副标题的字体样式精品文档精品文档lab设置坐标轴刻度数目（R会尽量自动“取整”2）；取值形式c(x,y,len)：x和y分别设置两轴的刻度数目，len目前在R中尚未生效，因此设置任意值都不会有影响（但用到lab参数时必须写上这个参数）1对于添加文本，text()函数及其vfont参数可以设置更为详细的字体族和字体样式；参见这两个演示：demo(Hershey)和demo(Japanese)，前者演示Hershey向量字体，后者演示日语的表示。2尽量向0.5、1或10的幂次靠近26第三章细节las坐标轴标签样式；取0、1、2、3四个整数之一，分别表示“总是平行于坐标轴”、“总是水平”、“总是垂直于坐标轴”和“总是竖直”。仔细观察图3.2中四幅图的不同坐标轴标签方向lend线条末端的样式（圆或方形）；取值为整数0、1、2之一（或相应的字符串'round','mitre','bevel'），注意后两者的细微区别3lheight图中文本行高；取值为一个倍数，默认为1ljoin线条相交处的样式；取值为整数0、1、2之一（或相应的字符串'round','mitre','bevel'），分别表示画圆角、画方角和切掉顶角，观察图3.1的三个直角的顶点lty线条虚实样式：0)不画线，1)实线，2)虚线，3)点线，4)点划线，5)长划线，6)点长划线；或者相应设置如下字符串（分别对应前面的数字）：'blank','solid','dashed','dotted','dot-dash','longdash','twodash'；还可以用由十六进制的数字组成的字符串表示线上实线和空白的相应长度，如'F624'，详细解释精品文档精品文档请参见4.3一节。lwd线条宽度；默认为1mar设置图形边界空白宽度；按照“下、左、上、右”的顺序，默认为c(5,4,4,2)+0.1mex设置坐标轴的边界宽度缩放倍数；默认为1，本参数会影响到mgp参数mfrow,mfcol设置一页多图；取值形式c(nrow,ncol)长度为2的向量，分别设置行数和列数，参见附录B.2mgp设置坐标轴的边界宽度；取值长度为3的数值向量，分别表示坐标轴标题、坐标轴刻度线标签和坐标轴线的边界宽度（受mex的影响），默认为c(3,1,0)，意思是坐标轴标题、坐标轴刻度线标签和坐标轴线离作图区域的距离分别为3、1、0；参见图3.1右上方小图oma设置外边界（OuterMargin）宽度；类似mar，默认为c(0,0,0,0)，当一页上只放一张图时，该参数与mar不好区分，但在一页多图的情况下就容易可以看出与mar的区别3仔细观察图3.2中宽线条中黑点的位置，在画线时，这些线条的起点和终点（分别用图中的两个黑点表示）都是选择同样的坐标位置！pch点的符号；pch=19)实圆点、pch=20)小实圆点、pch=21)圆圈、pch=22)正方形、pch=23)菱形、pch=24)正三角尖、pch=25)倒三角尖，其中，21-25可以填充颜色（用bg参数）pty设置作图区域的形状；默认为'm'：尽可能最大化作图区域；精品文档精品文档另外一种取值's'表示设置作图区域为正方形srt字符串的旋转角度；取一个角度数值，参见图3.1左下方小图中分别旋转30_和120_的字符串tck坐标轴刻度线的高度；取值为与图形宽高的比例值（0到1之间）；正值表示向内画刻度线，负值表示向外；默认为不使用它（设为NA}），而使用tcl参数tcl坐标轴刻度线的高度；取一个与文本行高的比例值；正负值意义类似tck，默认值为-0.5，即向外画线，高度为半行文本高；观察图3.1左下角小图的坐标轴刻度线usr作图区域的范围限制，取值长度为4的数值向量c(x1,x2,y1,y2)，分别表示作图区域内x轴的左右极限和y轴的下上极限；注意，若坐标取了对数（参见xlog,ylog两个参数），那么实际上设置的极限都是10的相应幂次xaxs,yaxs坐标轴范围的计算方式；默认'r'：先把原始数据的范围向外扩大4%，然后用这个范围画坐标轴；另外一种取值'i'表示直接使用原始数据范围；实际上还有其它的坐标轴范围计算方式，但是鉴于它们目前在R中都尚未生效，所以暂不加介绍xaxt,yaxt坐标轴样式；默认's'为标准样式；另外一种取值'n'意思是不画坐标轴xlog,ylog坐标是否取对数；默认FALSExpd对超出边界的图形的处理方式；取值FALSE：把图形限制在作图区域内，出界的图形截去；取值TRUE：把图形限制在图形精品文档精品文档区域内，出界的图形截去；取值NA：把图形限制在设备区域内。下面列表中的九组参数只能通过par()函数调用4，而在其它作图函数中不可设置（否则会导致错误或者被忽略）：•ask•fig,fin•lheight•mai,mar,mex,mfcol,mfrow,mfg•new•oma,omd,omi•pin,plt,ps,pty•usr•xlog,ylog3.2plot()及相关函数的参数说明R中最普通的作图函数就是plot()